Protein–RNA interactions for Protein: P53243

YGR067C, Zinc finger protein YGR067C, yeastyeast

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGR067CP53243 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.95■□□□□ 0.62
YGR067CP53243 NSR1YGR159C 1245 nt18.75■□□□□ 0.59
YGR067CP53243 NOP1YDL014W 984 nt18.44■□□□□ 0.54
YGR067CP53243 YKL036CYKL036C 393 nt17.11■□□□□ 0.33
YGR067CP53243 MDJ1YFL016C 1536 nt16.58■□□□□ 0.24
YGR067CP53243 Q0297Q0297 156 nt16.18■□□□□ 0.18
YGR067CP53243 SRX1YKL086W 384 nt16.12■□□□□ 0.17
YGR067CP53243 YJL027CYJL027C 417 nt15.97■□□□□ 0.15
YGR067CP53243 SCS3YGL126W 1143 nt15.61■□□□□ 0.09
YGR067CP53243 YCR051WYCR051W 669 nt15.29■□□□□ 0.04
YGR067CP53243 YOL085CYOL085C 342 nt14.8□□□□□ -0.04
YGR067CP53243 DBP2YNL112W 1641 nt14.7□□□□□ -0.06
YGR067CP53243 PKP1YIL042C 1185 nt14.56□□□□□ -0.08
YGR067CP53243 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.54□□□□□ -0.08
YGR067CP53243 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.54□□□□□ -0.08
YGR067CP53243 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.54□□□□□ -0.08
YGR067CP53243 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.54□□□□□ -0.08
YGR067CP53243 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.54□□□□□ -0.08
YGR067CP53243 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.54□□□□□ -0.08
YGR067CP53243 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.54□□□□□ -0.08
YGR067CP53243 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.54□□□□□ -0.08
YGR067CP53243 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.54□□□□□ -0.08
YGR067CP53243 RPP1BYDL130W 321 nt14.51□□□□□ -0.09
YGR067CP53243 CCC1YLR220W 969 nt14.37□□□□□ -0.11
YGR067CP53243 YBR190WYBR190W 312 nt14.11□□□□□ -0.15
YGR067CP53243 ATS1YAL020C 1002 nt13.97□□□□□ -0.17
YGR067CP53243 SCJ1YMR214W 1134 nt13.92□□□□□ -0.18
YGR067CP53243 PET122YER153C 765 nt13.86□□□□□ -0.19
YGR067CP53243 RVS167YDR388W 1449 nt13.84□□□□□ -0.19
YGR067CP53243 RTC3YHR087W 336 nt13.79□□□□□ -0.2
YGR067CP53243 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.77□□□□□ -0.21
YGR067CP53243 SSA3YBL075C 1950 nt13.75□□□□□ -0.21
YGR067CP53243 SCR1SCR1 522 nt13.73□□□□□ -0.21
YGR067CP53243 RRN5YLR141W 1092 nt13.45□□□□□ -0.26
YGR067CP53243 SHR5YOL110W 714 nt13.39□□□□□ -0.27
YGR067CP53243 YDJ1YNL064C 1230 nt13.33□□□□□ -0.28
YGR067CP53243 RSB1YOR049C 1065 nt13.21□□□□□ -0.29
YGR067CP53243 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.19□□□□□ -0.3
YGR067CP53243 PUT4YOR348C 1884 nt13.01□□□□□ -0.33
YGR067CP53243 GAR1YHR089C 618 nt13□□□□□ -0.33
YGR067CP53243 DEP1YAL013W 1218 nt12.96□□□□□ -0.33
YGR067CP53243 URN1YPR152C 1398 nt12.95□□□□□ -0.34
YGR067CP53243 PST2YDR032C 597 nt12.92□□□□□ -0.34
YGR067CP53243 RPN10YHR200W 807 nt12.8□□□□□ -0.36
YGR067CP53243 YNL208WYNL208W 600 nt12.78□□□□□ -0.36
YGR067CP53243 OPI9YLR338W 858 nt12.75□□□□□ -0.37
YGR067CP53243 SAH1YER043C 1350 nt12.64□□□□□ -0.39
YGR067CP53243 POA1YBR022W 534 nt12.63□□□□□ -0.39
YGR067CP53243 ARE1YCR048W 1833 nt12.58□□□□□ -0.4
YGR067CP53243 TIR1YER011W 765 nt12.57□□□□□ -0.4
YGR067CP53243 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.5□□□□□ -0.41
YGR067CP53243 YKL097CYKL097C 411 nt12.47□□□□□ -0.41
YGR067CP53243 BSC6YOL137W 1494 nt12.46□□□□□ -0.42
YGR067CP53243 SSA1YAL005C 1929 nt12.39□□□□□ -0.43
YGR067CP53243 PUN1YLR414C 792 nt12.39□□□□□ -0.43
YGR067CP53243 SHU1YHL006C 453 nt12.38□□□□□ -0.43
YGR067CP53243 YJR018WYJR018W 363 nt12.36□□□□□ -0.43
YGR067CP53243 BUD23YCR047C 828 nt12.23□□□□□ -0.45
YGR067CP53243 SRB2YHR041C 633 nt12.21□□□□□ -0.45
YGR067CP53243 PTC2YER089C 1395 nt12.2□□□□□ -0.46
YGR067CP53243 YJR120WYJR120W 351 nt12.2□□□□□ -0.46
YGR067CP53243 SSA4YER103W 1929 nt12.17□□□□□ -0.46
YGR067CP53243 SPT5YML010W 3192 nt12.15□□□□□ -0.46
YGR067CP53243 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.15□□□□□ -0.46
YGR067CP53243 RPP2BYDR382W 333 nt12.14□□□□□ -0.47
YGR067CP53243 FPS1YLL043W 2010 nt12.09□□□□□ -0.47
YGR067CP53243 NAB2YGL122C 1578 nt12.04□□□□□ -0.48
YGR067CP53243 WWM1YFL010C 636 nt12.03□□□□□ -0.48
YGR067CP53243 YGR021WYGR021W 873 nt12□□□□□ -0.49
YGR067CP53243 NVJ2YPR091C 2313 nt11.99□□□□□ -0.49
YGR067CP53243 HOM6YJR139C 1080 nt11.96□□□□□ -0.49
YGR067CP53243 YOR139CYOR139C 393 nt11.95□□□□□ -0.5
YGR067CP53243 BDH2YAL061W 1254 nt11.92□□□□□ -0.5
YGR067CP53243 INM2YDR287W 879 nt11.91□□□□□ -0.5
YGR067CP53243 MNP1YGL068W 585 nt11.91□□□□□ -0.5
YGR067CP53243 FIS1YIL065C 468 nt11.91□□□□□ -0.5
YGR067CP53243 DAL1YIR027C 1383 nt11.91□□□□□ -0.5
YGR067CP53243 PAC11YDR488C 1602 nt11.87□□□□□ -0.51
YGR067CP53243 FPR4YLR449W 1179 nt11.87□□□□□ -0.51
YGR067CP53243 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.85□□□□□ -0.51
YGR067CP53243 NPL3YDR432W 1245 nt11.83□□□□□ -0.52
YGR067CP53243 YBL100CYBL100C 315 nt11.82□□□□□ -0.52
YGR067CP53243 PHO4YFR034C 939 nt11.8□□□□□ -0.52
YGR067CP53243 RKM5YLR137W 1104 nt11.78□□□□□ -0.52
YGR067CP53243 LSM3YLR438C-A 270 nt11.77□□□□□ -0.53
YGR067CP53243 YOL037CYOL037C 354 nt11.76□□□□□ -0.53
YGR067CP53243 MEP2YNL142W 1500 nt11.74□□□□□ -0.53
YGR067CP53243 BDF1YLR399C 2061 nt11.7□□□□□ -0.54
YGR067CP53243 FUN26YAL022C 1554 nt11.68□□□□□ -0.54
YGR067CP53243 TRM9YML014W 840 nt11.66□□□□□ -0.54
YGR067CP53243 CCT6YDR188W 1641 nt11.56□□□□□ -0.56
YGR067CP53243 YPS1YLR120C 1710 nt11.54□□□□□ -0.56
YGR067CP53243 DCW1YKL046C 1350 nt11.54□□□□□ -0.56
YGR067CP53243 TAT1YBR069C 1860 nt11.53□□□□□ -0.56
YGR067CP53243 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.5□□□□□ -0.57
YGR067CP53243 YDR095CYDR095C 411 nt11.49□□□□□ -0.57
YGR067CP53243 ALF1YNL148C 765 nt11.49□□□□□ -0.57
YGR067CP53243 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.46□□□□□ -0.57
YGR067CP53243 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.46□□□□□ -0.57
YGR067CP53243 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms