Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.3■■□□□ 1
LCB4Q12246 NSR1YGR159C 1245 nt20.91■□□□□ 0.94
LCB4Q12246 NOP1YDL014W 984 nt20.66■□□□□ 0.9
LCB4Q12246 YKL036CYKL036C 393 nt19.25■□□□□ 0.67
LCB4Q12246 MDJ1YFL016C 1536 nt18.57■□□□□ 0.56
LCB4Q12246 Q0297Q0297 156 nt18.14■□□□□ 0.49
LCB4Q12246 SRX1YKL086W 384 nt18.07■□□□□ 0.48
LCB4Q12246 YJL027CYJL027C 417 nt18.04■□□□□ 0.48
LCB4Q12246 SCS3YGL126W 1143 nt17.65■□□□□ 0.42
LCB4Q12246 YCR051WYCR051W 669 nt17.25■□□□□ 0.35
LCB4Q12246 YOL085CYOL085C 342 nt16.7■□□□□ 0.26
LCB4Q12246 PKP1YIL042C 1185 nt16.53■□□□□ 0.24
LCB4Q12246 DBP2YNL112W 1641 nt16.45■□□□□ 0.22
LCB4Q12246 RPP1BYDL130W 321 nt16.31■□□□□ 0.2
LCB4Q12246 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.27■□□□□ 0.2
LCB4Q12246 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.27■□□□□ 0.2
LCB4Q12246 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.27■□□□□ 0.2
LCB4Q12246 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.27■□□□□ 0.2
LCB4Q12246 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.27■□□□□ 0.2
LCB4Q12246 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.27■□□□□ 0.2
LCB4Q12246 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.27■□□□□ 0.2
LCB4Q12246 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.27■□□□□ 0.2
LCB4Q12246 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.27■□□□□ 0.2
LCB4Q12246 CCC1YLR220W 969 nt16.22■□□□□ 0.19
LCB4Q12246 ATS1YAL020C 1002 nt15.81■□□□□ 0.12
LCB4Q12246 SCJ1YMR214W 1134 nt15.69■□□□□ 0.1
LCB4Q12246 YBR190WYBR190W 312 nt15.66■□□□□ 0.1
LCB4Q12246 PET122YER153C 765 nt15.63■□□□□ 0.09
LCB4Q12246 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.46■□□□□ 0.07
LCB4Q12246 RVS167YDR388W 1449 nt15.43■□□□□ 0.06
LCB4Q12246 RTC3YHR087W 336 nt15.42■□□□□ 0.06
LCB4Q12246 SCR1SCR1 522 nt15.42■□□□□ 0.06
LCB4Q12246 RRN5YLR141W 1092 nt15.18■□□□□ 0.02
LCB4Q12246 SHR5YOL110W 714 nt14.94□□□□□ -0.02
LCB4Q12246 RSB1YOR049C 1065 nt14.93□□□□□ -0.02
LCB4Q12246 YDJ1YNL064C 1230 nt14.89□□□□□ -0.03
LCB4Q12246 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.88□□□□□ -0.03
LCB4Q12246 GAR1YHR089C 618 nt14.65□□□□□ -0.06
LCB4Q12246 PST2YDR032C 597 nt14.61□□□□□ -0.07
LCB4Q12246 DEP1YAL013W 1218 nt14.6□□□□□ -0.07
LCB4Q12246 URN1YPR152C 1398 nt14.48□□□□□ -0.09
LCB4Q12246 YNL208WYNL208W 600 nt14.26□□□□□ -0.13
LCB4Q12246 RPN10YHR200W 807 nt14.21□□□□□ -0.13
LCB4Q12246 OPI9YLR338W 858 nt14.18□□□□□ -0.14
LCB4Q12246 PUT4YOR348C 1884 nt14.14□□□□□ -0.15
LCB4Q12246 SAH1YER043C 1350 nt14.13□□□□□ -0.15
LCB4Q12246 YKL097CYKL097C 411 nt14.12□□□□□ -0.15
LCB4Q12246 TIR1YER011W 765 nt14.11□□□□□ -0.15
LCB4Q12246 SHU1YHL006C 453 nt14.03□□□□□ -0.16
LCB4Q12246 ARE1YCR048W 1833 nt13.96□□□□□ -0.17
LCB4Q12246 SSA1YAL005C 1929 nt13.94□□□□□ -0.18
LCB4Q12246 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.84□□□□□ -0.19
LCB4Q12246 SRB2YHR041C 633 nt13.82□□□□□ -0.2
LCB4Q12246 YJR018WYJR018W 363 nt13.81□□□□□ -0.2
LCB4Q12246 SSA3YBL075C 1950 nt13.8□□□□□ -0.2
LCB4Q12246 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.8□□□□□ -0.2
LCB4Q12246 POA1YBR022W 534 nt13.77□□□□□ -0.21
LCB4Q12246 PUN1YLR414C 792 nt13.75□□□□□ -0.21
LCB4Q12246 YJR120WYJR120W 351 nt13.67□□□□□ -0.22
LCB4Q12246 PTC2YER089C 1395 nt13.62□□□□□ -0.23
LCB4Q12246 WWM1YFL010C 636 nt13.56□□□□□ -0.24
LCB4Q12246 YOR139CYOR139C 393 nt13.56□□□□□ -0.24
LCB4Q12246 BUD23YCR047C 828 nt13.53□□□□□ -0.24
LCB4Q12246 RPP2BYDR382W 333 nt13.52□□□□□ -0.25
LCB4Q12246 MNP1YGL068W 585 nt13.49□□□□□ -0.25
LCB4Q12246 HOM6YJR139C 1080 nt13.43□□□□□ -0.26
LCB4Q12246 BSC6YOL137W 1494 nt13.42□□□□□ -0.26
LCB4Q12246 YGR021WYGR021W 873 nt13.41□□□□□ -0.26
LCB4Q12246 NPL3YDR432W 1245 nt13.38□□□□□ -0.27
LCB4Q12246 NAB2YGL122C 1578 nt13.37□□□□□ -0.27
LCB4Q12246 FPR4YLR449W 1179 nt13.32□□□□□ -0.28
LCB4Q12246 BDH2YAL061W 1254 nt13.3□□□□□ -0.28
LCB4Q12246 DAL1YIR027C 1383 nt13.24□□□□□ -0.29
LCB4Q12246 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.24□□□□□ -0.29
LCB4Q12246 FIS1YIL065C 468 nt13.24□□□□□ -0.29
LCB4Q12246 RKM5YLR137W 1104 nt13.24□□□□□ -0.29
LCB4Q12246 INM2YDR287W 879 nt13.23□□□□□ -0.29
LCB4Q12246 YBL100CYBL100C 315 nt13.19□□□□□ -0.3
LCB4Q12246 YOL037CYOL037C 354 nt13.18□□□□□ -0.3
LCB4Q12246 PHO4YFR034C 939 nt13.14□□□□□ -0.31
LCB4Q12246 LSM3YLR438C-A 270 nt13.11□□□□□ -0.31
LCB4Q12246 FUN26YAL022C 1554 nt13.05□□□□□ -0.32
LCB4Q12246 TRM9YML014W 840 nt13.03□□□□□ -0.32
LCB4Q12246 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13□□□□□ -0.33
LCB4Q12246 IMT4tM(CAU)E 72 nt13□□□□□ -0.33
LCB4Q12246 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13□□□□□ -0.33
LCB4Q12246 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13□□□□□ -0.33
LCB4Q12246 IMT2tM(CAU)P 72 nt13□□□□□ -0.33
LCB4Q12246 YLR281CYLR281C 468 nt12.91□□□□□ -0.34
LCB4Q12246 PUS2YGL063W 1113 nt12.89□□□□□ -0.35
LCB4Q12246 WHI5YOR083W 888 nt12.88□□□□□ -0.35
LCB4Q12246 CCT6YDR188W 1641 nt12.86□□□□□ -0.35
LCB4Q12246 ALF1YNL148C 765 nt12.82□□□□□ -0.36
LCB4Q12246 YPS1YLR120C 1710 nt12.8□□□□□ -0.36
LCB4Q12246 YDR095CYDR095C 411 nt12.74□□□□□ -0.37
LCB4Q12246 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.72□□□□□ -0.37
LCB4Q12246 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.71□□□□□ -0.37
LCB4Q12246 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.71□□□□□ -0.37
LCB4Q12246 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.69□□□□□ -0.38
LCB4Q12246 YPR011CYPR011C 981 nt12.67□□□□□ -0.38
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