Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.37■□□□□ 0.85
SEC28P40509 NSR1YGR159C 1245 nt20.36■□□□□ 0.85
SEC28P40509 NOP1YDL014W 984 nt19.73■□□□□ 0.75
SEC28P40509 MDJ1YFL016C 1536 nt18.26■□□□□ 0.51
SEC28P40509 YKL036CYKL036C 393 nt17.98■□□□□ 0.47
SEC28P40509 SRX1YKL086W 384 nt17.18■□□□□ 0.34
SEC28P40509 Q0297Q0297 156 nt17.13■□□□□ 0.33
SEC28P40509 YJL027CYJL027C 417 nt16.9■□□□□ 0.3
SEC28P40509 YCR051WYCR051W 669 nt16.35■□□□□ 0.21
SEC28P40509 SCS3YGL126W 1143 nt16.22■□□□□ 0.19
SEC28P40509 DBP2YNL112W 1641 nt16■□□□□ 0.15
SEC28P40509 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.63■□□□□ 0.09
SEC28P40509 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.63■□□□□ 0.09
SEC28P40509 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.63■□□□□ 0.09
SEC28P40509 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.63■□□□□ 0.09
SEC28P40509 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.63■□□□□ 0.09
SEC28P40509 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.63■□□□□ 0.09
SEC28P40509 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.63■□□□□ 0.09
SEC28P40509 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.63■□□□□ 0.09
SEC28P40509 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.63■□□□□ 0.09
SEC28P40509 YBR190WYBR190W 312 nt15.63■□□□□ 0.09
SEC28P40509 CCC1YLR220W 969 nt15.55■□□□□ 0.08
SEC28P40509 YOL085CYOL085C 342 nt15.54■□□□□ 0.08
SEC28P40509 RPP1BYDL130W 321 nt15.39■□□□□ 0.05
SEC28P40509 PKP1YIL042C 1185 nt15.37■□□□□ 0.05
SEC28P40509 RTC3YHR087W 336 nt15.36■□□□□ 0.05
SEC28P40509 RVS167YDR388W 1449 nt15.17■□□□□ 0.02
SEC28P40509 SCJ1YMR214W 1134 nt14.91□□□□□ -0.02
SEC28P40509 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.74□□□□□ -0.05
SEC28P40509 PET122YER153C 765 nt14.72□□□□□ -0.05
SEC28P40509 SCR1SCR1 522 nt14.59□□□□□ -0.07
SEC28P40509 SHR5YOL110W 714 nt14.51□□□□□ -0.09
SEC28P40509 ATS1YAL020C 1002 nt14.45□□□□□ -0.1
SEC28P40509 RRN5YLR141W 1092 nt14.28□□□□□ -0.12
SEC28P40509 PUT4YOR348C 1884 nt14.28□□□□□ -0.12
SEC28P40509 YDJ1YNL064C 1230 nt14.26□□□□□ -0.13
SEC28P40509 URN1YPR152C 1398 nt14.24□□□□□ -0.13
SEC28P40509 DEP1YAL013W 1218 nt14.19□□□□□ -0.14
SEC28P40509 RPN10YHR200W 807 nt14.06□□□□□ -0.16
SEC28P40509 OPI9YLR338W 858 nt14.06□□□□□ -0.16
SEC28P40509 SAH1YER043C 1350 nt14.02□□□□□ -0.17
SEC28P40509 GAR1YHR089C 618 nt14.01□□□□□ -0.17
SEC28P40509 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.98□□□□□ -0.17
SEC28P40509 RSB1YOR049C 1065 nt13.98□□□□□ -0.17
SEC28P40509 ARE1YCR048W 1833 nt13.97□□□□□ -0.17
SEC28P40509 YNL208WYNL208W 600 nt13.94□□□□□ -0.18
SEC28P40509 POA1YBR022W 534 nt13.88□□□□□ -0.19
SEC28P40509 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.85□□□□□ -0.19
SEC28P40509 SSA3YBL075C 1950 nt13.74□□□□□ -0.21
SEC28P40509 PUN1YLR414C 792 nt13.69□□□□□ -0.22
SEC28P40509 BSC6YOL137W 1494 nt13.6□□□□□ -0.23
SEC28P40509 BUD23YCR047C 828 nt13.58□□□□□ -0.24
SEC28P40509 YJR018WYJR018W 363 nt13.58□□□□□ -0.24
SEC28P40509 PTC2YER089C 1395 nt13.54□□□□□ -0.24
SEC28P40509 TIR1YER011W 765 nt13.53□□□□□ -0.24
SEC28P40509 PST2YDR032C 597 nt13.39□□□□□ -0.27
SEC28P40509 NAB2YGL122C 1578 nt13.39□□□□□ -0.27
SEC28P40509 SSA1YAL005C 1929 nt13.36□□□□□ -0.27
SEC28P40509 RPP2BYDR382W 333 nt13.32□□□□□ -0.28
SEC28P40509 YJR120WYJR120W 351 nt13.21□□□□□ -0.29
SEC28P40509 FPR4YLR449W 1179 nt13.21□□□□□ -0.29
SEC28P40509 DAL1YIR027C 1383 nt13.18□□□□□ -0.3
SEC28P40509 INM2YDR287W 879 nt13.13□□□□□ -0.31
SEC28P40509 FIS1YIL065C 468 nt13.11□□□□□ -0.31
SEC28P40509 PHO4YFR034C 939 nt13.04□□□□□ -0.32
SEC28P40509 SRB2YHR041C 633 nt13.03□□□□□ -0.32
SEC28P40509 YBL100CYBL100C 315 nt12.97□□□□□ -0.33
SEC28P40509 BDH2YAL061W 1254 nt12.95□□□□□ -0.34
SEC28P40509 SPT5YML010W 3192 nt12.93□□□□□ -0.34
SEC28P40509 SHU1YHL006C 453 nt12.91□□□□□ -0.34
SEC28P40509 WWM1YFL010C 636 nt12.89□□□□□ -0.35
SEC28P40509 Q0182Q0182 405 nt12.83□□□□□ -0.36
SEC28P40509 YKL097CYKL097C 411 nt12.83□□□□□ -0.36
SEC28P40509 YPS1YLR120C 1710 nt12.82□□□□□ -0.36
SEC28P40509 YGR021WYGR021W 873 nt12.8□□□□□ -0.36
SEC28P40509 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.8□□□□□ -0.36
SEC28P40509 FUN26YAL022C 1554 nt12.8□□□□□ -0.36
SEC28P40509 TRM9YML014W 840 nt12.79□□□□□ -0.36
SEC28P40509 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.78□□□□□ -0.36
SEC28P40509 MEP2YNL142W 1500 nt12.78□□□□□ -0.36
SEC28P40509 LSM3YLR438C-A 270 nt12.74□□□□□ -0.37
SEC28P40509 ALF1YNL148C 765 nt12.74□□□□□ -0.37
SEC28P40509 YDR095CYDR095C 411 nt12.72□□□□□ -0.37
SEC28P40509 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.7□□□□□ -0.38
SEC28P40509 HOM6YJR139C 1080 nt12.67□□□□□ -0.38
SEC28P40509 SSA4YER103W 1929 nt12.66□□□□□ -0.38
SEC28P40509 CCT6YDR188W 1641 nt12.6□□□□□ -0.39
SEC28P40509 MNP1YGL068W 585 nt12.6□□□□□ -0.39
SEC28P40509 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.59□□□□□ -0.39
SEC28P40509 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.59□□□□□ -0.39
SEC28P40509 DCW1YKL046C 1350 nt12.56□□□□□ -0.4
SEC28P40509 RKM5YLR137W 1104 nt12.51□□□□□ -0.41
SEC28P40509 RPP2AYOL039W 321 nt12.51□□□□□ -0.41
SEC28P40509 YMR090WYMR090W 684 nt12.45□□□□□ -0.42
SEC28P40509 SIS1YNL007C 1059 nt12.43□□□□□ -0.42
SEC28P40509 EMI2YDR516C 1503 nt12.42□□□□□ -0.42
SEC28P40509 PTP1YDL230W 1008 nt12.39□□□□□ -0.43
SEC28P40509 YOL037CYOL037C 354 nt12.35□□□□□ -0.43
SEC28P40509 CAC2YML102W 1407 nt12.34□□□□□ -0.43
SEC28P40509 NPL3YDR432W 1245 nt12.33□□□□□ -0.44
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