Protein–RNA interactions for Protein: Q12513

TMA17, Translation machinery-associated protein 17, yeastyeast

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA17Q12513 NSR1YGR159C 1245 nt15.38■□□□□ 0.05
TMA17Q12513 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.24■□□□□ 0.03
TMA17Q12513 NOP1YDL014W 984 nt14.97□□□□□ -0.01
TMA17Q12513 Q0182Q0182 405 nt14.51□□□□□ -0.09
TMA17Q12513 MDJ1YFL016C 1536 nt14.2□□□□□ -0.14
TMA17Q12513 MOT3YMR070W 1473 nt13.98□□□□□ -0.17
TMA17Q12513 YKL036CYKL036C 393 nt13.56□□□□□ -0.24
TMA17Q12513 SSA3YBL075C 1950 nt13.23□□□□□ -0.29
TMA17Q12513 YJL027CYJL027C 417 nt13.01□□□□□ -0.33
TMA17Q12513 SRX1YKL086W 384 nt12.95□□□□□ -0.34
TMA17Q12513 Q0297Q0297 156 nt12.93□□□□□ -0.34
TMA17Q12513 YBR190WYBR190W 312 nt12.34□□□□□ -0.43
TMA17Q12513 YCR051WYCR051W 669 nt12.23□□□□□ -0.45
TMA17Q12513 DBP2YNL112W 1641 nt12.22□□□□□ -0.45
TMA17Q12513 SSA1YAL005C 1929 nt12.21□□□□□ -0.46
TMA17Q12513 SCS3YGL126W 1143 nt12.14□□□□□ -0.47
TMA17Q12513 RTC3YHR087W 336 nt11.98□□□□□ -0.49
TMA17Q12513 PUT4YOR348C 1884 nt11.87□□□□□ -0.51
TMA17Q12513 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.74□□□□□ -0.53
TMA17Q12513 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.74□□□□□ -0.53
TMA17Q12513 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.74□□□□□ -0.53
TMA17Q12513 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.74□□□□□ -0.53
TMA17Q12513 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.74□□□□□ -0.53
TMA17Q12513 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.74□□□□□ -0.53
TMA17Q12513 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.74□□□□□ -0.53
TMA17Q12513 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.74□□□□□ -0.53
TMA17Q12513 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.74□□□□□ -0.53
TMA17Q12513 YOL085CYOL085C 342 nt11.65□□□□□ -0.54
TMA17Q12513 RPP1BYDL130W 321 nt11.6□□□□□ -0.55
TMA17Q12513 CCC1YLR220W 969 nt11.56□□□□□ -0.56
TMA17Q12513 SSA4YER103W 1929 nt11.51□□□□□ -0.57
TMA17Q12513 RVS167YDR388W 1449 nt11.5□□□□□ -0.57
TMA17Q12513 SPT5YML010W 3192 nt11.49□□□□□ -0.57
TMA17Q12513 POA1YBR022W 534 nt11.39□□□□□ -0.59
TMA17Q12513 ARE1YCR048W 1833 nt11.39□□□□□ -0.59
TMA17Q12513 PKP1YIL042C 1185 nt11.37□□□□□ -0.59
TMA17Q12513 BSC6YOL137W 1494 nt11.34□□□□□ -0.59
TMA17Q12513 FPS1YLL043W 2010 nt11.28□□□□□ -0.6
TMA17Q12513 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.26□□□□□ -0.61
TMA17Q12513 BDF1YLR399C 2061 nt11.16□□□□□ -0.62
TMA17Q12513 SAH1YER043C 1350 nt11.09□□□□□ -0.63
TMA17Q12513 SCJ1YMR214W 1134 nt11.09□□□□□ -0.63
TMA17Q12513 PAC11YDR488C 1602 nt11.08□□□□□ -0.64
TMA17Q12513 SCR1SCR1 522 nt11.06□□□□□ -0.64
TMA17Q12513 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.04□□□□□ -0.64
TMA17Q12513 TAT1YBR069C 1860 nt11.02□□□□□ -0.65
TMA17Q12513 FRE6YLL051C 2139 nt11.01□□□□□ -0.65
TMA17Q12513 RPM1RPM1 483 nt11□□□□□ -0.65
TMA17Q12513 PET122YER153C 765 nt10.98□□□□□ -0.65
TMA17Q12513 URN1YPR152C 1398 nt10.98□□□□□ -0.65
TMA17Q12513 OPI9YLR338W 858 nt10.96□□□□□ -0.65
TMA17Q12513 SHR5YOL110W 714 nt10.95□□□□□ -0.66
TMA17Q12513 BUD23YCR047C 828 nt10.89□□□□□ -0.67
TMA17Q12513 ATS1YAL020C 1002 nt10.85□□□□□ -0.67
TMA17Q12513 NVJ2YPR091C 2313 nt10.83□□□□□ -0.68
TMA17Q12513 YDJ1YNL064C 1230 nt10.79□□□□□ -0.68
TMA17Q12513 MEP2YNL142W 1500 nt10.74□□□□□ -0.69
TMA17Q12513 RPN10YHR200W 807 nt10.7□□□□□ -0.7
TMA17Q12513 RRN5YLR141W 1092 nt10.66□□□□□ -0.7
TMA17Q12513 DEP1YAL013W 1218 nt10.65□□□□□ -0.7
TMA17Q12513 PUN1YLR414C 792 nt10.64□□□□□ -0.71
TMA17Q12513 PTC2YER089C 1395 nt10.63□□□□□ -0.71
TMA17Q12513 NAB2YGL122C 1578 nt10.62□□□□□ -0.71
TMA17Q12513 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.61□□□□□ -0.71
TMA17Q12513 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.61□□□□□ -0.71
TMA17Q12513 YJL225CYJL225C 5277 nt10.58□□□□□ -0.72
TMA17Q12513 DCW1YKL046C 1350 nt10.54□□□□□ -0.72
TMA17Q12513 YNL208WYNL208W 600 nt10.53□□□□□ -0.72
TMA17Q12513 NME1NME1 340 nt10.53□□□□□ -0.72
TMA17Q12513 YBR220CYBR220C 1683 nt10.5□□□□□ -0.73
TMA17Q12513 RSB1YOR049C 1065 nt10.46□□□□□ -0.73
TMA17Q12513 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.45□□□□□ -0.74
TMA17Q12513 GAR1YHR089C 618 nt10.44□□□□□ -0.74
TMA17Q12513 FIS1YIL065C 468 nt10.43□□□□□ -0.74
TMA17Q12513 EMI2YDR516C 1503 nt10.38□□□□□ -0.75
TMA17Q12513 YMR090WYMR090W 684 nt10.37□□□□□ -0.75
TMA17Q12513 YJR018WYJR018W 363 nt10.36□□□□□ -0.75
TMA17Q12513 PCH2YBR186W 1695 nt10.34□□□□□ -0.75
TMA17Q12513 YPS1YLR120C 1710 nt10.34□□□□□ -0.75
TMA17Q12513 GUT2YIL155C 1950 nt10.32□□□□□ -0.76
TMA17Q12513 DAL1YIR027C 1383 nt10.32□□□□□ -0.76
TMA17Q12513 SDH1YKL148C 1923 nt10.28□□□□□ -0.76
TMA17Q12513 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.26□□□□□ -0.77
TMA17Q12513 SEC11YIR022W 504 nt10.25□□□□□ -0.77
TMA17Q12513 YDL221WYDL221W 552 nt10.24□□□□□ -0.77
TMA17Q12513 PHO4YFR034C 939 nt10.24□□□□□ -0.77
TMA17Q12513 FPR4YLR449W 1179 nt10.24□□□□□ -0.77
TMA17Q12513 BSP1YPR171W 1731 nt10.21□□□□□ -0.78
TMA17Q12513 YDR095CYDR095C 411 nt10.15□□□□□ -0.78
TMA17Q12513 TIR1YER011W 765 nt10.15□□□□□ -0.78
TMA17Q12513 Q0010Q0010 387 nt10.14□□□□□ -0.79
TMA17Q12513 PIB2YGL023C 1908 nt10.13□□□□□ -0.79
TMA17Q12513 INM2YDR287W 879 nt10.1□□□□□ -0.79
TMA17Q12513 RPP2BYDR382W 333 nt10.1□□□□□ -0.79
TMA17Q12513 SCC4YER147C 1875 nt10.08□□□□□ -0.8
TMA17Q12513 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.07□□□□□ -0.8
TMA17Q12513 YJR120WYJR120W 351 nt10.06□□□□□ -0.8
TMA17Q12513 CAC2YML102W 1407 nt10.06□□□□□ -0.8
TMA17Q12513 SSN3YPL042C 1668 nt10.06□□□□□ -0.8
TMA17Q12513 UME6YDR207C 2511 nt10.04□□□□□ -0.8
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