Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 NSR1YGR159C 1245 nt18.08■□□□□ 0.48
MSH5Q12175 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.57■□□□□ 0.4
MSH5Q12175 MDJ1YFL016C 1536 nt16.89■□□□□ 0.29
MSH5Q12175 NOP1YDL014W 984 nt16.84■□□□□ 0.29
MSH5Q12175 YJL027CYJL027C 417 nt15.51■□□□□ 0.07
MSH5Q12175 SSA3YBL075C 1950 nt15.31■□□□□ 0.04
MSH5Q12175 YKL036CYKL036C 393 nt14.96□□□□□ -0.01
MSH5Q12175 SRX1YKL086W 384 nt14.68□□□□□ -0.06
MSH5Q12175 YBR190WYBR190W 312 nt14.65□□□□□ -0.06
MSH5Q12175 DBP2YNL112W 1641 nt14.57□□□□□ -0.08
MSH5Q12175 Q0297Q0297 156 nt14.51□□□□□ -0.09
MSH5Q12175 RTC3YHR087W 336 nt14.29□□□□□ -0.12
MSH5Q12175 PUT4YOR348C 1884 nt13.99□□□□□ -0.17
MSH5Q12175 YCR051WYCR051W 669 nt13.93□□□□□ -0.18
MSH5Q12175 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.62□□□□□ -0.23
MSH5Q12175 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.62□□□□□ -0.23
MSH5Q12175 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.62□□□□□ -0.23
MSH5Q12175 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.62□□□□□ -0.23
MSH5Q12175 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.62□□□□□ -0.23
MSH5Q12175 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.62□□□□□ -0.23
MSH5Q12175 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.62□□□□□ -0.23
MSH5Q12175 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.62□□□□□ -0.23
MSH5Q12175 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.62□□□□□ -0.23
MSH5Q12175 CCC1YLR220W 969 nt13.54□□□□□ -0.24
MSH5Q12175 RVS167YDR388W 1449 nt13.53□□□□□ -0.24
MSH5Q12175 POA1YBR022W 534 nt13.49□□□□□ -0.25
MSH5Q12175 ARE1YCR048W 1833 nt13.46□□□□□ -0.26
MSH5Q12175 SPT5YML010W 3192 nt13.41□□□□□ -0.26
MSH5Q12175 SSA4YER103W 1929 nt13.4□□□□□ -0.26
MSH5Q12175 BSC6YOL137W 1494 nt13.36□□□□□ -0.27
MSH5Q12175 SCS3YGL126W 1143 nt13.3□□□□□ -0.28
MSH5Q12175 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.29□□□□□ -0.28
MSH5Q12175 SCJ1YMR214W 1134 nt13.23□□□□□ -0.29
MSH5Q12175 SAH1YER043C 1350 nt13.18□□□□□ -0.3
MSH5Q12175 RPP1BYDL130W 321 nt13.04□□□□□ -0.32
MSH5Q12175 OPI9YLR338W 858 nt13.03□□□□□ -0.32
MSH5Q12175 URN1YPR152C 1398 nt13.03□□□□□ -0.32
MSH5Q12175 YOL085CYOL085C 342 nt12.98□□□□□ -0.33
MSH5Q12175 BDF1YLR399C 2061 nt12.98□□□□□ -0.33
MSH5Q12175 BUD23YCR047C 828 nt12.92□□□□□ -0.34
MSH5Q12175 PKP1YIL042C 1185 nt12.88□□□□□ -0.35
MSH5Q12175 SHR5YOL110W 714 nt12.83□□□□□ -0.36
MSH5Q12175 TAT1YBR069C 1860 nt12.78□□□□□ -0.36
MSH5Q12175 PAC11YDR488C 1602 nt12.77□□□□□ -0.36
MSH5Q12175 DEP1YAL013W 1218 nt12.77□□□□□ -0.37
MSH5Q12175 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.71□□□□□ -0.37
MSH5Q12175 PTC2YER089C 1395 nt12.65□□□□□ -0.38
MSH5Q12175 MEP2YNL142W 1500 nt12.64□□□□□ -0.39
MSH5Q12175 RPN10YHR200W 807 nt12.64□□□□□ -0.39
MSH5Q12175 PUN1YLR414C 792 nt12.64□□□□□ -0.39
MSH5Q12175 NAB2YGL122C 1578 nt12.61□□□□□ -0.39
MSH5Q12175 PET122YER153C 765 nt12.54□□□□□ -0.4
MSH5Q12175 YNL208WYNL208W 600 nt12.47□□□□□ -0.41
MSH5Q12175 NVJ2YPR091C 2313 nt12.43□□□□□ -0.42
MSH5Q12175 DCW1YKL046C 1350 nt12.41□□□□□ -0.42
MSH5Q12175 YJR018WYJR018W 363 nt12.38□□□□□ -0.43
MSH5Q12175 FIS1YIL065C 468 nt12.31□□□□□ -0.44
MSH5Q12175 YBR220CYBR220C 1683 nt12.31□□□□□ -0.44
MSH5Q12175 YDJ1YNL064C 1230 nt12.28□□□□□ -0.44
MSH5Q12175 DAL1YIR027C 1383 nt12.27□□□□□ -0.45
MSH5Q12175 YMR090WYMR090W 684 nt12.25□□□□□ -0.45
MSH5Q12175 SCR1SCR1 522 nt12.25□□□□□ -0.45
MSH5Q12175 YPS1YLR120C 1710 nt12.23□□□□□ -0.45
MSH5Q12175 FPR4YLR449W 1179 nt12.23□□□□□ -0.45
MSH5Q12175 EMI2YDR516C 1503 nt12.22□□□□□ -0.45
MSH5Q12175 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.17□□□□□ -0.46
MSH5Q12175 PHO4YFR034C 939 nt12.15□□□□□ -0.46
MSH5Q12175 GAR1YHR089C 618 nt12.14□□□□□ -0.47
MSH5Q12175 RRN5YLR141W 1092 nt12.11□□□□□ -0.47
MSH5Q12175 PCH2YBR186W 1695 nt12.1□□□□□ -0.47
MSH5Q12175 SDH1YKL148C 1923 nt12.09□□□□□ -0.47
MSH5Q12175 YDL221WYDL221W 552 nt12.06□□□□□ -0.48
MSH5Q12175 INM2YDR287W 879 nt12.06□□□□□ -0.48
MSH5Q12175 GUT2YIL155C 1950 nt12.06□□□□□ -0.48
MSH5Q12175 SEC11YIR022W 504 nt12.02□□□□□ -0.49
MSH5Q12175 YDR095CYDR095C 411 nt12□□□□□ -0.49
MSH5Q12175 YJR120WYJR120W 351 nt11.96□□□□□ -0.49
MSH5Q12175 CAC2YML102W 1407 nt11.91□□□□□ -0.5
MSH5Q12175 RPP2BYDR382W 333 nt11.9□□□□□ -0.5
MSH5Q12175 SCC4YER147C 1875 nt11.88□□□□□ -0.51
MSH5Q12175 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.87□□□□□ -0.51
MSH5Q12175 PIB2YGL023C 1908 nt11.83□□□□□ -0.52
MSH5Q12175 PTP1YDL230W 1008 nt11.82□□□□□ -0.52
MSH5Q12175 YBL100CYBL100C 315 nt11.79□□□□□ -0.52
MSH5Q12175 RPP2AYOL039W 321 nt11.79□□□□□ -0.52
MSH5Q12175 FPS1YLL043W 2010 nt11.74□□□□□ -0.53
MSH5Q12175 TIR1YER011W 765 nt11.74□□□□□ -0.53
MSH5Q12175 ATS1YAL020C 1002 nt11.73□□□□□ -0.53
MSH5Q12175 SSA1YAL005C 1929 nt11.72□□□□□ -0.53
MSH5Q12175 IRC15YPL017C 1500 nt11.72□□□□□ -0.53
MSH5Q12175 RTF1YGL244W 1677 nt11.71□□□□□ -0.53
MSH5Q12175 YSC84YHR016C 1407 nt11.71□□□□□ -0.53
MSH5Q12175 RSB1YOR049C 1065 nt11.7□□□□□ -0.54
MSH5Q12175 GIS3YLR094C 1509 nt11.68□□□□□ -0.54
MSH5Q12175 ALF1YNL148C 765 nt11.66□□□□□ -0.54
MSH5Q12175 FUN26YAL022C 1554 nt11.62□□□□□ -0.55
MSH5Q12175 YHL050CYHL050C 2094 nt11.61□□□□□ -0.55
MSH5Q12175 BOP3YNL042W 1191 nt11.57□□□□□ -0.56
MSH5Q12175 BOR1YNL275W 1731 nt11.55□□□□□ -0.56
MSH5Q12175 PTK1YKL198C 1989 nt11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.6 ms