RNA–Protein interactions for RNA: YMR172W

HOT1, Transcript of Transcription factor for glycerol biosynthetic genes, yeast

Gene HOT1, Length 2,160 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOT1	YMR172W	FYV10	P40492	516 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	STR2	P47164	639 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	ATH1	P48016	1211 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	MIG2	P53035	382 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	PEF1	P53238	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	MRPL50	P53724	139 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	NTE1	Q04958	1679 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	COQ4	O13525	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	CDC8	P00572	216 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	GPA1	P08539	472 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	KSS1	P14681	368 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	SEC63	P14906	663 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	VPS3	P23643	1011 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	RAD27	P26793	382 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	BAP2	P38084	609 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	MXR1	P40029	184 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	FMP10	P40098	244 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	MEC3	Q02574	474 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	VPS38	Q05919	439 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	YEH2	Q07950	538 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	ALR1	Q08269	859 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	POM152	P39685	1337 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	CSE4	P36012	229 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	GLG1	P36143	616 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	SDH8	P38345	138 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	YER130C	P39959	443 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	YCK3	P39962	524 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	LYS14	P40971	790 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	YFH7	P43591	353 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	TIM54	P47045	478 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	CGR1	P53188	120 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	YGR067C	P53243	804 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	YAF9	P53930	226 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	SRL4	Q03085	281 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	USA1	Q03714	838 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	SHE9	Q04172	456 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	TAF11	Q04226	346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	ARP9	Q05123	467 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	MLH2	Q07980	695 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	OSW1	Q08692	278 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	TAF10	Q12030	206 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	GYP5	Q12344	894 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	PDR11	P40550	1411 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	URA4	P20051	364 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	DIT1	P21623	536 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	MRPL8	P22353	238 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	RDS1	P25611	832 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	GSY2	P27472	705 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	ZIP1	P31111	875 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	GIP1	P38229	639 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	YJL070C	P40361	888 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	SPO22	P40511	975 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	PAC11	P40960	533 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	MAL11	P53048	616 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	PGA2	P53903	129 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	TFB3	Q03290	321 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	SWA2	Q06677	668 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	ADY3	Q07732	790 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	SGO1	Q08490	590 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	SPO21	Q12411	609 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	GPA2	P10823	449 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	ADY2	P25613	283 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	EUG1	P32474	517 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	SUV3	P32580	737 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	YKL050C	P35736	922 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	YBR225W	P38321	900 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOT1	YMR172W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.6 ms