Protein–RNA interactions for Protein: Q02203

YKR005C, Uncharacterized protein YKR005C, yeastyeast

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR005CQ02203 NSR1YGR159C 1245 nt17.69■□□□□ 0.42
YKR005CQ02203 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.48■□□□□ 0.39
YKR005CQ02203 NOP1YDL014W 984 nt16.98■□□□□ 0.31
YKR005CQ02203 MDJ1YFL016C 1536 nt16.65■□□□□ 0.26
YKR005CQ02203 YKL036CYKL036C 393 nt15.49■□□□□ 0.07
YKR005CQ02203 SSA3YBL075C 1950 nt15.36■□□□□ 0.05
YKR005CQ02203 YJL027CYJL027C 417 nt15.25■□□□□ 0.03
YKR005CQ02203 SRX1YKL086W 384 nt14.81□□□□□ -0.04
YKR005CQ02203 Q0297Q0297 156 nt14.79□□□□□ -0.04
YKR005CQ02203 YBR190WYBR190W 312 nt14.43□□□□□ -0.1
YKR005CQ02203 DBP2YNL112W 1641 nt14.34□□□□□ -0.11
YKR005CQ02203 RTC3YHR087W 336 nt14.06□□□□□ -0.16
YKR005CQ02203 YCR051WYCR051W 669 nt14.02□□□□□ -0.17
YKR005CQ02203 SCS3YGL126W 1143 nt13.97□□□□□ -0.17
YKR005CQ02203 PUT4YOR348C 1884 nt13.87□□□□□ -0.19
YKR005CQ02203 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.48□□□□□ -0.25
YKR005CQ02203 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.48□□□□□ -0.25
YKR005CQ02203 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.48□□□□□ -0.25
YKR005CQ02203 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.48□□□□□ -0.25
YKR005CQ02203 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.48□□□□□ -0.25
YKR005CQ02203 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.48□□□□□ -0.25
YKR005CQ02203 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.48□□□□□ -0.25
YKR005CQ02203 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.48□□□□□ -0.25
YKR005CQ02203 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.48□□□□□ -0.25
YKR005CQ02203 YOL085CYOL085C 342 nt13.4□□□□□ -0.26
YKR005CQ02203 SSA4YER103W 1929 nt13.39□□□□□ -0.27
YKR005CQ02203 SPT5YML010W 3192 nt13.38□□□□□ -0.27
YKR005CQ02203 POA1YBR022W 534 nt13.35□□□□□ -0.27
YKR005CQ02203 ARE1YCR048W 1833 nt13.32□□□□□ -0.28
YKR005CQ02203 CCC1YLR220W 969 nt13.31□□□□□ -0.28
YKR005CQ02203 RPP1BYDL130W 321 nt13.27□□□□□ -0.29
YKR005CQ02203 BSC6YOL137W 1494 nt13.25□□□□□ -0.29
YKR005CQ02203 RVS167YDR388W 1449 nt13.23□□□□□ -0.29
YKR005CQ02203 PKP1YIL042C 1185 nt13.18□□□□□ -0.3
YKR005CQ02203 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.15□□□□□ -0.3
YKR005CQ02203 SCJ1YMR214W 1134 nt13.02□□□□□ -0.33
YKR005CQ02203 SAH1YER043C 1350 nt13□□□□□ -0.33
YKR005CQ02203 BDF1YLR399C 2061 nt12.99□□□□□ -0.33
YKR005CQ02203 PAC11YDR488C 1602 nt12.85□□□□□ -0.35
YKR005CQ02203 URN1YPR152C 1398 nt12.82□□□□□ -0.36
YKR005CQ02203 OPI9YLR338W 858 nt12.82□□□□□ -0.36
YKR005CQ02203 TAT1YBR069C 1860 nt12.78□□□□□ -0.36
YKR005CQ02203 BUD23YCR047C 828 nt12.76□□□□□ -0.37
YKR005CQ02203 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.69□□□□□ -0.38
YKR005CQ02203 PET122YER153C 765 nt12.66□□□□□ -0.38
YKR005CQ02203 SHR5YOL110W 714 nt12.56□□□□□ -0.4
YKR005CQ02203 NVJ2YPR091C 2313 nt12.54□□□□□ -0.4
YKR005CQ02203 MEP2YNL142W 1500 nt12.54□□□□□ -0.4
YKR005CQ02203 DEP1YAL013W 1218 nt12.54□□□□□ -0.4
YKR005CQ02203 SCR1SCR1 522 nt12.54□□□□□ -0.4
YKR005CQ02203 ATS1YAL020C 1002 nt12.46□□□□□ -0.41
YKR005CQ02203 PTC2YER089C 1395 nt12.45□□□□□ -0.42
YKR005CQ02203 PUN1YLR414C 792 nt12.43□□□□□ -0.42
YKR005CQ02203 NAB2YGL122C 1578 nt12.42□□□□□ -0.42
YKR005CQ02203 RPN10YHR200W 807 nt12.38□□□□□ -0.43
YKR005CQ02203 DCW1YKL046C 1350 nt12.33□□□□□ -0.44
YKR005CQ02203 YDJ1YNL064C 1230 nt12.32□□□□□ -0.44
YKR005CQ02203 RRN5YLR141W 1092 nt12.29□□□□□ -0.44
YKR005CQ02203 YBR220CYBR220C 1683 nt12.24□□□□□ -0.45
YKR005CQ02203 YNL208WYNL208W 600 nt12.22□□□□□ -0.45
YKR005CQ02203 FIS1YIL065C 468 nt12.18□□□□□ -0.46
YKR005CQ02203 YJR018WYJR018W 363 nt12.15□□□□□ -0.46
YKR005CQ02203 EMI2YDR516C 1503 nt12.12□□□□□ -0.47
YKR005CQ02203 YMR090WYMR090W 684 nt12.09□□□□□ -0.47
YKR005CQ02203 YPS1YLR120C 1710 nt12.08□□□□□ -0.47
YKR005CQ02203 DAL1YIR027C 1383 nt12.07□□□□□ -0.48
YKR005CQ02203 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.05□□□□□ -0.48
YKR005CQ02203 PCH2YBR186W 1695 nt12.04□□□□□ -0.48
YKR005CQ02203 FPR4YLR449W 1179 nt12.03□□□□□ -0.48
YKR005CQ02203 GUT2YIL155C 1950 nt12.02□□□□□ -0.49
YKR005CQ02203 GAR1YHR089C 618 nt12.02□□□□□ -0.49
YKR005CQ02203 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.01□□□□□ -0.49
YKR005CQ02203 RSB1YOR049C 1065 nt11.99□□□□□ -0.49
YKR005CQ02203 SDH1YKL148C 1923 nt11.99□□□□□ -0.49
YKR005CQ02203 PHO4YFR034C 939 nt11.98□□□□□ -0.49
YKR005CQ02203 YDL221WYDL221W 552 nt11.95□□□□□ -0.5
YKR005CQ02203 FPS1YLL043W 2010 nt11.93□□□□□ -0.5
YKR005CQ02203 SEC11YIR022W 504 nt11.92□□□□□ -0.5
YKR005CQ02203 YDR095CYDR095C 411 nt11.85□□□□□ -0.51
YKR005CQ02203 INM2YDR287W 879 nt11.83□□□□□ -0.52
YKR005CQ02203 PIB2YGL023C 1908 nt11.82□□□□□ -0.52
YKR005CQ02203 YJR120WYJR120W 351 nt11.8□□□□□ -0.52
YKR005CQ02203 CAC2YML102W 1407 nt11.79□□□□□ -0.52
YKR005CQ02203 SCC4YER147C 1875 nt11.77□□□□□ -0.53
YKR005CQ02203 PTP1YDL230W 1008 nt11.7□□□□□ -0.54
YKR005CQ02203 RTF1YGL244W 1677 nt11.65□□□□□ -0.55
YKR005CQ02203 UME6YDR207C 2511 nt11.64□□□□□ -0.55
YKR005CQ02203 TIR1YER011W 765 nt11.64□□□□□ -0.55
YKR005CQ02203 YSC84YHR016C 1407 nt11.63□□□□□ -0.55
YKR005CQ02203 RPP2BYDR382W 333 nt11.63□□□□□ -0.55
YKR005CQ02203 IRC15YPL017C 1500 nt11.62□□□□□ -0.55
YKR005CQ02203 RPP2AYOL039W 321 nt11.62□□□□□ -0.55
YKR005CQ02203 YBL100CYBL100C 315 nt11.58□□□□□ -0.56
YKR005CQ02203 GIS3YLR094C 1509 nt11.57□□□□□ -0.56
YKR005CQ02203 PST2YDR032C 597 nt11.57□□□□□ -0.56
YKR005CQ02203 YHL050CYHL050C 2094 nt11.54□□□□□ -0.56
YKR005CQ02203 BOR1YNL275W 1731 nt11.54□□□□□ -0.56
YKR005CQ02203 SSA1YAL005C 1929 nt11.5□□□□□ -0.57
YKR005CQ02203 PTK1YKL198C 1989 nt11.49□□□□□ -0.57
YKR005CQ02203 BOP3YNL042W 1191 nt11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms