RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	EAR1	Q03212	550 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	YML020W	Q03722	664 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	COG4	Q06096	861 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	MRPL50	P53724	139 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	ORC3	P54790	616 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	NDL1	Q06568	189 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	MCM21	Q06675	368 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	EMP46	Q12396	444 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	TYR1	P20049	452 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	SSP1	P38871	571 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	YFL040W	P43562	540 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	SOL4	P53315	255 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	ACL4	Q03771	387 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	FUS2	Q05670	677 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	HIF1	Q12373	385 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	AVL9	Q12500	764 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	KIN1	P13185	1064 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	REC107	P21651	314 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	BEM3	P32873	1128 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	RRN3	P36070	627 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	YKR018C	P36114	725 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	ECM1	P39715	212 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	YER130C	P39959	443 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	MXR1	P40029	184 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	AIM20	P40451	204 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	MTC3	P53077	123 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	SRL4	Q03085	281 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	MSH5	Q12175	901 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPO31	YOR116C	LHS1	P36016	881 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	SHU2	P38957	223 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	YGR016W	P53209	190 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	MDR1	P53258	950 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	ULP1	Q02724	621 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	SPO20	Q04359	397 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	CSI1	Q04368	295 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	SML1	Q04964	104 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	EST2	Q06163	884 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	ICL2	Q12031	575 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	SIR1	P21691	654 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	PIP2	P52960	996 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	NUT1	P53114	1132 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	LSB1	P53281	241 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	GYL1	Q04322	720 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	SPO75	Q07798	868 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	GAS5	Q08193	484 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	PPM2	Q08282	695 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	GSY1	P23337	708 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	ECM25	P32525	599 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	MET1	P36150	593 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	BRN1	P38170	754 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	SHE10	P53075	577 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	PLP1	Q04004	230 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	ERV41	Q04651	352 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	FEX2	Q08991	375 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	SEM1	O94742	89 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	PKC1	P24583	1151 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	IES5	P40060	125 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	PAC11	P40960	533 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	FET4	P40988	552 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	LAM5	P43560	674 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	TEL2	P53038	688 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	KAR5	Q04746	504 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	VTA1	Q06263	330 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	HDA3	Q06623	655 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	CIR2	Q08822	631 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	FEX1	Q08913	375 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	LAM4	P38800	1345 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	GPA1	P08539	472 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	SEC65	P29478	273 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	ATG14	P38270	344 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPO31	YOR116C	YSW1	P38280	609 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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