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Protein–RNA interactions for Protein: Q12345
IES3, Ino eighty subunit 3, yeast
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250 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
IES3
Q12345
NSR1
YGR159C
1245 nt
18.2
■□□□□ 0.5
IES3
Q12345
YML009W-B
YML009W-B
477 nt
17.64
■□□□□ 0.41
IES3
Q12345
MDJ1
YFL016C
1536 nt
16.86
■□□□□ 0.29
IES3
Q12345
NOP1
YDL014W
984 nt
16.83
■□□□□ 0.28
IES3
Q12345
YJL027C
YJL027C
417 nt
15.44
■□□□□ 0.06
IES3
Q12345
SSA3
YBL075C
1950 nt
15.36
■□□□□ 0.05
IES3
Q12345
YKL036C
YKL036C
393 nt
14.9
□□□□□ -0.02
IES3
Q12345
SRX1
YKL086W
384 nt
14.77
□□□□□ -0.05
IES3
Q12345
DBP2
YNL112W
1641 nt
14.73
□□□□□ -0.05
IES3
Q12345
YBR190W
YBR190W
312 nt
14.62
□□□□□ -0.07
IES3
Q12345
Q0297
Q0297
156 nt
14.6
□□□□□ -0.07
IES3
Q12345
RTC3
YHR087W
336 nt
14.21
□□□□□ -0.13
IES3
Q12345
PUT4
YOR348C
1884 nt
13.94
□□□□□ -0.18
IES3
Q12345
YCR051W
YCR051W
669 nt
13.88
□□□□□ -0.19
IES3
Q12345
TRN1
tP(UGG)A
72 nt
13.82
□□□□□ -0.2
IES3
Q12345
SUF9
tP(UGG)F
72 nt
13.82
□□□□□ -0.2
IES3
Q12345
SUF8
tP(UGG)H
72 nt
13.82
□□□□□ -0.2
IES3
Q12345
tP(UGG)L
tP(UGG)L
72 nt
13.82
□□□□□ -0.2
IES3
Q12345
SUF7
tP(UGG)M
72 nt
13.82
□□□□□ -0.2
IES3
Q12345
tP(UGG)N1
tP(UGG)N1
72 nt
13.82
□□□□□ -0.2
IES3
Q12345
tP(UGG)N2
tP(UGG)N2
72 nt
13.82
□□□□□ -0.2
IES3
Q12345
tP(UGG)O1
tP(UGG)O1
72 nt
13.82
□□□□□ -0.2
IES3
Q12345
SUF11
tP(UGG)O2
72 nt
13.82
□□□□□ -0.2
IES3
Q12345
CCC1
YLR220W
969 nt
13.57
□□□□□ -0.24
IES3
Q12345
RVS167
YDR388W
1449 nt
13.47
□□□□□ -0.25
IES3
Q12345
SCJ1
YMR214W
1134 nt
13.43
□□□□□ -0.26
IES3
Q12345
SSA4
YER103W
1929 nt
13.41
□□□□□ -0.26
IES3
Q12345
POA1
YBR022W
534 nt
13.41
□□□□□ -0.26
IES3
Q12345
ARE1
YCR048W
1833 nt
13.39
□□□□□ -0.27
IES3
Q12345
SPT5
YML010W
3192 nt
13.38
□□□□□ -0.27
IES3
Q12345
BSC6
YOL137W
1494 nt
13.32
□□□□□ -0.28
IES3
Q12345
SCS3
YGL126W
1143 nt
13.25
□□□□□ -0.29
IES3
Q12345
YHR049C-A
YHR049C-A
297 nt
13.24
□□□□□ -0.29
IES3
Q12345
SAH1
YER043C
1350 nt
13.08
□□□□□ -0.31
IES3
Q12345
RPP1B
YDL130W
321 nt
13.07
□□□□□ -0.32
IES3
Q12345
URN1
YPR152C
1398 nt
13
□□□□□ -0.33
IES3
Q12345
BDF1
YLR399C
2061 nt
12.99
□□□□□ -0.33
IES3
Q12345
OPI9
YLR338W
858 nt
12.98
□□□□□ -0.33
IES3
Q12345
YOL085C
YOL085C
342 nt
12.98
□□□□□ -0.33
IES3
Q12345
SHR5
YOL110W
714 nt
12.92
□□□□□ -0.34
IES3
Q12345
BUD23
YCR047C
828 nt
12.86
□□□□□ -0.35
IES3
Q12345
PAC11
YDR488C
1602 nt
12.85
□□□□□ -0.35
IES3
Q12345
PKP1
YIL042C
1185 nt
12.83
□□□□□ -0.36
IES3
Q12345
TAT1
YBR069C
1860 nt
12.81
□□□□□ -0.36
IES3
Q12345
tP(UGG)O3
tP(UGG)O3
72 nt
12.81
□□□□□ -0.36
IES3
Q12345
DEP1
YAL013W
1218 nt
12.77
□□□□□ -0.37
IES3
Q12345
MEP2
YNL142W
1500 nt
12.62
□□□□□ -0.39
IES3
Q12345
RPN10
YHR200W
807 nt
12.62
□□□□□ -0.39
IES3
Q12345
PUN1
YLR414C
792 nt
12.62
□□□□□ -0.39
IES3
Q12345
PET122
YER153C
765 nt
12.6
□□□□□ -0.39
IES3
Q12345
NAB2
YGL122C
1578 nt
12.59
□□□□□ -0.39
IES3
Q12345
PTC2
YER089C
1395 nt
12.57
□□□□□ -0.4
IES3
Q12345
NVJ2
YPR091C
2313 nt
12.5
□□□□□ -0.41
IES3
Q12345
YNL208W
YNL208W
600 nt
12.49
□□□□□ -0.41
IES3
Q12345
YDJ1
YNL064C
1230 nt
12.4
□□□□□ -0.42
IES3
Q12345
YJR018W
YJR018W
363 nt
12.34
□□□□□ -0.43
IES3
Q12345
DCW1
YKL046C
1350 nt
12.33
□□□□□ -0.44
IES3
Q12345
FIS1
YIL065C
468 nt
12.32
□□□□□ -0.44
IES3
Q12345
YMR090W
YMR090W
684 nt
12.29
□□□□□ -0.44
IES3
Q12345
YBR220C
YBR220C
1683 nt
12.29
□□□□□ -0.44
IES3
Q12345
DAL1
YIR027C
1383 nt
12.22
□□□□□ -0.45
IES3
Q12345
EMI2
YDR516C
1503 nt
12.2
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IES3
Q12345
YPS1
YLR120C
1710 nt
12.2
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IES3
Q12345
GAR1
YHR089C
618 nt
12.19
□□□□□ -0.46
IES3
Q12345
YJL225C
YJL225C
5277 nt
12.19
□□□□□ -0.46
IES3
Q12345
YJR120W
YJR120W
351 nt
12.16
□□□□□ -0.46
IES3
Q12345
SCR1
SCR1
522 nt
12.15
□□□□□ -0.46
IES3
Q12345
RRN5
YLR141W
1092 nt
12.14
□□□□□ -0.47
IES3
Q12345
FPR4
YLR449W
1179 nt
12.14
□□□□□ -0.47
IES3
Q12345
YHR165W-A
YHR165W-A
312 nt
12.13
□□□□□ -0.47
IES3
Q12345
PCH2
YBR186W
1695 nt
12.12
□□□□□ -0.47
IES3
Q12345
PHO4
YFR034C
939 nt
12.09
□□□□□ -0.47
IES3
Q12345
SEC11
YIR022W
504 nt
12.09
□□□□□ -0.47
IES3
Q12345
SDH1
YKL148C
1923 nt
12.07
□□□□□ -0.48
IES3
Q12345
GUT2
YIL155C
1950 nt
12.07
□□□□□ -0.48
IES3
Q12345
YDL221W
YDL221W
552 nt
12.03
□□□□□ -0.48
IES3
Q12345
INM2
YDR287W
879 nt
12.03
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IES3
Q12345
YDR095C
YDR095C
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11.98
□□□□□ -0.49
IES3
Q12345
YER088W-B
YER088W-B
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IES3
Q12345
SSA1
YAL005C
1929 nt
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IES3
Q12345
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YDR382W
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IES3
Q12345
SCC4
YER147C
1875 nt
11.85
□□□□□ -0.51
IES3
Q12345
FPS1
YLL043W
2010 nt
11.85
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IES3
Q12345
TIR1
YER011W
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□□□□□ -0.51
IES3
Q12345
CAC2
YML102W
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IES3
Q12345
PTP1
YDL230W
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IES3
Q12345
PIB2
YGL023C
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IES3
Q12345
YBL100C
YBL100C
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□□□□□ -0.53
IES3
Q12345
RPP2A
YOL039W
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11.75
□□□□□ -0.53
IES3
Q12345
RTF1
YGL244W
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IES3
Q12345
RDN37-1
RDN37-1
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□□□□□ -0.54
IES3
Q12345
RDN37-2
RDN37-2
5354 nt
11.69
□□□□□ -0.54
IES3
Q12345
IRC15
YPL017C
1500 nt
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□□□□□ -0.54
IES3
Q12345
SRB2
YHR041C
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□□□□□ -0.54
IES3
Q12345
YSC84
YHR016C
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11.67
□□□□□ -0.54
IES3
Q12345
ATS1
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1002 nt
11.64
□□□□□ -0.55
IES3
Q12345
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YNL148C
765 nt
11.62
□□□□□ -0.55
IES3
Q12345
FUN26
YAL022C
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□□□□□ -0.55
IES3
Q12345
BOR1
YNL275W
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□□□□□ -0.55
IES3
Q12345
RSB1
YOR049C
1065 nt
11.61
□□□□□ -0.55
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