RNA–Protein interactions for RNA: YJL103C

GSM1, Transcript of Putative zinc cluster protein of unknown function, yeast

Gene GSM1, Length 1,857 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GSM1	YJL103C	BAP2	P38084	609 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	RAD55	P38953	406 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	VPS8	P39702	1274 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	TMA108	P40462	946 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	NEO1	P40527	1151 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	HUL4	P40985	892 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	SCW11	P53189	542 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	RSC4	Q02206	625 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	SGD1	Q06132	899 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	PUT4	P15380	627 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	CLB1	P24868	471 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	ROX1	P25042	368 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	YEL043W	P32618	956 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	MRP4	P32902	394 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	UGA2	P38067	497 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	GIP1	P38229	639 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	JEM1	P40358	645 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	XKS1	P42826	600 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	BNA1	P47096	177 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	LSB1	P53281	241 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	UBX4	P54730	416 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	CDC55	Q00362	526 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	ULP1	Q02724	621 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	YIG1	Q08956	461 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	CTT1	P06115	562 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	CKA2	P19454	339 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	AFR1	P33304	620 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	MRPL16	P38064	232 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	MSR1	P38714	643 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	CIN4	P39110	191 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	NIT1	P40447	199 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	ROG3	P43602	733 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	YGR067C	P53243	804 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	YNR040W	P53736	256 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	TAF11	Q04226	346 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	ADY3	Q07732	790 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	RSC58	Q07979	502 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	STB3	Q12427	513 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	VPS3	P23643	1011 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	MCM2	P29469	868 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	MGE1	P38523	228 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	FIR1	P40020	876 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	NUP82	P40368	713 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	SAP4	P53036	818 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	DIP5	P53388	608 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	VPS60	Q03390	229 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.66	not detected
GSM1	YJL103C	YKU80	Q04437	629 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	GNT1	Q12096	491 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	MED1	Q12321	566 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GSM1	YJL103C	LYP1	P32487	611 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	PPQ1	P32945	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	STE13	P33894	931 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	PTH2	P34222	208 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	STV1	P37296	890 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	SGM1	P47166	707 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	ALT1	P52893	592 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	NCS6	P53088	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	ARO80	Q04052	950 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	PHO92	Q06390	306 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	REH1	Q06709	432 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	TRM8	Q12009	286 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	REX3	Q12090	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	TMA17	Q12513	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	CCP1	P00431	361 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	CHS3	P29465	1165 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	HCS1	P34243	683 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	ALG14	P38242	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	MMM1	P41800	426 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	SNZ3	P43545	298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	YJR107W	P47145	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GSM1	YJL103C	SPC105	P53148	917 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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