Protein–RNA interactions for Protein: P40077

DSE1, Protein DSE1, yeastyeast

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE1P40077 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.71■■□□□ 1.07
DSE1P40077 NSR1YGR159C 1245 nt21.43■■□□□ 1.02
DSE1P40077 NOP1YDL014W 984 nt21.12■□□□□ 0.97
DSE1P40077 YKL036CYKL036C 393 nt19.6■□□□□ 0.73
DSE1P40077 MDJ1YFL016C 1536 nt18.98■□□□□ 0.63
DSE1P40077 Q0297Q0297 156 nt18.5■□□□□ 0.55
DSE1P40077 SRX1YKL086W 384 nt18.44■□□□□ 0.54
DSE1P40077 YJL027CYJL027C 417 nt18.34■□□□□ 0.53
DSE1P40077 SCS3YGL126W 1143 nt17.9■□□□□ 0.46
DSE1P40077 YCR051WYCR051W 669 nt17.57■□□□□ 0.4
DSE1P40077 YOL085CYOL085C 342 nt16.97■□□□□ 0.31
DSE1P40077 DBP2YNL112W 1641 nt16.8■□□□□ 0.28
DSE1P40077 PKP1YIL042C 1185 nt16.76■□□□□ 0.27
DSE1P40077 RPP1BYDL130W 321 nt16.62■□□□□ 0.25
DSE1P40077 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.61■□□□□ 0.25
DSE1P40077 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.61■□□□□ 0.25
DSE1P40077 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.61■□□□□ 0.25
DSE1P40077 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.61■□□□□ 0.25
DSE1P40077 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.61■□□□□ 0.25
DSE1P40077 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.61■□□□□ 0.25
DSE1P40077 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.61■□□□□ 0.25
DSE1P40077 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.61■□□□□ 0.25
DSE1P40077 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.61■□□□□ 0.25
DSE1P40077 CCC1YLR220W 969 nt16.53■□□□□ 0.24
DSE1P40077 YBR190WYBR190W 312 nt16.1■□□□□ 0.17
DSE1P40077 ATS1YAL020C 1002 nt16.04■□□□□ 0.16
DSE1P40077 SCJ1YMR214W 1134 nt15.93■□□□□ 0.14
DSE1P40077 PET122YER153C 765 nt15.89■□□□□ 0.13
DSE1P40077 RTC3YHR087W 336 nt15.83■□□□□ 0.12
DSE1P40077 RVS167YDR388W 1449 nt15.83■□□□□ 0.12
DSE1P40077 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.77■□□□□ 0.12
DSE1P40077 SCR1SCR1 522 nt15.75■□□□□ 0.11
DSE1P40077 RRN5YLR141W 1092 nt15.46■□□□□ 0.07
DSE1P40077 SHR5YOL110W 714 nt15.29■□□□□ 0.04
DSE1P40077 YDJ1YNL064C 1230 nt15.22■□□□□ 0.03
DSE1P40077 RSB1YOR049C 1065 nt15.18■□□□□ 0.02
DSE1P40077 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.14■□□□□ 0.01
DSE1P40077 GAR1YHR089C 618 nt14.93□□□□□ -0.02
DSE1P40077 DEP1YAL013W 1218 nt14.89□□□□□ -0.03
DSE1P40077 URN1YPR152C 1398 nt14.83□□□□□ -0.04
DSE1P40077 PST2YDR032C 597 nt14.82□□□□□ -0.04
DSE1P40077 SSA3YBL075C 1950 nt14.64□□□□□ -0.07
DSE1P40077 RPN10YHR200W 807 nt14.61□□□□□ -0.07
DSE1P40077 YNL208WYNL208W 600 nt14.61□□□□□ -0.07
DSE1P40077 OPI9YLR338W 858 nt14.55□□□□□ -0.08
DSE1P40077 PUT4YOR348C 1884 nt14.54□□□□□ -0.08
DSE1P40077 SAH1YER043C 1350 nt14.47□□□□□ -0.09
DSE1P40077 TIR1YER011W 765 nt14.4□□□□□ -0.1
DSE1P40077 ARE1YCR048W 1833 nt14.32□□□□□ -0.12
DSE1P40077 YKL097CYKL097C 411 nt14.31□□□□□ -0.12
DSE1P40077 SHU1YHL006C 453 nt14.21□□□□□ -0.13
DSE1P40077 SSA1YAL005C 1929 nt14.21□□□□□ -0.14
DSE1P40077 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.15□□□□□ -0.14
DSE1P40077 YJR018WYJR018W 363 nt14.15□□□□□ -0.14
DSE1P40077 POA1YBR022W 534 nt14.14□□□□□ -0.15
DSE1P40077 PUN1YLR414C 792 nt14.13□□□□□ -0.15
DSE1P40077 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.02□□□□□ -0.17
DSE1P40077 SRB2YHR041C 633 nt14□□□□□ -0.17
DSE1P40077 PTC2YER089C 1395 nt13.97□□□□□ -0.17
DSE1P40077 YJR120WYJR120W 351 nt13.92□□□□□ -0.18
DSE1P40077 RPP2BYDR382W 333 nt13.89□□□□□ -0.19
DSE1P40077 BUD23YCR047C 828 nt13.88□□□□□ -0.19
DSE1P40077 WWM1YFL010C 636 nt13.81□□□□□ -0.2
DSE1P40077 BSC6YOL137W 1494 nt13.79□□□□□ -0.2
DSE1P40077 NAB2YGL122C 1578 nt13.75□□□□□ -0.21
DSE1P40077 YGR021WYGR021W 873 nt13.71□□□□□ -0.21
DSE1P40077 YOR139CYOR139C 393 nt13.71□□□□□ -0.21
DSE1P40077 HOM6YJR139C 1080 nt13.67□□□□□ -0.22
DSE1P40077 MNP1YGL068W 585 nt13.66□□□□□ -0.22
DSE1P40077 FPR4YLR449W 1179 nt13.64□□□□□ -0.23
DSE1P40077 BDH2YAL061W 1254 nt13.62□□□□□ -0.23
DSE1P40077 INM2YDR287W 879 nt13.61□□□□□ -0.23
DSE1P40077 DAL1YIR027C 1383 nt13.59□□□□□ -0.23
DSE1P40077 NPL3YDR432W 1245 nt13.59□□□□□ -0.23
DSE1P40077 FIS1YIL065C 468 nt13.55□□□□□ -0.24
DSE1P40077 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.54□□□□□ -0.24
DSE1P40077 SPT5YML010W 3192 nt13.52□□□□□ -0.24
DSE1P40077 YBL100CYBL100C 315 nt13.51□□□□□ -0.25
DSE1P40077 RKM5YLR137W 1104 nt13.48□□□□□ -0.25
DSE1P40077 PHO4YFR034C 939 nt13.47□□□□□ -0.25
DSE1P40077 LSM3YLR438C-A 270 nt13.44□□□□□ -0.26
DSE1P40077 YOL037CYOL037C 354 nt13.43□□□□□ -0.26
DSE1P40077 TRM9YML014W 840 nt13.37□□□□□ -0.27
DSE1P40077 FUN26YAL022C 1554 nt13.36□□□□□ -0.27
DSE1P40077 CCT6YDR188W 1641 nt13.18□□□□□ -0.3
DSE1P40077 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.18□□□□□ -0.3
DSE1P40077 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.18□□□□□ -0.3
DSE1P40077 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.18□□□□□ -0.3
DSE1P40077 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.18□□□□□ -0.3
DSE1P40077 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.18□□□□□ -0.3
DSE1P40077 ALF1YNL148C 765 nt13.16□□□□□ -0.3
DSE1P40077 YPS1YLR120C 1710 nt13.15□□□□□ -0.3
DSE1P40077 YLR281CYLR281C 468 nt13.13□□□□□ -0.31
DSE1P40077 SSA4YER103W 1929 nt13.11□□□□□ -0.31
DSE1P40077 PUS2YGL063W 1113 nt13.09□□□□□ -0.31
DSE1P40077 WHI5YOR083W 888 nt13.09□□□□□ -0.31
DSE1P40077 YDR095CYDR095C 411 nt13.08□□□□□ -0.32
DSE1P40077 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.07□□□□□ -0.32
DSE1P40077 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.07□□□□□ -0.32
DSE1P40077 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.3 ms