Protein–RNA interactions for Protein: Q12406

ARP7, Actin-related protein 7, yeastyeast

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARP7Q12406 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.29■■□□□ 1
ARP7Q12406 NSR1YGR159C 1245 nt21.11■□□□□ 0.97
ARP7Q12406 NOP1YDL014W 984 nt20.77■□□□□ 0.92
ARP7Q12406 YKL036CYKL036C 393 nt19.25■□□□□ 0.67
ARP7Q12406 MDJ1YFL016C 1536 nt18.59■□□□□ 0.57
ARP7Q12406 Q0297Q0297 156 nt18.23■□□□□ 0.51
ARP7Q12406 SRX1YKL086W 384 nt18.15■□□□□ 0.5
ARP7Q12406 YJL027CYJL027C 417 nt17.98■□□□□ 0.47
ARP7Q12406 SCS3YGL126W 1143 nt17.56■□□□□ 0.4
ARP7Q12406 YCR051WYCR051W 669 nt17.2■□□□□ 0.34
ARP7Q12406 YOL085CYOL085C 342 nt16.67■□□□□ 0.26
ARP7Q12406 DBP2YNL112W 1641 nt16.52■□□□□ 0.23
ARP7Q12406 PKP1YIL042C 1185 nt16.37■□□□□ 0.21
ARP7Q12406 RPP1BYDL130W 321 nt16.34■□□□□ 0.21
ARP7Q12406 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.33■□□□□ 0.2
ARP7Q12406 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.33■□□□□ 0.2
ARP7Q12406 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.33■□□□□ 0.2
ARP7Q12406 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.33■□□□□ 0.2
ARP7Q12406 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.33■□□□□ 0.2
ARP7Q12406 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.33■□□□□ 0.2
ARP7Q12406 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.33■□□□□ 0.2
ARP7Q12406 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.33■□□□□ 0.2
ARP7Q12406 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.33■□□□□ 0.2
ARP7Q12406 CCC1YLR220W 969 nt16.16■□□□□ 0.18
ARP7Q12406 YBR190WYBR190W 312 nt15.87■□□□□ 0.13
ARP7Q12406 ATS1YAL020C 1002 nt15.75■□□□□ 0.11
ARP7Q12406 SCJ1YMR214W 1134 nt15.72■□□□□ 0.11
ARP7Q12406 PET122YER153C 765 nt15.58■□□□□ 0.08
ARP7Q12406 RVS167YDR388W 1449 nt15.57■□□□□ 0.08
ARP7Q12406 RTC3YHR087W 336 nt15.5■□□□□ 0.07
ARP7Q12406 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.49■□□□□ 0.07
ARP7Q12406 SCR1SCR1 522 nt15.47■□□□□ 0.07
ARP7Q12406 RRN5YLR141W 1092 nt15.15■□□□□ 0.02
ARP7Q12406 SHR5YOL110W 714 nt15.05■□□□□ -0
ARP7Q12406 YDJ1YNL064C 1230 nt15□□□□□ -0.01
ARP7Q12406 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.86□□□□□ -0.03
ARP7Q12406 RSB1YOR049C 1065 nt14.86□□□□□ -0.03
ARP7Q12406 GAR1YHR089C 618 nt14.62□□□□□ -0.07
ARP7Q12406 PST2YDR032C 597 nt14.58□□□□□ -0.08
ARP7Q12406 DEP1YAL013W 1218 nt14.56□□□□□ -0.08
ARP7Q12406 URN1YPR152C 1398 nt14.55□□□□□ -0.08
ARP7Q12406 RPN10YHR200W 807 nt14.38□□□□□ -0.11
ARP7Q12406 YNL208WYNL208W 600 nt14.37□□□□□ -0.11
ARP7Q12406 OPI9YLR338W 858 nt14.34□□□□□ -0.11
ARP7Q12406 PUT4YOR348C 1884 nt14.31□□□□□ -0.12
ARP7Q12406 SAH1YER043C 1350 nt14.2□□□□□ -0.14
ARP7Q12406 TIR1YER011W 765 nt14.14□□□□□ -0.15
ARP7Q12406 ARE1YCR048W 1833 nt14.09□□□□□ -0.15
ARP7Q12406 YKL097CYKL097C 411 nt14.03□□□□□ -0.16
ARP7Q12406 SSA1YAL005C 1929 nt13.94□□□□□ -0.18
ARP7Q12406 SHU1YHL006C 453 nt13.94□□□□□ -0.18
ARP7Q12406 PUN1YLR414C 792 nt13.92□□□□□ -0.18
ARP7Q12406 YJR018WYJR018W 363 nt13.9□□□□□ -0.18
ARP7Q12406 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.89□□□□□ -0.19
ARP7Q12406 POA1YBR022W 534 nt13.87□□□□□ -0.19
ARP7Q12406 SSA3YBL075C 1950 nt13.76□□□□□ -0.21
ARP7Q12406 PTC2YER089C 1395 nt13.72□□□□□ -0.21
ARP7Q12406 SRB2YHR041C 633 nt13.71□□□□□ -0.21
ARP7Q12406 YJR120WYJR120W 351 nt13.69□□□□□ -0.22
ARP7Q12406 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.68□□□□□ -0.22
ARP7Q12406 RPP2BYDR382W 333 nt13.65□□□□□ -0.22
ARP7Q12406 BUD23YCR047C 828 nt13.58□□□□□ -0.24
ARP7Q12406 BSC6YOL137W 1494 nt13.55□□□□□ -0.24
ARP7Q12406 NAB2YGL122C 1578 nt13.54□□□□□ -0.24
ARP7Q12406 WWM1YFL010C 636 nt13.53□□□□□ -0.24
ARP7Q12406 YGR021WYGR021W 873 nt13.5□□□□□ -0.25
ARP7Q12406 YOR139CYOR139C 393 nt13.46□□□□□ -0.25
ARP7Q12406 HOM6YJR139C 1080 nt13.44□□□□□ -0.26
ARP7Q12406 INM2YDR287W 879 nt13.41□□□□□ -0.26
ARP7Q12406 BDH2YAL061W 1254 nt13.4□□□□□ -0.26
ARP7Q12406 DAL1YIR027C 1383 nt13.38□□□□□ -0.27
ARP7Q12406 MNP1YGL068W 585 nt13.36□□□□□ -0.27
ARP7Q12406 FIS1YIL065C 468 nt13.34□□□□□ -0.27
ARP7Q12406 NPL3YDR432W 1245 nt13.32□□□□□ -0.28
ARP7Q12406 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.32□□□□□ -0.28
ARP7Q12406 FPR4YLR449W 1179 nt13.32□□□□□ -0.28
ARP7Q12406 Q0182Q0182 405 nt13.29□□□□□ -0.28
ARP7Q12406 LSM3YLR438C-A 270 nt13.27□□□□□ -0.29
ARP7Q12406 YBL100CYBL100C 315 nt13.27□□□□□ -0.29
ARP7Q12406 PHO4YFR034C 939 nt13.24□□□□□ -0.29
ARP7Q12406 RKM5YLR137W 1104 nt13.24□□□□□ -0.29
ARP7Q12406 YOL037CYOL037C 354 nt13.22□□□□□ -0.29
ARP7Q12406 TRM9YML014W 840 nt13.14□□□□□ -0.31
ARP7Q12406 FUN26YAL022C 1554 nt13.12□□□□□ -0.31
ARP7Q12406 CCT6YDR188W 1641 nt12.99□□□□□ -0.33
ARP7Q12406 YPS1YLR120C 1710 nt12.96□□□□□ -0.34
ARP7Q12406 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.94□□□□□ -0.34
ARP7Q12406 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.94□□□□□ -0.34
ARP7Q12406 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.94□□□□□ -0.34
ARP7Q12406 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.94□□□□□ -0.34
ARP7Q12406 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.94□□□□□ -0.34
ARP7Q12406 YLR281CYLR281C 468 nt12.92□□□□□ -0.34
ARP7Q12406 ALF1YNL148C 765 nt12.91□□□□□ -0.34
ARP7Q12406 YDR095CYDR095C 411 nt12.89□□□□□ -0.35
ARP7Q12406 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.88□□□□□ -0.35
ARP7Q12406 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.88□□□□□ -0.35
ARP7Q12406 WHI5YOR083W 888 nt12.85□□□□□ -0.35
ARP7Q12406 SPT5YML010W 3192 nt12.84□□□□□ -0.35
ARP7Q12406 PUS2YGL063W 1113 nt12.81□□□□□ -0.36
ARP7Q12406 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.79□□□□□ -0.36
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