Protein–RNA interactions for Protein: Q04264

PDS5, Sister chromatid cohesion protein PDS5, yeastyeast

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Length 1,277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDS5Q04264 YML009W-BYML009W-B 477 nt27.27■■□□□ 1.96
PDS5Q04264 NSR1YGR159C 1245 nt27.07■■□□□ 1.92
PDS5Q04264 NOP1YDL014W 984 nt26.42■■□□□ 1.82
PDS5Q04264 YKL036CYKL036C 393 nt24.39■■□□□ 1.49
PDS5Q04264 MDJ1YFL016C 1536 nt24.16■■□□□ 1.46
PDS5Q04264 Q0297Q0297 156 nt23.15■■□□□ 1.3
PDS5Q04264 SRX1YKL086W 384 nt23.12■■□□□ 1.29
PDS5Q04264 YJL027CYJL027C 417 nt22.78■■□□□ 1.24
PDS5Q04264 SCS3YGL126W 1143 nt22.22■■□□□ 1.15
PDS5Q04264 YCR051WYCR051W 669 nt21.98■■□□□ 1.11
PDS5Q04264 DBP2YNL112W 1641 nt21.37■■□□□ 1.01
PDS5Q04264 YOL085CYOL085C 342 nt21.17■□□□□ 0.98
PDS5Q04264 TRN1tP(UGG)A 72 nt20.94■□□□□ 0.94
PDS5Q04264 SUF9tP(UGG)F 72 nt20.94■□□□□ 0.94
PDS5Q04264 SUF8tP(UGG)H 72 nt20.94■□□□□ 0.94
PDS5Q04264 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt20.94■□□□□ 0.94
PDS5Q04264 SUF7tP(UGG)M 72 nt20.94■□□□□ 0.94
PDS5Q04264 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt20.94■□□□□ 0.94
PDS5Q04264 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt20.94■□□□□ 0.94
PDS5Q04264 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt20.94■□□□□ 0.94
PDS5Q04264 SUF11tP(UGG)O2 72 nt20.94■□□□□ 0.94
PDS5Q04264 PKP1YIL042C 1185 nt20.92■□□□□ 0.94
PDS5Q04264 CCC1YLR220W 969 nt20.79■□□□□ 0.92
PDS5Q04264 RPP1BYDL130W 321 nt20.78■□□□□ 0.92
PDS5Q04264 YBR190WYBR190W 312 nt20.53■□□□□ 0.88
PDS5Q04264 RTC3YHR087W 336 nt20.12■□□□□ 0.81
PDS5Q04264 RVS167YDR388W 1449 nt19.97■□□□□ 0.79
PDS5Q04264 SCJ1YMR214W 1134 nt19.97■□□□□ 0.79
PDS5Q04264 PET122YER153C 765 nt19.91■□□□□ 0.78
PDS5Q04264 ATS1YAL020C 1002 nt19.86■□□□□ 0.77
PDS5Q04264 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt19.81■□□□□ 0.76
PDS5Q04264 SCR1SCR1 522 nt19.6■□□□□ 0.73
PDS5Q04264 RRN5YLR141W 1092 nt19.34■□□□□ 0.69
PDS5Q04264 SHR5YOL110W 714 nt19.3■□□□□ 0.68
PDS5Q04264 YDJ1YNL064C 1230 nt19.12■□□□□ 0.65
PDS5Q04264 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.95■□□□□ 0.62
PDS5Q04264 RSB1YOR049C 1065 nt18.91■□□□□ 0.62
PDS5Q04264 DEP1YAL013W 1218 nt18.87■□□□□ 0.61
PDS5Q04264 URN1YPR152C 1398 nt18.81■□□□□ 0.6
PDS5Q04264 GAR1YHR089C 618 nt18.78■□□□□ 0.6
PDS5Q04264 PUT4YOR348C 1884 nt18.71■□□□□ 0.59
PDS5Q04264 OPI9YLR338W 858 nt18.53■□□□□ 0.56
PDS5Q04264 SAH1YER043C 1350 nt18.47■□□□□ 0.55
PDS5Q04264 YNL208WYNL208W 600 nt18.47■□□□□ 0.55
PDS5Q04264 RPN10YHR200W 807 nt18.45■□□□□ 0.54
PDS5Q04264 PST2YDR032C 597 nt18.41■□□□□ 0.54
PDS5Q04264 ARE1YCR048W 1833 nt18.37■□□□□ 0.53
PDS5Q04264 POA1YBR022W 534 nt18.15■□□□□ 0.5
PDS5Q04264 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt18.13■□□□□ 0.49
PDS5Q04264 TIR1YER011W 765 nt18.12■□□□□ 0.49
PDS5Q04264 PUN1YLR414C 792 nt17.96■□□□□ 0.47
PDS5Q04264 SSA1YAL005C 1929 nt17.94■□□□□ 0.46
PDS5Q04264 YJR018WYJR018W 363 nt17.94■□□□□ 0.46
PDS5Q04264 PTC2YER089C 1395 nt17.81■□□□□ 0.44
PDS5Q04264 BSC6YOL137W 1494 nt17.74■□□□□ 0.43
PDS5Q04264 BUD23YCR047C 828 nt17.73■□□□□ 0.43
PDS5Q04264 SRB2YHR041C 633 nt17.72■□□□□ 0.43
PDS5Q04264 YJR120WYJR120W 351 nt17.72■□□□□ 0.43
PDS5Q04264 SHU1YHL006C 453 nt17.69■□□□□ 0.42
PDS5Q04264 YKL097CYKL097C 411 nt17.63■□□□□ 0.41
PDS5Q04264 NAB2YGL122C 1578 nt17.53■□□□□ 0.4
PDS5Q04264 RPP2BYDR382W 333 nt17.52■□□□□ 0.4
PDS5Q04264 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt17.49■□□□□ 0.39
PDS5Q04264 SSA3YBL075C 1950 nt17.44■□□□□ 0.38
PDS5Q04264 WWM1YFL010C 636 nt17.36■□□□□ 0.37
PDS5Q04264 FPR4YLR449W 1179 nt17.32■□□□□ 0.36
PDS5Q04264 FIS1YIL065C 468 nt17.31■□□□□ 0.36
PDS5Q04264 DAL1YIR027C 1383 nt17.3■□□□□ 0.36
PDS5Q04264 INM2YDR287W 879 nt17.26■□□□□ 0.35
PDS5Q04264 BDH2YAL061W 1254 nt17.19■□□□□ 0.34
PDS5Q04264 PHO4YFR034C 939 nt17.16■□□□□ 0.34
PDS5Q04264 HOM6YJR139C 1080 nt17.14■□□□□ 0.33
PDS5Q04264 YGR021WYGR021W 873 nt17.13■□□□□ 0.33
PDS5Q04264 YBL100CYBL100C 315 nt17.12■□□□□ 0.33
PDS5Q04264 MNP1YGL068W 585 nt17.11■□□□□ 0.33
PDS5Q04264 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.99■□□□□ 0.31
PDS5Q04264 YOR139CYOR139C 393 nt16.99■□□□□ 0.31
PDS5Q04264 LSM3YLR438C-A 270 nt16.94■□□□□ 0.3
PDS5Q04264 FUN26YAL022C 1554 nt16.94■□□□□ 0.3
PDS5Q04264 SPT5YML010W 3192 nt16.91■□□□□ 0.3
PDS5Q04264 RKM5YLR137W 1104 nt16.89■□□□□ 0.29
PDS5Q04264 TRM9YML014W 840 nt16.88■□□□□ 0.29
PDS5Q04264 YPS1YLR120C 1710 nt16.83■□□□□ 0.28
PDS5Q04264 NPL3YDR432W 1245 nt16.79■□□□□ 0.28
PDS5Q04264 YDR095CYDR095C 411 nt16.71■□□□□ 0.27
PDS5Q04264 YOL037CYOL037C 354 nt16.7■□□□□ 0.26
PDS5Q04264 CCT6YDR188W 1641 nt16.7■□□□□ 0.26
PDS5Q04264 ALF1YNL148C 765 nt16.67■□□□□ 0.26
PDS5Q04264 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt16.65■□□□□ 0.26
PDS5Q04264 MEP2YNL142W 1500 nt16.63■□□□□ 0.25
PDS5Q04264 SUF2tP(AGG)C 72 nt16.52■□□□□ 0.24
PDS5Q04264 SUF10tP(AGG)N 72 nt16.52■□□□□ 0.24
PDS5Q04264 DCW1YKL046C 1350 nt16.44■□□□□ 0.22
PDS5Q04264 SIS1YNL007C 1059 nt16.44■□□□□ 0.22
PDS5Q04264 RPP2AYOL039W 321 nt16.41■□□□□ 0.22
PDS5Q04264 PTP1YDL230W 1008 nt16.4■□□□□ 0.22
PDS5Q04264 YLR281CYLR281C 468 nt16.38■□□□□ 0.21
PDS5Q04264 WHI5YOR083W 888 nt16.35■□□□□ 0.21
PDS5Q04264 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.33■□□□□ 0.2
PDS5Q04264 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.33■□□□□ 0.2
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