Protein–RNA interactions for Protein: Q12396

EMP46, Protein EMP46, yeastyeast

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EMP46Q12396 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.48■■□□□ 1.03
EMP46Q12396 NSR1YGR159C 1245 nt21.38■■□□□ 1.01
EMP46Q12396 NOP1YDL014W 984 nt20.87■□□□□ 0.93
EMP46Q12396 YKL036CYKL036C 393 nt19.28■□□□□ 0.68
EMP46Q12396 MDJ1YFL016C 1536 nt19■□□□□ 0.63
EMP46Q12396 Q0297Q0297 156 nt18.32■□□□□ 0.52
EMP46Q12396 SRX1YKL086W 384 nt18.27■□□□□ 0.52
EMP46Q12396 YJL027CYJL027C 417 nt17.98■□□□□ 0.47
EMP46Q12396 SCS3YGL126W 1143 nt17.57■□□□□ 0.4
EMP46Q12396 YCR051WYCR051W 669 nt17.3■□□□□ 0.36
EMP46Q12396 DBP2YNL112W 1641 nt16.85■□□□□ 0.29
EMP46Q12396 YOL085CYOL085C 342 nt16.73■□□□□ 0.27
EMP46Q12396 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.54■□□□□ 0.24
EMP46Q12396 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.54■□□□□ 0.24
EMP46Q12396 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.54■□□□□ 0.24
EMP46Q12396 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.54■□□□□ 0.24
EMP46Q12396 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.54■□□□□ 0.24
EMP46Q12396 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.54■□□□□ 0.24
EMP46Q12396 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.54■□□□□ 0.24
EMP46Q12396 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.54■□□□□ 0.24
EMP46Q12396 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.54■□□□□ 0.24
EMP46Q12396 PKP1YIL042C 1185 nt16.46■□□□□ 0.23
EMP46Q12396 RPP1BYDL130W 321 nt16.43■□□□□ 0.22
EMP46Q12396 CCC1YLR220W 969 nt16.33■□□□□ 0.2
EMP46Q12396 YBR190WYBR190W 312 nt16.19■□□□□ 0.18
EMP46Q12396 RTC3YHR087W 336 nt15.79■□□□□ 0.12
EMP46Q12396 SCJ1YMR214W 1134 nt15.75■□□□□ 0.11
EMP46Q12396 RVS167YDR388W 1449 nt15.74■□□□□ 0.11
EMP46Q12396 PET122YER153C 765 nt15.71■□□□□ 0.11
EMP46Q12396 ATS1YAL020C 1002 nt15.71■□□□□ 0.11
EMP46Q12396 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.64■□□□□ 0.09
EMP46Q12396 SCR1SCR1 522 nt15.48■□□□□ 0.07
EMP46Q12396 RRN5YLR141W 1092 nt15.25■□□□□ 0.03
EMP46Q12396 SHR5YOL110W 714 nt15.24■□□□□ 0.03
EMP46Q12396 YDJ1YNL064C 1230 nt15.13■□□□□ 0.01
EMP46Q12396 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.96□□□□□ -0.01
EMP46Q12396 RSB1YOR049C 1065 nt14.89□□□□□ -0.03
EMP46Q12396 SSA3YBL075C 1950 nt14.81□□□□□ -0.04
EMP46Q12396 URN1YPR152C 1398 nt14.81□□□□□ -0.04
EMP46Q12396 DEP1YAL013W 1218 nt14.8□□□□□ -0.04
EMP46Q12396 GAR1YHR089C 618 nt14.77□□□□□ -0.05
EMP46Q12396 PUT4YOR348C 1884 nt14.74□□□□□ -0.05
EMP46Q12396 OPI9YLR338W 858 nt14.61□□□□□ -0.07
EMP46Q12396 PST2YDR032C 597 nt14.57□□□□□ -0.08
EMP46Q12396 YNL208WYNL208W 600 nt14.56□□□□□ -0.08
EMP46Q12396 RPN10YHR200W 807 nt14.54□□□□□ -0.08
EMP46Q12396 SAH1YER043C 1350 nt14.52□□□□□ -0.08
EMP46Q12396 ARE1YCR048W 1833 nt14.48□□□□□ -0.09
EMP46Q12396 TIR1YER011W 765 nt14.29□□□□□ -0.12
EMP46Q12396 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.25□□□□□ -0.13
EMP46Q12396 POA1YBR022W 534 nt14.25□□□□□ -0.13
EMP46Q12396 PUN1YLR414C 792 nt14.16□□□□□ -0.14
EMP46Q12396 SSA1YAL005C 1929 nt14.15□□□□□ -0.14
EMP46Q12396 YJR018WYJR018W 363 nt14.12□□□□□ -0.15
EMP46Q12396 PTC2YER089C 1395 nt14.01□□□□□ -0.17
EMP46Q12396 SHU1YHL006C 453 nt13.98□□□□□ -0.17
EMP46Q12396 YJR120WYJR120W 351 nt13.98□□□□□ -0.17
EMP46Q12396 SRB2YHR041C 633 nt13.96□□□□□ -0.17
EMP46Q12396 BSC6YOL137W 1494 nt13.95□□□□□ -0.18
EMP46Q12396 YKL097CYKL097C 411 nt13.94□□□□□ -0.18
EMP46Q12396 BUD23YCR047C 828 nt13.89□□□□□ -0.19
EMP46Q12396 NAB2YGL122C 1578 nt13.81□□□□□ -0.2
EMP46Q12396 RPP2BYDR382W 333 nt13.8□□□□□ -0.2
EMP46Q12396 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.75□□□□□ -0.21
EMP46Q12396 WWM1YFL010C 636 nt13.67□□□□□ -0.22
EMP46Q12396 FIS1YIL065C 468 nt13.66□□□□□ -0.22
EMP46Q12396 DAL1YIR027C 1383 nt13.63□□□□□ -0.23
EMP46Q12396 INM2YDR287W 879 nt13.61□□□□□ -0.23
EMP46Q12396 BDH2YAL061W 1254 nt13.57□□□□□ -0.24
EMP46Q12396 FPR4YLR449W 1179 nt13.57□□□□□ -0.24
EMP46Q12396 YGR021WYGR021W 873 nt13.56□□□□□ -0.24
EMP46Q12396 HOM6YJR139C 1080 nt13.55□□□□□ -0.24
EMP46Q12396 PHO4YFR034C 939 nt13.52□□□□□ -0.25
EMP46Q12396 YBL100CYBL100C 315 nt13.49□□□□□ -0.25
EMP46Q12396 MNP1YGL068W 585 nt13.48□□□□□ -0.25
EMP46Q12396 YOR139CYOR139C 393 nt13.45□□□□□ -0.26
EMP46Q12396 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.43□□□□□ -0.26
EMP46Q12396 LSM3YLR438C-A 270 nt13.4□□□□□ -0.26
EMP46Q12396 SPT5YML010W 3192 nt13.38□□□□□ -0.27
EMP46Q12396 RKM5YLR137W 1104 nt13.35□□□□□ -0.27
EMP46Q12396 FUN26YAL022C 1554 nt13.35□□□□□ -0.27
EMP46Q12396 TRM9YML014W 840 nt13.29□□□□□ -0.28
EMP46Q12396 YPS1YLR120C 1710 nt13.27□□□□□ -0.29
EMP46Q12396 NPL3YDR432W 1245 nt13.26□□□□□ -0.29
EMP46Q12396 YOL037CYOL037C 354 nt13.23□□□□□ -0.29
EMP46Q12396 CCT6YDR188W 1641 nt13.2□□□□□ -0.3
EMP46Q12396 YDR095CYDR095C 411 nt13.18□□□□□ -0.3
EMP46Q12396 ALF1YNL148C 765 nt13.1□□□□□ -0.31
EMP46Q12396 MEP2YNL142W 1500 nt13.09□□□□□ -0.31
EMP46Q12396 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.07□□□□□ -0.32
EMP46Q12396 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.03□□□□□ -0.32
EMP46Q12396 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.03□□□□□ -0.32
EMP46Q12396 SSA4YER103W 1929 nt12.98□□□□□ -0.33
EMP46Q12396 SIS1YNL007C 1059 nt12.98□□□□□ -0.33
EMP46Q12396 YLR281CYLR281C 468 nt12.96□□□□□ -0.33
EMP46Q12396 PTP1YDL230W 1008 nt12.93□□□□□ -0.34
EMP46Q12396 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.92□□□□□ -0.34
EMP46Q12396 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.92□□□□□ -0.34
EMP46Q12396 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.92□□□□□ -0.34
EMP46Q12396 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.4 ms