Protein–RNA interactions for Protein: Q12240

YDR215C, Uncharacterized protein YDR215C, yeastyeast

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR215CQ12240 NSR1YGR159C 1245 nt15.42■□□□□ 0.06
YDR215CQ12240 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.27■□□□□ 0.04
YDR215CQ12240 NOP1YDL014W 984 nt14.83□□□□□ -0.04
YDR215CQ12240 MDJ1YFL016C 1536 nt14.14□□□□□ -0.15
YDR215CQ12240 YKL036CYKL036C 393 nt13.69□□□□□ -0.22
YDR215CQ12240 YJL027CYJL027C 417 nt12.99□□□□□ -0.33
YDR215CQ12240 SRX1YKL086W 384 nt12.86□□□□□ -0.35
YDR215CQ12240 Q0297Q0297 156 nt12.8□□□□□ -0.36
YDR215CQ12240 SCS3YGL126W 1143 nt12.6□□□□□ -0.39
YDR215CQ12240 DBP2YNL112W 1641 nt12.34□□□□□ -0.43
YDR215CQ12240 YCR051WYCR051W 669 nt12.24□□□□□ -0.45
YDR215CQ12240 YBR190WYBR190W 312 nt12.2□□□□□ -0.46
YDR215CQ12240 SCJ1YMR214W 1134 nt11.98□□□□□ -0.49
YDR215CQ12240 YGR139WYGR139W 339 nt11.94□□□□□ -0.5
YDR215CQ12240 SSA3YBL075C 1950 nt11.93□□□□□ -0.5
YDR215CQ12240 RTC3YHR087W 336 nt11.87□□□□□ -0.51
YDR215CQ12240 YOL085CYOL085C 342 nt11.78□□□□□ -0.52
YDR215CQ12240 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.72□□□□□ -0.53
YDR215CQ12240 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.72□□□□□ -0.53
YDR215CQ12240 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.72□□□□□ -0.53
YDR215CQ12240 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.72□□□□□ -0.53
YDR215CQ12240 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.72□□□□□ -0.53
YDR215CQ12240 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.72□□□□□ -0.53
YDR215CQ12240 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.72□□□□□ -0.53
YDR215CQ12240 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.72□□□□□ -0.53
YDR215CQ12240 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.72□□□□□ -0.53
YDR215CQ12240 CCC1YLR220W 969 nt11.69□□□□□ -0.54
YDR215CQ12240 MOT3YMR070W 1473 nt11.53□□□□□ -0.56
YDR215CQ12240 RPP1BYDL130W 321 nt11.51□□□□□ -0.57
YDR215CQ12240 Q0182Q0182 405 nt11.51□□□□□ -0.57
YDR215CQ12240 RVS167YDR388W 1449 nt11.48□□□□□ -0.57
YDR215CQ12240 PUT4YOR348C 1884 nt11.47□□□□□ -0.57
YDR215CQ12240 ATS1YAL020C 1002 nt11.45□□□□□ -0.58
YDR215CQ12240 PKP1YIL042C 1185 nt11.43□□□□□ -0.58
YDR215CQ12240 ARE1YCR048W 1833 nt11.11□□□□□ -0.63
YDR215CQ12240 NME1NME1 340 nt11.08□□□□□ -0.64
YDR215CQ12240 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.05□□□□□ -0.64
YDR215CQ12240 POA1YBR022W 534 nt11.04□□□□□ -0.64
YDR215CQ12240 PET122YER153C 765 nt10.97□□□□□ -0.65
YDR215CQ12240 SAH1YER043C 1350 nt10.95□□□□□ -0.66
YDR215CQ12240 URN1YPR152C 1398 nt10.95□□□□□ -0.66
YDR215CQ12240 SHR5YOL110W 714 nt10.95□□□□□ -0.66
YDR215CQ12240 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.94□□□□□ -0.66
YDR215CQ12240 SCR1SCR1 522 nt10.93□□□□□ -0.66
YDR215CQ12240 OPI9YLR338W 858 nt10.91□□□□□ -0.66
YDR215CQ12240 BSC6YOL137W 1494 nt10.91□□□□□ -0.66
YDR215CQ12240 SPT5YML010W 3192 nt10.84□□□□□ -0.67
YDR215CQ12240 DEP1YAL013W 1218 nt10.78□□□□□ -0.68
YDR215CQ12240 CSM2YIL132C 642 nt10.71□□□□□ -0.69
YDR215CQ12240 YDJ1YNL064C 1230 nt10.7□□□□□ -0.7
YDR215CQ12240 RPN10YHR200W 807 nt10.66□□□□□ -0.7
YDR215CQ12240 RRN5YLR141W 1092 nt10.66□□□□□ -0.7
YDR215CQ12240 SSA4YER103W 1929 nt10.64□□□□□ -0.71
YDR215CQ12240 BUD23YCR047C 828 nt10.63□□□□□ -0.71
YDR215CQ12240 YNL208WYNL208W 600 nt10.58□□□□□ -0.72
YDR215CQ12240 PUN1YLR414C 792 nt10.57□□□□□ -0.72
YDR215CQ12240 PTC2YER089C 1395 nt10.52□□□□□ -0.72
YDR215CQ12240 GAR1YHR089C 618 nt10.52□□□□□ -0.73
YDR215CQ12240 PAU21YOR394W 495 nt10.52□□□□□ -0.73
YDR215CQ12240 PAU22YPL282C 495 nt10.52□□□□□ -0.73
YDR215CQ12240 PST2YDR032C 597 nt10.51□□□□□ -0.73
YDR215CQ12240 NAB2YGL122C 1578 nt10.47□□□□□ -0.73
YDR215CQ12240 RSB1YOR049C 1065 nt10.46□□□□□ -0.73
YDR215CQ12240 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.44□□□□□ -0.74
YDR215CQ12240 ARO7YPR060C 771 nt10.44□□□□□ -0.74
YDR215CQ12240 YJR018WYJR018W 363 nt10.42□□□□□ -0.74
YDR215CQ12240 YKL097CYKL097C 411 nt10.39□□□□□ -0.75
YDR215CQ12240 PAM17YKR065C 594 nt10.35□□□□□ -0.75
YDR215CQ12240 BDF1YLR399C 2061 nt10.32□□□□□ -0.76
YDR215CQ12240 MEP2YNL142W 1500 nt10.3□□□□□ -0.76
YDR215CQ12240 FIS1YIL065C 468 nt10.27□□□□□ -0.77
YDR215CQ12240 DAL1YIR027C 1383 nt10.23□□□□□ -0.77
YDR215CQ12240 YJR120WYJR120W 351 nt10.18□□□□□ -0.78
YDR215CQ12240 TIR1YER011W 765 nt10.16□□□□□ -0.78
YDR215CQ12240 FPR4YLR449W 1179 nt10.16□□□□□ -0.78
YDR215CQ12240 REG2YBR050C 1017 nt10.16□□□□□ -0.78
YDR215CQ12240 TAT1YBR069C 1860 nt10.16□□□□□ -0.78
YDR215CQ12240 VAR1Q0140 1197 nt10.15□□□□□ -0.78
YDR215CQ12240 PHO4YFR034C 939 nt10.13□□□□□ -0.79
YDR215CQ12240 YPS1YLR120C 1710 nt10.13□□□□□ -0.79
YDR215CQ12240 DCW1YKL046C 1350 nt10.13□□□□□ -0.79
YDR215CQ12240 INM2YDR287W 879 nt10.11□□□□□ -0.79
YDR215CQ12240 RPP2BYDR382W 333 nt10.09□□□□□ -0.79
YDR215CQ12240 YDR509WYDR509W 348 nt10.09□□□□□ -0.79
YDR215CQ12240 SSA1YAL005C 1929 nt10.07□□□□□ -0.8
YDR215CQ12240 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.02□□□□□ -0.81
YDR215CQ12240 BUR6YER159C 429 nt10.01□□□□□ -0.81
YDR215CQ12240 YDR095CYDR095C 411 nt9.98□□□□□ -0.81
YDR215CQ12240 EMI2YDR516C 1503 nt9.97□□□□□ -0.81
YDR215CQ12240 YBR220CYBR220C 1683 nt9.97□□□□□ -0.81
YDR215CQ12240 NVJ2YPR091C 2313 nt9.97□□□□□ -0.81
YDR215CQ12240 BMT5YIL096C 1011 nt9.94□□□□□ -0.82
YDR215CQ12240 YMR090WYMR090W 684 nt9.93□□□□□ -0.82
YDR215CQ12240 YBL100CYBL100C 315 nt9.93□□□□□ -0.82
YDR215CQ12240 SHU1YHL006C 453 nt9.91□□□□□ -0.82
YDR215CQ12240 Q0010Q0010 387 nt9.88□□□□□ -0.83
YDR215CQ12240 FPS1YLL043W 2010 nt9.87□□□□□ -0.83
YDR215CQ12240 PAC11YDR488C 1602 nt9.86□□□□□ -0.83
YDR215CQ12240 YDL221WYDL221W 552 nt9.86□□□□□ -0.83
YDR215CQ12240 Q0144Q0144 330 nt9.85□□□□□ -0.83
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