Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 YML009W-BYML009W-B 477 nt27.27■■□□□ 1.96
CSE4P36012 NSR1YGR159C 1245 nt26.73■■□□□ 1.87
CSE4P36012 NOP1YDL014W 984 nt26.65■■□□□ 1.86
CSE4P36012 YKL036CYKL036C 393 nt25.03■■□□□ 1.6
CSE4P36012 Q0297Q0297 156 nt23.52■■□□□ 1.36
CSE4P36012 YJL027CYJL027C 417 nt23.43■■□□□ 1.34
CSE4P36012 MDJ1YFL016C 1536 nt23.35■■□□□ 1.33
CSE4P36012 SRX1YKL086W 384 nt23.33■■□□□ 1.33
CSE4P36012 SCS3YGL126W 1143 nt23.01■■□□□ 1.27
CSE4P36012 YCR051WYCR051W 669 nt22.16■■□□□ 1.14
CSE4P36012 YOL085CYOL085C 342 nt21.69■■□□□ 1.06
CSE4P36012 PKP1YIL042C 1185 nt21.32■■□□□ 1
CSE4P36012 RPP1BYDL130W 321 nt21.1■□□□□ 0.97
CSE4P36012 SCJ1YMR214W 1134 nt20.9■□□□□ 0.94
CSE4P36012 DBP2YNL112W 1641 nt20.86■□□□□ 0.93
CSE4P36012 TRN1tP(UGG)A 72 nt20.84■□□□□ 0.93
CSE4P36012 SUF9tP(UGG)F 72 nt20.84■□□□□ 0.93
CSE4P36012 SUF8tP(UGG)H 72 nt20.84■□□□□ 0.93
CSE4P36012 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt20.84■□□□□ 0.93
CSE4P36012 SUF7tP(UGG)M 72 nt20.84■□□□□ 0.93
CSE4P36012 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt20.84■□□□□ 0.93
CSE4P36012 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt20.84■□□□□ 0.93
CSE4P36012 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt20.84■□□□□ 0.93
CSE4P36012 SUF11tP(UGG)O2 72 nt20.84■□□□□ 0.93
CSE4P36012 ATS1YAL020C 1002 nt20.7■□□□□ 0.9
CSE4P36012 CCC1YLR220W 969 nt20.64■□□□□ 0.89
CSE4P36012 PET122YER153C 765 nt20.12■□□□□ 0.81
CSE4P36012 SCR1SCR1 522 nt19.97■□□□□ 0.79
CSE4P36012 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt19.87■□□□□ 0.77
CSE4P36012 YBR190WYBR190W 312 nt19.77■□□□□ 0.76
CSE4P36012 RVS167YDR388W 1449 nt19.62■□□□□ 0.73
CSE4P36012 RRN5YLR141W 1092 nt19.59■□□□□ 0.73
CSE4P36012 RTC3YHR087W 336 nt19.35■□□□□ 0.69
CSE4P36012 RSB1YOR049C 1065 nt19.29■□□□□ 0.68
CSE4P36012 YER088W-BYER088W-B 147 nt19.21■□□□□ 0.67
CSE4P36012 YDJ1YNL064C 1230 nt19.21■□□□□ 0.67
CSE4P36012 PST2YDR032C 597 nt19.12■□□□□ 0.65
CSE4P36012 SHR5YOL110W 714 nt19.08■□□□□ 0.64
CSE4P36012 GAR1YHR089C 618 nt18.71■□□□□ 0.59
CSE4P36012 YKL097CYKL097C 411 nt18.55■□□□□ 0.56
CSE4P36012 DEP1YAL013W 1218 nt18.42■□□□□ 0.54
CSE4P36012 URN1YPR152C 1398 nt18.3■□□□□ 0.52
CSE4P36012 SHU1YHL006C 453 nt18.25■□□□□ 0.51
CSE4P36012 YNL208WYNL208W 600 nt18.15■□□□□ 0.5
CSE4P36012 TIR1YER011W 765 nt18.07■□□□□ 0.48
CSE4P36012 RPN10YHR200W 807 nt18.07■□□□□ 0.48
CSE4P36012 OPI9YLR338W 858 nt17.94■□□□□ 0.46
CSE4P36012 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt17.85■□□□□ 0.45
CSE4P36012 YOR139CYOR139C 393 nt17.79■□□□□ 0.44
CSE4P36012 SSA1YAL005C 1929 nt17.78■□□□□ 0.44
CSE4P36012 SAH1YER043C 1350 nt17.73■□□□□ 0.43
CSE4P36012 PUT4YOR348C 1884 nt17.67■□□□□ 0.42
CSE4P36012 SRB2YHR041C 633 nt17.62■□□□□ 0.41
CSE4P36012 YJR018WYJR018W 363 nt17.48■□□□□ 0.39
CSE4P36012 NPL3YDR432W 1245 nt17.47■□□□□ 0.39
CSE4P36012 ARE1YCR048W 1833 nt17.46■□□□□ 0.39
CSE4P36012 PUN1YLR414C 792 nt17.4■□□□□ 0.38
CSE4P36012 WWM1YFL010C 636 nt17.37■□□□□ 0.37
CSE4P36012 YJR120WYJR120W 351 nt17.36■□□□□ 0.37
CSE4P36012 HOM6YJR139C 1080 nt17.35■□□□□ 0.37
CSE4P36012 MNP1YGL068W 585 nt17.34■□□□□ 0.37
CSE4P36012 YGR021WYGR021W 873 nt17.34■□□□□ 0.37
CSE4P36012 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt17.22■□□□□ 0.35
CSE4P36012 RPP2BYDR382W 333 nt17.2■□□□□ 0.34
CSE4P36012 YOL037CYOL037C 354 nt17.18■□□□□ 0.34
CSE4P36012 POA1YBR022W 534 nt17.13■□□□□ 0.33
CSE4P36012 PTC2YER089C 1395 nt17.13■□□□□ 0.33
CSE4P36012 RKM5YLR137W 1104 nt17.09■□□□□ 0.33
CSE4P36012 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt17.06■□□□□ 0.32
CSE4P36012 IMT4tM(CAU)E 72 nt17.06■□□□□ 0.32
CSE4P36012 IMT3tM(CAU)J3 72 nt17.06■□□□□ 0.32
CSE4P36012 IMT1tM(CAU)O1 72 nt17.06■□□□□ 0.32
CSE4P36012 IMT2tM(CAU)P 72 nt17.06■□□□□ 0.32
CSE4P36012 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt17.05■□□□□ 0.32
CSE4P36012 SSA3YBL075C 1950 nt17.04■□□□□ 0.32
CSE4P36012 BDH2YAL061W 1254 nt16.97■□□□□ 0.31
CSE4P36012 BUD23YCR047C 828 nt16.85■□□□□ 0.29
CSE4P36012 NAB2YGL122C 1578 nt16.83■□□□□ 0.28
CSE4P36012 LSM3YLR438C-A 270 nt16.83■□□□□ 0.28
CSE4P36012 INM2YDR287W 879 nt16.79■□□□□ 0.28
CSE4P36012 YLR281CYLR281C 468 nt16.78■□□□□ 0.28
CSE4P36012 PUS2YGL063W 1113 nt16.76■□□□□ 0.27
CSE4P36012 BSC6YOL137W 1494 nt16.72■□□□□ 0.27
CSE4P36012 DAL1YIR027C 1383 nt16.7■□□□□ 0.26
CSE4P36012 YBL100CYBL100C 315 nt16.7■□□□□ 0.26
CSE4P36012 FIS1YIL065C 468 nt16.67■□□□□ 0.26
CSE4P36012 FPR4YLR449W 1179 nt16.67■□□□□ 0.26
CSE4P36012 WHI5YOR083W 888 nt16.66■□□□□ 0.26
CSE4P36012 TRM9YML014W 840 nt16.56■□□□□ 0.24
CSE4P36012 PHO4YFR034C 939 nt16.55■□□□□ 0.24
CSE4P36012 MOT3YMR070W 1473 nt16.54■□□□□ 0.24
CSE4P36012 FUN26YAL022C 1554 nt16.53■□□□□ 0.24
CSE4P36012 YPR011CYPR011C 981 nt16.42■□□□□ 0.22
CSE4P36012 CCT6YDR188W 1641 nt16.38■□□□□ 0.21
CSE4P36012 DSK2YMR276W 1122 nt16.34■□□□□ 0.21
CSE4P36012 FMP45YDL222C 930 nt16.33■□□□□ 0.2
CSE4P36012 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt16.33■□□□□ 0.2
CSE4P36012 YLR236CYLR236C 324 nt16.32■□□□□ 0.2
CSE4P36012 IMP2'YIL154C 1041 nt16.25■□□□□ 0.19
CSE4P36012 YCH1YGR203W 447 nt16.19■□□□□ 0.18
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