RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeastyeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM10YOL093W FAP1P53971 965 aa17.55■□□□□ 0.4
TRM10YOL093W MTC1P47018 478 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
TRM10YOL093W PRY3P47033 881 aa16.57■□□□□ 0.24
TRM10YOL093W AAD16Q02895 342 aa15.73■□□□□ 0.11
TRM10YOL093W PRI1P10363 409 aa15.62■□□□□ 0.09
TRM10YOL093W YCK3P39962 524 aa15.56■□□□□ 0.08
TRM10YOL093W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
TRM10YOL093W ISW2Q08773 1120 aa14.83□□□□□ -0.04
TRM10YOL093W DRS1P32892 752 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TRM10YOL093W RPG1P38249 964 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRM10YOL093W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRM10YOL093W MRPL32P25348 183 aa14.11□□□□□ -0.15
TRM10YOL093W YGL015CP33199 130 aa13.96□□□□□ -0.17
TRM10YOL093W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
TRM10YOL093W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TRM10YOL093W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TRM10YOL093W REB1P21538 810 aa13.27□□□□□ -0.29
TRM10YOL093W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
TRM10YOL093W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
TRM10YOL093W CDC27P38042 758 aa13.14□□□□□ -0.31
TRM10YOL093W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TRM10YOL093W MAP2P38174 421 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TRM10YOL093W SIS1P25294 352 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
TRM10YOL093W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
TRM10YOL093W AVT3P36062 692 aa12.55□□□□□ -0.4
TRM10YOL093W UBP9P39967 754 aa12.51□□□□□ -0.41
TRM10YOL093W SPT21P35209 758 aa12.49□□□□□ -0.41
TRM10YOL093W DCD1P06773 312 aa12.47□□□□□ -0.41
TRM10YOL093W HOP09932 586 aa12.47□□□□□ -0.41
TRM10YOL093W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TRM10YOL093W TFC8Q12308 588 aa12.44□□□□□ -0.42
TRM10YOL093W TGL3P40308 642 aa12.39□□□□□ -0.43
TRM10YOL093W SCY1P53009 804 aa12.38□□□□□ -0.43
TRM10YOL093W SLX5P32828 619 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
TRM10YOL093W BCH2P36122 765 aa11.98□□□□□ -0.49
TRM10YOL093W YBL029C-AQ3E756 94 aa11.8□□□□□ -0.52
TRM10YOL093W MST1P07236 462 aa11.68□□□□□ -0.54
TRM10YOL093W RIM101P33400 625 aa11.67□□□□□ -0.54
TRM10YOL093W YOR238WQ08634 303 aa11.58□□□□□ -0.56
TRM10YOL093W EPS1P40557 701 aa11.57□□□□□ -0.56
TRM10YOL093W BDF1P35817 686 aa11.56□□□□□ -0.56
TRM10YOL093W VNX1P42839 908 aa11.56□□□□□ -0.56
TRM10YOL093W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TRM10YOL093W SPP1Q03012 353 aa11.48□□□□□ -0.57
TRM10YOL093W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
TRM10YOL093W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data11.38□□□□□ -0.59not detected
TRM10YOL093W YJL171CP46992 396 aa11.38□□□□□ -0.59
TRM10YOL093W WSC3Q12215 556 aa11.37□□□□□ -0.59
TRM10YOL093W FKH1P40466 484 aa11.33□□□□□ -0.6
TRM10YOL093W YAP5P40574 245 aa11.29□□□□□ -0.6
TRM10YOL093W OXP1P28273 1286 aa11.24□□□□□ -0.61
TRM10YOL093W TIF11P38912 153 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TRM10YOL093W PTP3P40048 928 aa11.18□□□□□ -0.62
TRM10YOL093W GTT3P39996 337 aa11.11□□□□□ -0.63
TRM10YOL093W LDB19Q12502 818 aa11.1□□□□□ -0.63
TRM10YOL093W BMT6Q12291 365 aa11.09□□□□□ -0.63
TRM10YOL093W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TRM10YOL093W BBC1P47068 1157 aa11.08□□□□□ -0.64
TRM10YOL093W ULI1P43604 169 aa11□□□□□ -0.65
TRM10YOL093W IOC2Q12072 812 aa10.98□□□□□ -0.65
TRM10YOL093W AI2P03876 854 aa10.96□□□□□ -0.65
TRM10YOL093W RSM7P47150 247 aa10.92□□□□□ -0.66
TRM10YOL093W PIB1Q06651 286 aa10.83□□□□□ -0.68
TRM10YOL093W RTG1P32607 177 aa10.75□□□□□ -0.69
TRM10YOL093W MSB4Q12317 492 aa10.75□□□□□ -0.69
TRM10YOL093W EAP1P36041 632 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
TRM10YOL093W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
TRM10YOL093W NCR1Q12200 1170 aa10.69□□□□□ -0.7
TRM10YOL093W TRP5P00931 707 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRM10YOL093W SET4P42948 560 aa10.63□□□□□ -0.71
TRM10YOL093W YOL036WQ08206 761 aa10.62□□□□□ -0.71
TRM10YOL093W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
TRM10YOL093W SEC61P32915 480 aa10.57□□□□□ -0.72
TRM10YOL093W BCK2P33306 851 aa10.52□□□□□ -0.73
TRM10YOL093W MRM1P25270 412 aa10.49□□□□□ -0.73
TRM10YOL093W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
TRM10YOL093W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TRM10YOL093W YLR271WQ06152 274 aa10.45□□□□□ -0.74
TRM10YOL093W SAP30P38429 201 aa10.43□□□□□ -0.74
TRM10YOL093W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
TRM10YOL093W DBP1P24784 617 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TRM10YOL093W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data10.35□□□□□ -0.75not detected
TRM10YOL093W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
TRM10YOL093W YFR006WP43590 535 aa10.31□□□□□ -0.76
TRM10YOL093W DAN4P47179 1161 aa10.31□□□□□ -0.76
TRM10YOL093W SAM3Q08986 587 aa10.31□□□□□ -0.76
TRM10YOL093W PRE3P38624 215 aa10.3□□□□□ -0.76
TRM10YOL093W YDL129WQ07555 291 aa10.3□□□□□ -0.76
TRM10YOL093W VPS29P38759 282 aa10.26□□□□□ -0.77
TRM10YOL093W JIP4Q03361 876 aa10.26□□□□□ -0.77
TRM10YOL093W STS1P38637 319 aa10.23□□□□□ -0.77
TRM10YOL093W XDJ1P39102 459 aa10.16□□□□□ -0.78
TRM10YOL093W ABP1P15891 592 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TRM10YOL093W VRP1P37370 817 aa10.14□□□□□ -0.79
TRM10YOL093W RTG3P38165 486 aa10.13□□□□□ -0.79
TRM10YOL093W RGA2Q06407 1009 aa10.13□□□□□ -0.79
TRM10YOL093W GYP5Q12344 894 aa10.11□□□□□ -0.79
TRM10YOL093W HTA1P04911 132 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TRM10YOL093W HTA2P04912 132 aa10.1□□□□□ -0.79
TRM10YOL093W PTC4P38089 393 aa10.07□□□□□ -0.8
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