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Protein–RNA interactions for Protein: P40077
DSE1, Protein DSE1, yeast
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573 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
DSE1
P40077
YML009W-B
YML009W-B
477 nt
21.71
■■□□□ 1.07
DSE1
P40077
NSR1
YGR159C
1245 nt
21.43
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DSE1
P40077
NOP1
YDL014W
984 nt
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DSE1
P40077
YKL036C
YKL036C
393 nt
19.6
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DSE1
P40077
MDJ1
YFL016C
1536 nt
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DSE1
P40077
Q0297
Q0297
156 nt
18.5
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DSE1
P40077
SRX1
YKL086W
384 nt
18.44
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DSE1
P40077
YJL027C
YJL027C
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DSE1
P40077
SCS3
YGL126W
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P40077
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YCR051W
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P40077
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YOL085C
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P40077
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YNL112W
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P40077
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P40077
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P40077
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P40077
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SUF8
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P40077
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tP(UGG)L
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P40077
SUF7
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P40077
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tP(UGG)N1
72 nt
16.61
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DSE1
P40077
tP(UGG)N2
tP(UGG)N2
72 nt
16.61
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DSE1
P40077
tP(UGG)O1
tP(UGG)O1
72 nt
16.61
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DSE1
P40077
SUF11
tP(UGG)O2
72 nt
16.61
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DSE1
P40077
CCC1
YLR220W
969 nt
16.53
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DSE1
P40077
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YBR190W
312 nt
16.1
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DSE1
P40077
ATS1
YAL020C
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DSE1
P40077
SCJ1
YMR214W
1134 nt
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DSE1
P40077
PET122
YER153C
765 nt
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DSE1
P40077
RTC3
YHR087W
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DSE1
P40077
RVS167
YDR388W
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DSE1
P40077
tP(UGG)O3
tP(UGG)O3
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DSE1
P40077
SCR1
SCR1
522 nt
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DSE1
P40077
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YLR141W
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DSE1
P40077
SHR5
YOL110W
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DSE1
P40077
YDJ1
YNL064C
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15.22
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P40077
RSB1
YOR049C
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DSE1
P40077
YER088W-B
YER088W-B
147 nt
15.14
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DSE1
P40077
GAR1
YHR089C
618 nt
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□□□□□ -0.02
DSE1
P40077
DEP1
YAL013W
1218 nt
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□□□□□ -0.03
DSE1
P40077
URN1
YPR152C
1398 nt
14.83
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DSE1
P40077
PST2
YDR032C
597 nt
14.82
□□□□□ -0.04
DSE1
P40077
SSA3
YBL075C
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DSE1
P40077
RPN10
YHR200W
807 nt
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DSE1
P40077
YNL208W
YNL208W
600 nt
14.61
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DSE1
P40077
OPI9
YLR338W
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DSE1
P40077
PUT4
YOR348C
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DSE1
P40077
SAH1
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DSE1
P40077
TIR1
YER011W
765 nt
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DSE1
P40077
ARE1
YCR048W
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DSE1
P40077
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YKL097C
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DSE1
P40077
SHU1
YHL006C
453 nt
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DSE1
P40077
SSA1
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DSE1
P40077
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YHR049C-A
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DSE1
P40077
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YJR018W
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DSE1
P40077
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YBR022W
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DSE1
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PUN1
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P40077
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DSE1
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DSE1
P40077
PTC2
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YJR120W
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DSE1
P40077
RPP2B
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P40077
BUD23
YCR047C
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YFL010C
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P40077
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YOL137W
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DSE1
P40077
NAB2
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DSE1
P40077
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YGR021W
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DSE1
P40077
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YOR139C
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P40077
HOM6
YJR139C
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P40077
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DSE1
P40077
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DSE1
P40077
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YIR027C
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P40077
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YBL100C
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P40077
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P40077
CCT6
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DSE1
P40077
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DSE1
P40077
IMT4
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P40077
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P40077
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P40077
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P40077
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DSE1
P40077
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DSE1
P40077
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DSE1
P40077
PUS2
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DSE1
P40077
WHI5
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DSE1
P40077
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YDR095C
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DSE1
P40077
SUF2
tP(AGG)C
72 nt
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□□□□□ -0.32
DSE1
P40077
SUF10
tP(AGG)N
72 nt
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□□□□□ -0.32
DSE1
P40077
YHR165W-A
YHR165W-A
312 nt
13.04
□□□□□ -0.32
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