RNA–Protein interactions for RNA: YLL003W

SFI1, Transcript of Centrin (Cdc31p)-binding protein required for SPB duplication, yeast

Gene SFI1, Length 2,841 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFI1	YLL003W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	SDS22	P36047	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	YIL001W	P40560	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	PEF1	P53238	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	LSB1	P53281	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	PEX29	Q03370	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	SPC24	Q04477	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	APL4	Q12028	832 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	ATG9	Q12142	997 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	YPR015C	Q12531	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	RAP1	P11938	827 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	ATE1	P16639	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	MRPL17	P36528	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	SEA4	P38164	1038 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	MRX3	P38172	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	TMA108	P40462	946 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	SNT2	P53127	1403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	YGR273C	P53329	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	GOR1	P53839	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	RMI1	Q02685	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	NSE5	Q03718	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	SOG2	Q08817	791 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	LAM4	P38800	1345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	OCT1	P35999	772 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	PXL1	P36166	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	ALG14	P38242	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	RFC5	P38251	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	FES1	P38260	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	YGL176C	P46945	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	NCS6	P53088	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	MLC1	P53141	149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	BSC5	P53755	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	YNL146W	P53906	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	ARO10	Q06408	635 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	GYP1	Q08484	637 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	DAS2	Q12084	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	GLC3	P32775	704 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
SFI1	YLL003W	STB2	P46679	850 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	NIS1	P53939	407 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	HOT1	Q03213	719 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	SGD1	Q06132	899 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SFI1	YLL003W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TFB1	P32776	642 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PPQ1	P32945	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PEX32	P38292	413 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SOH1	P38633	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SMF2	P38778	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YTA12	P40341	825 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YDR090C	Q03193	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MSH5	Q12175	901 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YBL010C	P32788	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MSG5	P38590	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RCK2	P38623	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PIK1	P39104	1066 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SSO2	P39926	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	LYS14	P40971	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MAD3	P47074	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YJR054W	P47114	497 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YKE2	P52553	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	DPL1	Q05567	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YPK2	P18961	677 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PRP28	P23394	588 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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