Protein–RNA interactions for Protein: Q12531

YPR015C, Zinc finger protein YPR015C, yeastyeast

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR015CQ12531 NSR1YGR159C 1245 nt18.62■□□□□ 0.57
YPR015CQ12531 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.55■□□□□ 0.56
YPR015CQ12531 NOP1YDL014W 984 nt17.89■□□□□ 0.45
YPR015CQ12531 MDJ1YFL016C 1536 nt16.82■□□□□ 0.28
YPR015CQ12531 YKL036CYKL036C 393 nt16.28■□□□□ 0.2
YPR015CQ12531 SRX1YKL086W 384 nt15.64■□□□□ 0.09
YPR015CQ12531 Q0297Q0297 156 nt15.57■□□□□ 0.08
YPR015CQ12531 YJL027CYJL027C 417 nt15.48■□□□□ 0.07
YPR015CQ12531 YGR139WYGR139W 339 nt14.92□□□□□ -0.02
YPR015CQ12531 YCR051WYCR051W 669 nt14.85□□□□□ -0.03
YPR015CQ12531 DBP2YNL112W 1641 nt14.75□□□□□ -0.05
YPR015CQ12531 SCS3YGL126W 1143 nt14.69□□□□□ -0.06
YPR015CQ12531 YBR190WYBR190W 312 nt14.37□□□□□ -0.11
YPR015CQ12531 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YPR015CQ12531 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YPR015CQ12531 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YPR015CQ12531 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YPR015CQ12531 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YPR015CQ12531 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YPR015CQ12531 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YPR015CQ12531 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YPR015CQ12531 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YPR015CQ12531 CCC1YLR220W 969 nt14.2□□□□□ -0.14
YPR015CQ12531 YOL085CYOL085C 342 nt14.12□□□□□ -0.15
YPR015CQ12531 RTC3YHR087W 336 nt14.08□□□□□ -0.16
YPR015CQ12531 MOT3YMR070W 1473 nt14.03□□□□□ -0.16
YPR015CQ12531 RPP1BYDL130W 321 nt13.98□□□□□ -0.17
YPR015CQ12531 PKP1YIL042C 1185 nt13.98□□□□□ -0.17
YPR015CQ12531 Q0182Q0182 405 nt13.81□□□□□ -0.2
YPR015CQ12531 RVS167YDR388W 1449 nt13.81□□□□□ -0.2
YPR015CQ12531 SCJ1YMR214W 1134 nt13.69□□□□□ -0.22
YPR015CQ12531 NME1NME1 340 nt13.65□□□□□ -0.22
YPR015CQ12531 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.45□□□□□ -0.26
YPR015CQ12531 VAR1Q0140 1197 nt13.44□□□□□ -0.26
YPR015CQ12531 PET122YER153C 765 nt13.41□□□□□ -0.26
YPR015CQ12531 CSM2YIL132C 642 nt13.38□□□□□ -0.27
YPR015CQ12531 SHR5YOL110W 714 nt13.26□□□□□ -0.29
YPR015CQ12531 PUT4YOR348C 1884 nt13.25□□□□□ -0.29
YPR015CQ12531 PAU21YOR394W 495 nt13.23□□□□□ -0.29
YPR015CQ12531 PAU22YPL282C 495 nt13.23□□□□□ -0.29
YPR015CQ12531 SCR1SCR1 522 nt13.18□□□□□ -0.3
YPR015CQ12531 YDR509WYDR509W 348 nt13.08□□□□□ -0.32
YPR015CQ12531 ARO7YPR060C 771 nt13.08□□□□□ -0.32
YPR015CQ12531 URN1YPR152C 1398 nt13.07□□□□□ -0.32
YPR015CQ12531 ATS1YAL020C 1002 nt13.07□□□□□ -0.32
YPR015CQ12531 DEP1YAL013W 1218 nt13.03□□□□□ -0.32
YPR015CQ12531 PAM17YKR065C 594 nt13.01□□□□□ -0.33
YPR015CQ12531 RRN5YLR141W 1092 nt13.01□□□□□ -0.33
YPR015CQ12531 YDJ1YNL064C 1230 nt12.99□□□□□ -0.33
YPR015CQ12531 SSA3YBL075C 1950 nt12.94□□□□□ -0.34
YPR015CQ12531 ARE1YCR048W 1833 nt12.93□□□□□ -0.34
YPR015CQ12531 SAH1YER043C 1350 nt12.93□□□□□ -0.34
YPR015CQ12531 OPI9YLR338W 858 nt12.92□□□□□ -0.34
YPR015CQ12531 POA1YBR022W 534 nt12.85□□□□□ -0.35
YPR015CQ12531 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.79□□□□□ -0.36
YPR015CQ12531 GAR1YHR089C 618 nt12.79□□□□□ -0.36
YPR015CQ12531 RPN10YHR200W 807 nt12.79□□□□□ -0.36
YPR015CQ12531 REG2YBR050C 1017 nt12.78□□□□□ -0.36
YPR015CQ12531 YNL208WYNL208W 600 nt12.75□□□□□ -0.37
YPR015CQ12531 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.74□□□□□ -0.37
YPR015CQ12531 RSB1YOR049C 1065 nt12.67□□□□□ -0.38
YPR015CQ12531 BUR6YER159C 429 nt12.63□□□□□ -0.39
YPR015CQ12531 BMT5YIL096C 1011 nt12.62□□□□□ -0.39
YPR015CQ12531 BSC6YOL137W 1494 nt12.59□□□□□ -0.39
YPR015CQ12531 Q0144Q0144 330 nt12.57□□□□□ -0.4
YPR015CQ12531 PUN1YLR414C 792 nt12.54□□□□□ -0.4
YPR015CQ12531 BUD23YCR047C 828 nt12.5□□□□□ -0.41
YPR015CQ12531 Q0010Q0010 387 nt12.49□□□□□ -0.41
YPR015CQ12531 SEM1YDR363W-A 270 nt12.46□□□□□ -0.41
YPR015CQ12531 PTC2YER089C 1395 nt12.45□□□□□ -0.42
YPR015CQ12531 YJR018WYJR018W 363 nt12.45□□□□□ -0.42
YPR015CQ12531 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt12.38□□□□□ -0.43
YPR015CQ12531 TIR1YER011W 765 nt12.35□□□□□ -0.43
YPR015CQ12531 SRN2YLR119W 642 nt12.32□□□□□ -0.44
YPR015CQ12531 NAB2YGL122C 1578 nt12.3□□□□□ -0.44
YPR015CQ12531 Q0142Q0142 177 nt12.28□□□□□ -0.44
YPR015CQ12531 SSA1YAL005C 1929 nt12.26□□□□□ -0.45
YPR015CQ12531 YJR120WYJR120W 351 nt12.2□□□□□ -0.46
YPR015CQ12531 Q0017Q0017 162 nt12.19□□□□□ -0.46
YPR015CQ12531 PST2YDR032C 597 nt12.14□□□□□ -0.47
YPR015CQ12531 SPT5YML010W 3192 nt12.14□□□□□ -0.47
YPR015CQ12531 ARA2YMR041C 1008 nt12.13□□□□□ -0.47
YPR015CQ12531 RPP2BYDR382W 333 nt12.12□□□□□ -0.47
YPR015CQ12531 FPR4YLR449W 1179 nt12.12□□□□□ -0.47
YPR015CQ12531 DAL1YIR027C 1383 nt12.09□□□□□ -0.47
YPR015CQ12531 FIS1YIL065C 468 nt12.09□□□□□ -0.47
YPR015CQ12531 YCR099CYCR099C 468 nt12.05□□□□□ -0.48
YPR015CQ12531 AI3Q0060 1248 nt12.05□□□□□ -0.48
YPR015CQ12531 INM2YDR287W 879 nt12.02□□□□□ -0.49
YPR015CQ12531 SRB2YHR041C 633 nt12.02□□□□□ -0.49
YPR015CQ12531 ARP10YDR106W 855 nt11.98□□□□□ -0.49
YPR015CQ12531 PHO4YFR034C 939 nt11.98□□□□□ -0.49
YPR015CQ12531 Q0255Q0255 1419 nt11.94□□□□□ -0.5
YPR015CQ12531 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt11.88□□□□□ -0.51
YPR015CQ12531 YLR122CYLR122C 378 nt11.88□□□□□ -0.51
YPR015CQ12531 YBL100CYBL100C 315 nt11.88□□□□□ -0.51
YPR015CQ12531 SSA4YER103W 1929 nt11.85□□□□□ -0.51
YPR015CQ12531 MEP2YNL142W 1500 nt11.84□□□□□ -0.51
YPR015CQ12531 YPS1YLR120C 1710 nt11.83□□□□□ -0.52
YPR015CQ12531 BDH2YAL061W 1254 nt11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.2 ms