RNA–Protein interactions for RNA: YGR136W

LSB1, Transcript of Negative regulator of actin nucleation-promoting factor activity, yeast

Gene LSB1, Length 726 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LSB1	YGR136W	OCT1	P35999	772 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	CST26	P38226	397 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	TCD1	P38756	429 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	VID27	P40157	782 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
LSB1	YGR136W	UBX5	Q06682	500 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	FBP1	P09201	348 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	SRM1	P21827	482 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	NNK1	P36003	928 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	MCD4	P36051	919 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	RKM3	P38222	552 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	CIN4	P39110	191 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	VPS8	P39702	1274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	VAB2	P40003	282 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	DSN1	P40568	576 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	LYS14	P40971	790 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	NCS6	P53088	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	LCD1	Q04377	747 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	NTG2	Q08214	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	RAD61	Q99359	647 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	ACE2	P21192	770 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	CBP3	P21560	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	MRC1	P25588	1096 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	MLS1	P30952	554 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	DOM34	P33309	386 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	BYE1	P36106	594 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	RFC5	P38251	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	SIC1	P38634	284 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	CCC2	P38995	1004 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	MBP1	P39678	833 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	GDH3	P39708	457 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	ALG2	P43636	503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	NET1	P47035	1189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	RTA1	P53047	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	RSC1	P53236	928 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	ORC3	P54790	616 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	VPS60	Q03390	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	SGD1	Q06132	899 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	FLO1	P32768	1537 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	GSY1	P23337	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	RDS1	P25611	832 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	SWE1	P32944	819 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	PEX6	P33760	1030 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	LTV1	P34078	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	GPT2	P36148	743 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	BET3	P36149	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	FLR1	P38124	548 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	MAL33	P38157	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	YGR045C	P53229	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	MDM12	Q92328	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	ADE8	P04161	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	RIT1	P23796	513 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	NFS1	P25374	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	PER1	P25625	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	CHS3	P29465	1165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	DEP1	P31385	405 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	ANP1	P32629	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	DID4	P36108	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	PET10	P36139	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	MED8	P38304	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	ERG7	P38604	731 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	EPL1	P43572	832 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	YNR063W	P53749	607 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	TFC6	Q06339	672 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	SPO21	Q12411	609 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LSB1	YGR136W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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