RNA–Protein interactions for RNA: YKL018W

SWD2, Transcript of Subunit of the COMPASS (Set1C) histone H3K4 methyltransferase complex, yeast

Gene SWD2, Length 990 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SWD2	YKL018W	OCA5	P38738	679 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	MSS4	P38994	779 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	TOK1	P40310	691 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	TIM54	P47045	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	YKE2	P52553	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	GUP2	Q08929	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	UPC2	Q12151	913 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	RPD3	P32561	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	ERT1	P38140	529 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	HUL4	P40985	892 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	PUS2	P53167	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	NIT3	P49954	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	KIN4	Q01919	800 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
SWD2	YKL018W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	PEX19	Q07418	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SWD2	YKL018W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	PET10	P36139	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	SUL1	P38359	859 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	YJL049W	P47048	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	CTF4	Q01454	927 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	SWM1	Q12379	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	CIT1	P00890	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	SDP1	P40479	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
SWD2	YKL018W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	STE14	P32584	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	KTR4	P38131	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	FLC1	Q08967	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	TOP3	P13099	656 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	ERG4	P25340	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	SAP190	P36123	1033 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	BRN1	P38170	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	YHR078W	P38799	552 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	HDA1	P53973	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	ENV7	Q12003	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	LAS17	Q12446	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	DAL7	P21826	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	CTF8	P38877	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	UBA2	P52488	636 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	HUL5	P53119	910 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	SLI1	P53304	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	PRC1	P00729	532 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	FBP1	P09201	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	CHS7	P38843	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	DAM1	P53267	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	RNT1	Q02555	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	IOC4	Q04213	475 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SWD2	YKL018W	MET3	P08536	511 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	NGG1	P32494	702 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	PZF1	P39933	429 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	PKH1	Q03407	766 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	TRM11	Q12463	433 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
SWD2	YKL018W	GAL11	P19659	1081 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	VHR1	P40522	640 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	TIM44	Q01852	431 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	YML122C	Q03207	126 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	TAF8	Q03750	510 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	DLT1	Q04216	342 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	CTF13	P35203	478 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	OAR1	P35731	278 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	EMC3	P36039	253 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	RPP1	P38786	293 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	SHR5	P41912	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	ALG2	P43636	503 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	TAD1	P53065	400 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	RSC3	Q06639	885 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	REH1	Q06709	432 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	PPM2	Q08282	695 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	ALG7	P07286	448 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SWD2	YKL018W	RAD53	P22216	821 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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