RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	RAD61	Q99359	647 aa		5.57	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	COQ1	P18900	473 aa		5.56	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	RIT1	P23796	513 aa		5.56	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	ADP1	P25371	1049 aa		5.56	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	ASF1	P32447	279 aa		5.56	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	VID27	P40157	782 aa		5.56	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	VID28	P40547	921 aa		5.56	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	VPS4	P52917	437 aa		5.56	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	FAR11	P53917	953 aa		5.56	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	YLL054C	Q12244	843 aa		5.56	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	MYO1	P08964	1928 aa		5.56	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	IME2	P32581	645 aa		5.55	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	ANP1	P32629	500 aa		5.55	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	STV1	P37296	890 aa		5.55	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	MAL31	P38156	614 aa		5.55	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	CST26	P38226	397 aa		5.55	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	HST1	P53685	503 aa		5.55	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	ORC3	P54790	616 aa		5.55	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	GDE1	Q02979	1223 aa		5.55	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	YLR278C	Q05854	1341 aa		5.54	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	SAS3	P34218	831 aa		5.54	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	MYO3	P36006	1272 aa		5.54	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	NPA3	P47122	385 aa		5.54	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	CTF18	P49956	741 aa		5.54	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	SAM37	P50110	327 aa		5.54	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	YGR117C	P53270	476 aa		5.54	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	CTR9	P89105	1077 aa		5.54	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	TFC6	Q06339	672 aa		5.54	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	MNL2	Q12205	849 aa		5.54	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	CIT1	P00890	479 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	CBP1	P07252	654 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	CBP3	P21560	335 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	SRM1	P21827	482 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	MAK31	P23059	88 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	PRE8	P23639	250 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	YHL050C	P38721	697 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	TPM2	P40414	161 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	RSM25	P40496	264 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	YGL081W	P53156	320 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	RIM8	P53179	542 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	VPS30	Q02948	557 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	NUT2	Q06213	157 aa		5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	FLP1	P03870	423 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	MSP1	P28737	362 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	YBL028C	P38202	106 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	RIM11	P38615	370 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	BDH2	P39713	417 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	PEA2	P40091	420 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	LSB1	P53281	241 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	SSY1	Q03770	852 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	PMT7	Q06644	662 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	CEX1	Q12453	761 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	AIM44	Q99299	758 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	FRT1	Q99332	602 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	NPR1	P22211	790 aa		5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	RAD53	P22216	821 aa		5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	RFC5	P38251	354 aa		5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	VPS45	P38932	577 aa		5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	DJP1	P40564	432 aa		5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	EPL1	P43572	832 aa		5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	ENT3	P47160	408 aa		5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	GCV1	P48015	400 aa		5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	MTC3	P53077	123 aa		5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	PEX19	Q07418	342 aa		5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	YIG1	Q08956	461 aa		5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	YPL150W	Q12152	901 aa		5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	ROX1	P25042	368 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	RXT2	P38255	430 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	YHR219W	P38900	624 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	CSM2	P40465	213 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53

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