Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.27■■□□□ 1.64
CSI1Q04368 NSR1YGR159C 1245 nt25.04■■□□□ 1.6
CSI1Q04368 NOP1YDL014W 984 nt24.48■■□□□ 1.51
CSI1Q04368 YKL036CYKL036C 393 nt22.66■■□□□ 1.22
CSI1Q04368 MDJ1YFL016C 1536 nt22.33■■□□□ 1.17
CSI1Q04368 Q0297Q0297 156 nt21.49■■□□□ 1.03
CSI1Q04368 SRX1YKL086W 384 nt21.44■■□□□ 1.02
CSI1Q04368 YJL027CYJL027C 417 nt21.16■□□□□ 0.98
CSI1Q04368 SCS3YGL126W 1143 nt20.68■□□□□ 0.9
CSI1Q04368 YCR051WYCR051W 669 nt20.37■□□□□ 0.85
CSI1Q04368 DBP2YNL112W 1641 nt19.79■□□□□ 0.76
CSI1Q04368 YOL085CYOL085C 342 nt19.67■□□□□ 0.74
CSI1Q04368 PKP1YIL042C 1185 nt19.42■□□□□ 0.7
CSI1Q04368 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.41■□□□□ 0.7
CSI1Q04368 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.41■□□□□ 0.7
CSI1Q04368 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.41■□□□□ 0.7
CSI1Q04368 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.41■□□□□ 0.7
CSI1Q04368 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.41■□□□□ 0.7
CSI1Q04368 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.41■□□□□ 0.7
CSI1Q04368 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.41■□□□□ 0.7
CSI1Q04368 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.41■□□□□ 0.7
CSI1Q04368 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.41■□□□□ 0.7
CSI1Q04368 RPP1BYDL130W 321 nt19.29■□□□□ 0.68
CSI1Q04368 CCC1YLR220W 969 nt19.24■□□□□ 0.67
CSI1Q04368 YBR190WYBR190W 312 nt18.95■□□□□ 0.62
CSI1Q04368 RTC3YHR087W 336 nt18.54■□□□□ 0.56
CSI1Q04368 SCJ1YMR214W 1134 nt18.52■□□□□ 0.56
CSI1Q04368 PET122YER153C 765 nt18.48■□□□□ 0.55
CSI1Q04368 ATS1YAL020C 1002 nt18.48■□□□□ 0.55
CSI1Q04368 RVS167YDR388W 1449 nt18.45■□□□□ 0.54
CSI1Q04368 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.37■□□□□ 0.53
CSI1Q04368 SCR1SCR1 522 nt18.17■□□□□ 0.5
CSI1Q04368 RRN5YLR141W 1092 nt17.94■□□□□ 0.46
CSI1Q04368 SHR5YOL110W 714 nt17.86■□□□□ 0.45
CSI1Q04368 YDJ1YNL064C 1230 nt17.73■□□□□ 0.43
CSI1Q04368 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.59■□□□□ 0.41
CSI1Q04368 RSB1YOR049C 1065 nt17.54■□□□□ 0.4
CSI1Q04368 DEP1YAL013W 1218 nt17.44■□□□□ 0.38
CSI1Q04368 GAR1YHR089C 618 nt17.39■□□□□ 0.37
CSI1Q04368 URN1YPR152C 1398 nt17.39■□□□□ 0.37
CSI1Q04368 PUT4YOR348C 1884 nt17.26■□□□□ 0.35
CSI1Q04368 PST2YDR032C 597 nt17.13■□□□□ 0.33
CSI1Q04368 OPI9YLR338W 858 nt17.12■□□□□ 0.33
CSI1Q04368 YNL208WYNL208W 600 nt17.07■□□□□ 0.32
CSI1Q04368 SAH1YER043C 1350 nt17.06■□□□□ 0.32
CSI1Q04368 RPN10YHR200W 807 nt17.03■□□□□ 0.32
CSI1Q04368 ARE1YCR048W 1833 nt16.96■□□□□ 0.31
CSI1Q04368 TIR1YER011W 765 nt16.79■□□□□ 0.28
CSI1Q04368 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.73■□□□□ 0.27
CSI1Q04368 POA1YBR022W 534 nt16.73■□□□□ 0.27
CSI1Q04368 SSA1YAL005C 1929 nt16.64■□□□□ 0.25
CSI1Q04368 PUN1YLR414C 792 nt16.58■□□□□ 0.24
CSI1Q04368 YJR018WYJR018W 363 nt16.57■□□□□ 0.24
CSI1Q04368 SHU1YHL006C 453 nt16.47■□□□□ 0.23
CSI1Q04368 SRB2YHR041C 633 nt16.47■□□□□ 0.23
CSI1Q04368 YJR120WYJR120W 351 nt16.44■□□□□ 0.22
CSI1Q04368 PTC2YER089C 1395 nt16.43■□□□□ 0.22
CSI1Q04368 YKL097CYKL097C 411 nt16.41■□□□□ 0.22
CSI1Q04368 BSC6YOL137W 1494 nt16.35■□□□□ 0.21
CSI1Q04368 BUD23YCR047C 828 nt16.34■□□□□ 0.21
CSI1Q04368 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.24■□□□□ 0.19
CSI1Q04368 NAB2YGL122C 1578 nt16.17■□□□□ 0.18
CSI1Q04368 RPP2BYDR382W 333 nt16.17■□□□□ 0.18
CSI1Q04368 WWM1YFL010C 636 nt16.1■□□□□ 0.17
CSI1Q04368 FIS1YIL065C 468 nt16.02■□□□□ 0.16
CSI1Q04368 SSA3YBL075C 1950 nt16■□□□□ 0.15
CSI1Q04368 DAL1YIR027C 1383 nt15.99■□□□□ 0.15
CSI1Q04368 FPR4YLR449W 1179 nt15.97■□□□□ 0.15
CSI1Q04368 INM2YDR287W 879 nt15.93■□□□□ 0.14
CSI1Q04368 HOM6YJR139C 1080 nt15.92■□□□□ 0.14
CSI1Q04368 BDH2YAL061W 1254 nt15.91■□□□□ 0.14
CSI1Q04368 MNP1YGL068W 585 nt15.9■□□□□ 0.14
CSI1Q04368 YGR021WYGR021W 873 nt15.89■□□□□ 0.13
CSI1Q04368 PHO4YFR034C 939 nt15.85■□□□□ 0.13
CSI1Q04368 YOR139CYOR139C 393 nt15.85■□□□□ 0.13
CSI1Q04368 YBL100CYBL100C 315 nt15.83■□□□□ 0.12
CSI1Q04368 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.75■□□□□ 0.11
CSI1Q04368 RKM5YLR137W 1104 nt15.68■□□□□ 0.1
CSI1Q04368 LSM3YLR438C-A 270 nt15.68■□□□□ 0.1
CSI1Q04368 FUN26YAL022C 1554 nt15.66■□□□□ 0.1
CSI1Q04368 SPT5YML010W 3192 nt15.6■□□□□ 0.09
CSI1Q04368 NPL3YDR432W 1245 nt15.6■□□□□ 0.09
CSI1Q04368 TRM9YML014W 840 nt15.59■□□□□ 0.09
CSI1Q04368 YPS1YLR120C 1710 nt15.54■□□□□ 0.08
CSI1Q04368 YOL037CYOL037C 354 nt15.52■□□□□ 0.08
CSI1Q04368 CCT6YDR188W 1641 nt15.45■□□□□ 0.06
CSI1Q04368 YDR095CYDR095C 411 nt15.44■□□□□ 0.06
CSI1Q04368 ALF1YNL148C 765 nt15.37■□□□□ 0.05
CSI1Q04368 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.34■□□□□ 0.05
CSI1Q04368 MEP2YNL142W 1500 nt15.33■□□□□ 0.04
CSI1Q04368 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.24■□□□□ 0.03
CSI1Q04368 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.24■□□□□ 0.03
CSI1Q04368 YLR281CYLR281C 468 nt15.22■□□□□ 0.03
CSI1Q04368 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.21■□□□□ 0.03
CSI1Q04368 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.21■□□□□ 0.03
CSI1Q04368 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.21■□□□□ 0.03
CSI1Q04368 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.21■□□□□ 0.03
CSI1Q04368 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.21■□□□□ 0.03
CSI1Q04368 SIS1YNL007C 1059 nt15.2■□□□□ 0.02
CSI1Q04368 WHI5YOR083W 888 nt15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms