Protein–RNA interactions for Protein: Q12078

SMF3, Iron transporter SMF3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMF3Q12078 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.34■□□□□ 0.85
SMF3Q12078 NSR1YGR159C 1245 nt20.11■□□□□ 0.81
SMF3Q12078 NOP1YDL014W 984 nt19.77■□□□□ 0.76
SMF3Q12078 YKL036CYKL036C 393 nt18.33■□□□□ 0.52
SMF3Q12078 MDJ1YFL016C 1536 nt17.82■□□□□ 0.44
SMF3Q12078 Q0297Q0297 156 nt17.35■□□□□ 0.37
SMF3Q12078 SRX1YKL086W 384 nt17.29■□□□□ 0.36
SMF3Q12078 YJL027CYJL027C 417 nt17.14■□□□□ 0.33
SMF3Q12078 SCS3YGL126W 1143 nt16.75■□□□□ 0.27
SMF3Q12078 YCR051WYCR051W 669 nt16.43■□□□□ 0.22
SMF3Q12078 YOL085CYOL085C 342 nt15.89■□□□□ 0.13
SMF3Q12078 DBP2YNL112W 1641 nt15.79■□□□□ 0.12
SMF3Q12078 PKP1YIL042C 1185 nt15.66■□□□□ 0.1
SMF3Q12078 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.59■□□□□ 0.09
SMF3Q12078 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.59■□□□□ 0.09
SMF3Q12078 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.59■□□□□ 0.09
SMF3Q12078 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.59■□□□□ 0.09
SMF3Q12078 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.59■□□□□ 0.09
SMF3Q12078 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.59■□□□□ 0.09
SMF3Q12078 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.59■□□□□ 0.09
SMF3Q12078 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.59■□□□□ 0.09
SMF3Q12078 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.59■□□□□ 0.09
SMF3Q12078 RPP1BYDL130W 321 nt15.57■□□□□ 0.08
SMF3Q12078 CCC1YLR220W 969 nt15.46■□□□□ 0.07
SMF3Q12078 YBR190WYBR190W 312 nt15.14■□□□□ 0.01
SMF3Q12078 ATS1YAL020C 1002 nt14.99□□□□□ -0.01
SMF3Q12078 SCJ1YMR214W 1134 nt14.89□□□□□ -0.03
SMF3Q12078 PET122YER153C 765 nt14.88□□□□□ -0.03
SMF3Q12078 RVS167YDR388W 1449 nt14.84□□□□□ -0.03
SMF3Q12078 RTC3YHR087W 336 nt14.83□□□□□ -0.04
SMF3Q12078 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.78□□□□□ -0.04
SMF3Q12078 SCR1SCR1 522 nt14.72□□□□□ -0.05
SMF3Q12078 RRN5YLR141W 1092 nt14.45□□□□□ -0.1
SMF3Q12078 SHR5YOL110W 714 nt14.35□□□□□ -0.11
SMF3Q12078 YDJ1YNL064C 1230 nt14.28□□□□□ -0.12
SMF3Q12078 SSA3YBL075C 1950 nt14.22□□□□□ -0.13
SMF3Q12078 RSB1YOR049C 1065 nt14.18□□□□□ -0.14
SMF3Q12078 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.17□□□□□ -0.14
SMF3Q12078 GAR1YHR089C 618 nt13.97□□□□□ -0.17
SMF3Q12078 DEP1YAL013W 1218 nt13.95□□□□□ -0.18
SMF3Q12078 URN1YPR152C 1398 nt13.92□□□□□ -0.18
SMF3Q12078 PST2YDR032C 597 nt13.87□□□□□ -0.19
SMF3Q12078 PUT4YOR348C 1884 nt13.7□□□□□ -0.22
SMF3Q12078 RPN10YHR200W 807 nt13.7□□□□□ -0.22
SMF3Q12078 YNL208WYNL208W 600 nt13.7□□□□□ -0.22
SMF3Q12078 OPI9YLR338W 858 nt13.69□□□□□ -0.22
SMF3Q12078 SAH1YER043C 1350 nt13.6□□□□□ -0.23
SMF3Q12078 TIR1YER011W 765 nt13.5□□□□□ -0.25
SMF3Q12078 ARE1YCR048W 1833 nt13.48□□□□□ -0.25
SMF3Q12078 YKL097CYKL097C 411 nt13.36□□□□□ -0.27
SMF3Q12078 SSA1YAL005C 1929 nt13.33□□□□□ -0.28
SMF3Q12078 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.31□□□□□ -0.28
SMF3Q12078 SHU1YHL006C 453 nt13.3□□□□□ -0.28
SMF3Q12078 YJR018WYJR018W 363 nt13.28□□□□□ -0.28
SMF3Q12078 PUN1YLR414C 792 nt13.28□□□□□ -0.28
SMF3Q12078 POA1YBR022W 534 nt13.28□□□□□ -0.28
SMF3Q12078 SRB2YHR041C 633 nt13.15□□□□□ -0.3
SMF3Q12078 PTC2YER089C 1395 nt13.12□□□□□ -0.31
SMF3Q12078 YJR120WYJR120W 351 nt13.11□□□□□ -0.31
SMF3Q12078 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.09□□□□□ -0.31
SMF3Q12078 BUD23YCR047C 828 nt13.02□□□□□ -0.33
SMF3Q12078 RPP2BYDR382W 333 nt13.01□□□□□ -0.33
SMF3Q12078 BSC6YOL137W 1494 nt12.97□□□□□ -0.33
SMF3Q12078 Q0182Q0182 405 nt12.95□□□□□ -0.34
SMF3Q12078 WWM1YFL010C 636 nt12.93□□□□□ -0.34
SMF3Q12078 NAB2YGL122C 1578 nt12.93□□□□□ -0.34
SMF3Q12078 YGR021WYGR021W 873 nt12.85□□□□□ -0.35
SMF3Q12078 HOM6YJR139C 1080 nt12.83□□□□□ -0.36
SMF3Q12078 YOR139CYOR139C 393 nt12.83□□□□□ -0.36
SMF3Q12078 MNP1YGL068W 585 nt12.8□□□□□ -0.36
SMF3Q12078 BDH2YAL061W 1254 nt12.78□□□□□ -0.36
SMF3Q12078 DAL1YIR027C 1383 nt12.78□□□□□ -0.36
SMF3Q12078 INM2YDR287W 879 nt12.77□□□□□ -0.37
SMF3Q12078 FIS1YIL065C 468 nt12.77□□□□□ -0.37
SMF3Q12078 FPR4YLR449W 1179 nt12.76□□□□□ -0.37
SMF3Q12078 SPT5YML010W 3192 nt12.7□□□□□ -0.38
SMF3Q12078 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.69□□□□□ -0.38
SMF3Q12078 NPL3YDR432W 1245 nt12.68□□□□□ -0.38
SMF3Q12078 YBL100CYBL100C 315 nt12.68□□□□□ -0.38
SMF3Q12078 PHO4YFR034C 939 nt12.66□□□□□ -0.38
SMF3Q12078 RKM5YLR137W 1104 nt12.64□□□□□ -0.39
SMF3Q12078 LSM3YLR438C-A 270 nt12.62□□□□□ -0.39
SMF3Q12078 SSA4YER103W 1929 nt12.6□□□□□ -0.39
SMF3Q12078 YOL037CYOL037C 354 nt12.58□□□□□ -0.4
SMF3Q12078 FUN26YAL022C 1554 nt12.54□□□□□ -0.4
SMF3Q12078 TRM9YML014W 840 nt12.52□□□□□ -0.41
SMF3Q12078 CCT6YDR188W 1641 nt12.4□□□□□ -0.42
SMF3Q12078 YPS1YLR120C 1710 nt12.38□□□□□ -0.43
SMF3Q12078 ALF1YNL148C 765 nt12.33□□□□□ -0.44
SMF3Q12078 YDR095CYDR095C 411 nt12.32□□□□□ -0.44
SMF3Q12078 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.32□□□□□ -0.44
SMF3Q12078 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.32□□□□□ -0.44
SMF3Q12078 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.32□□□□□ -0.44
SMF3Q12078 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.32□□□□□ -0.44
SMF3Q12078 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.32□□□□□ -0.44
SMF3Q12078 YLR281CYLR281C 468 nt12.3□□□□□ -0.44
SMF3Q12078 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.26□□□□□ -0.45
SMF3Q12078 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.26□□□□□ -0.45
SMF3Q12078 WHI5YOR083W 888 nt12.25□□□□□ -0.45
SMF3Q12078 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.24□□□□□ -0.45
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