RNA–Protein interactions for RNA: YOR003W

YSP3, Transcript of Putative precursor to the subtilisin-like protease III, yeast

Gene YSP3, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YSP3	YOR003W	SDS3	P40505	327 aa		11.36	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	MMM1	P41800	426 aa		11.36	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	YJR054W	P47114	497 aa		11.36	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	PRM6	Q04705	352 aa		11.36	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	VBA3	P25594	458 aa		11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	VBA5	P36172	582 aa		11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	IES1	P43579	692 aa		11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	ESBP6	P53918	673 aa		11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	PXL1	P36166	706 aa		11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	DYS1	P38791	387 aa		11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	STR2	P47164	639 aa		11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	YNL011C	P53980	444 aa		11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	GPM2	Q12008	311 aa		11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	DAP1	Q12091	152 aa		11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	ATG9	Q12142	997 aa		11.35	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	SPO12	P17123	173 aa		11.34	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	PEP7	P32609	515 aa		11.34	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	GYP6	P32806	458 aa		11.34	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	TKL2	P33315	681 aa		11.34	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	ASG7	P46993	209 aa		11.34	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	SAM3	Q08986	587 aa		11.34	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	TAF10	Q12030	206 aa		11.34	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	YOL098C	Q12496	1037 aa		11.34	□□□□□ -0.59
YSP3	YOR003W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	JNM1	P36224	373 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	RDH54	P38086	958 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	EXO5	P38289	585 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	DSE1	P40077	573 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	TAF1	P46677	1066 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	KDX1	P36005	433 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	RGD1	P38339	666 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	PEX28	P38848	579 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	MND1	P53102	219 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	TRE1	Q08919	783 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	MCM2	P29469	868 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	YEL075C	P39972	122 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	MOB1	P40484	314 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	SLG1	P54867	378 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	SGO1	Q08490	590 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	APL4	Q12028	832 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	HMI1	Q12039	706 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	YER152C	P10356	443 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	APE1	P14904	514 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	PHO86	P46956	311 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	HER2	Q03557	464 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	FMP25	Q08023	583 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	RRN6	P32786	894 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	ATG3	P40344	310 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	PFD1	P46988	109 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	VPS54	Q12071	889 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	CLC1	P17891	233 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	SAF1	P38352	637 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	YJL045W	P47052	634 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	VPS25	P47142	202 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	ARO80	Q04052	950 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	DDC1	Q08949	612 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	RRD2	Q12461	358 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	JIP3	O13555	125 aa		11.27	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	YBL036C	P38197	257 aa		11.27	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	HXT8	P40886	569 aa		11.27	□□□□□ -0.6
YSP3	YOR003W	MST1	P07236	462 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	HMG2	P12684	1045 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	YKL050C	P35736	922 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	YTA12	P40341	825 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	CDC1	P40986	491 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	GCN5	Q03330	439 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	MDM38	Q08179	573 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	EMP46	Q12396	444 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	PBS2	P08018	668 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	KEX2	P13134	814 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	KAR3	P17119	729 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	PEX34	P25584	144 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	PPZ1	P26570	692 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	YMC2	P38087	329 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	RAD55	P38953	406 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSP3	YOR003W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61

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