RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C GPI8P49018 411 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ESBP6P53918 673 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C VPS20Q04272 221 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C PHM6Q05637 104 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ENT2Q05785 613 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C RSC3Q06639 885 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MET7Q08645 548 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ATP16Q12165 160 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ULS1Q08562 1619 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TUS1Q06412 1307 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C CDC34P14682 295 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SEC66P33754 206 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TMN3P40071 706 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YIL001WP40560 513 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C STB1P42845 420 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SPO74P45819 413 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ECL1P48235 211 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YGR045CP53229 120 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C PGA2P53903 129 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C GYL1Q04322 720 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C HDA2Q06629 674 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TRM8Q12009 286 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C IES3Q12345 250 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C PSK1P31374 1356 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C AI3P03877 415 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YML002WP0CF17 737 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C CMP2P14747 604 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ADE2P21264 571 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C STE13P33894 931 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SPT8P38915 602 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C VID27P40157 782 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YGL242CP53066 181 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C EFM5P53200 248 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SIW14P53965 281 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MDM1Q01846 1127 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MFM1Q02783 413 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C CWC21Q03375 135 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MMR1Q06324 491 aa3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C WRS1Q12109 432 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C UTP10P42945 1769 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C PDR12Q02785 1511 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C PGK1P00560 416 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C PMS1P14242 873 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MCM3P24279 971 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C KCC4P25389 1037 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C COQ2P32378 372 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YEL043WP32618 956 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C CPR5P35176 225 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C DBP7P36120 742 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C GPT2P36148 743 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C RDH54P38086 958 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C RFC5P38251 354 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YHR218WP38899 603 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C FCY21P40039 528 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MEP1P40260 492 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TIM54P47045 478 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C VPS53P47061 822 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C URB2P47108 1174 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C PRP31P49704 494 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C HOP2P53187 214 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SEC5P89102 971 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YKR005CQ02203 525 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SWP1Q02795 286 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ROD1Q02805 837 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C RNH1Q04740 348 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MDM36Q06820 579 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YPL277CQ08989 487 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C REC8Q12188 680 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YDR215CQ12240 137 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C OSH2Q12451 1283 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TY2B-FP0CX63 1770 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TY2B-CP25384 1770 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TY2B-DR2Q03494 1770 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TY1B-DR1Q03855 1755 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TY2B-OR1Q12113 1770 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TY2B-DR1Q12472 1770 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TY2B-BQ12491 1770 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TY2B-OR2Q12501 1770 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TY1B-DR3Q99231 1755 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MDS3P53094 1487 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C KAR1P11927 433 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C KSS1P14681 368 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SUI2P20459 304 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C OSM1P21375 501 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C PLC1P32383 869 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SSE1P32589 693 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C STP2P38704 541 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SWD1P39706 426 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ESL1P40456 1118 aa3.37□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YJR142WP47173 342 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.8 ms