Protein–RNA interactions for Protein: Q02555

RNT1, Ribonuclease 3, yeastyeast

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNT1Q02555 NSR1YGR159C 1245 nt20.84■□□□□ 0.93
RNT1Q02555 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.42■□□□□ 0.86
RNT1Q02555 NOP1YDL014W 984 nt19.66■□□□□ 0.74
RNT1Q02555 MDJ1YFL016C 1536 nt19.04■□□□□ 0.64
RNT1Q02555 YJL027CYJL027C 417 nt17.58■□□□□ 0.4
RNT1Q02555 YKL036CYKL036C 393 nt17.51■□□□□ 0.39
RNT1Q02555 SRX1YKL086W 384 nt17.11■□□□□ 0.33
RNT1Q02555 Q0297Q0297 156 nt16.93■□□□□ 0.3
RNT1Q02555 SSA3YBL075C 1950 nt16.8■□□□□ 0.28
RNT1Q02555 DBP2YNL112W 1641 nt16.54■□□□□ 0.24
RNT1Q02555 YBR190WYBR190W 312 nt16.45■□□□□ 0.22
RNT1Q02555 YCR051WYCR051W 669 nt16.2■□□□□ 0.18
RNT1Q02555 RTC3YHR087W 336 nt16.08■□□□□ 0.16
RNT1Q02555 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.83■□□□□ 0.12
RNT1Q02555 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.83■□□□□ 0.12
RNT1Q02555 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.83■□□□□ 0.12
RNT1Q02555 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.83■□□□□ 0.12
RNT1Q02555 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.83■□□□□ 0.12
RNT1Q02555 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.83■□□□□ 0.12
RNT1Q02555 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.83■□□□□ 0.12
RNT1Q02555 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.83■□□□□ 0.12
RNT1Q02555 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.83■□□□□ 0.12
RNT1Q02555 CCC1YLR220W 969 nt15.67■□□□□ 0.1
RNT1Q02555 RVS167YDR388W 1449 nt15.58■□□□□ 0.08
RNT1Q02555 SCS3YGL126W 1143 nt15.57■□□□□ 0.08
RNT1Q02555 PUT4YOR348C 1884 nt15.42■□□□□ 0.06
RNT1Q02555 SCJ1YMR214W 1134 nt15.23■□□□□ 0.03
RNT1Q02555 RPP1BYDL130W 321 nt15.2■□□□□ 0.02
RNT1Q02555 YOL085CYOL085C 342 nt15.14■□□□□ 0.01
RNT1Q02555 PKP1YIL042C 1185 nt14.97□□□□□ -0.01
RNT1Q02555 ARE1YCR048W 1833 nt14.88□□□□□ -0.03
RNT1Q02555 SHR5YOL110W 714 nt14.83□□□□□ -0.04
RNT1Q02555 POA1YBR022W 534 nt14.83□□□□□ -0.04
RNT1Q02555 URN1YPR152C 1398 nt14.78□□□□□ -0.04
RNT1Q02555 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.76□□□□□ -0.05
RNT1Q02555 SPT5YML010W 3192 nt14.75□□□□□ -0.05
RNT1Q02555 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.74□□□□□ -0.05
RNT1Q02555 SSA4YER103W 1929 nt14.74□□□□□ -0.05
RNT1Q02555 SAH1YER043C 1350 nt14.73□□□□□ -0.05
RNT1Q02555 BSC6YOL137W 1494 nt14.72□□□□□ -0.05
RNT1Q02555 OPI9YLR338W 858 nt14.7□□□□□ -0.06
RNT1Q02555 PET122YER153C 765 nt14.57□□□□□ -0.08
RNT1Q02555 DEP1YAL013W 1218 nt14.57□□□□□ -0.08
RNT1Q02555 RPN10YHR200W 807 nt14.51□□□□□ -0.09
RNT1Q02555 BUD23YCR047C 828 nt14.37□□□□□ -0.11
RNT1Q02555 SCR1SCR1 522 nt14.34□□□□□ -0.11
RNT1Q02555 YNL208WYNL208W 600 nt14.33□□□□□ -0.12
RNT1Q02555 YDJ1YNL064C 1230 nt14.32□□□□□ -0.12
RNT1Q02555 PUN1YLR414C 792 nt14.31□□□□□ -0.12
RNT1Q02555 BDF1YLR399C 2061 nt14.27□□□□□ -0.13
RNT1Q02555 PTC2YER089C 1395 nt14.2□□□□□ -0.14
RNT1Q02555 NAB2YGL122C 1578 nt14.12□□□□□ -0.15
RNT1Q02555 YJR018WYJR018W 363 nt14.08□□□□□ -0.16
RNT1Q02555 RRN5YLR141W 1092 nt14.08□□□□□ -0.16
RNT1Q02555 TAT1YBR069C 1860 nt14.08□□□□□ -0.16
RNT1Q02555 GAR1YHR089C 618 nt14.07□□□□□ -0.16
RNT1Q02555 PAC11YDR488C 1602 nt14.01□□□□□ -0.17
RNT1Q02555 MEP2YNL142W 1500 nt13.93□□□□□ -0.18
RNT1Q02555 FIS1YIL065C 468 nt13.81□□□□□ -0.2
RNT1Q02555 DAL1YIR027C 1383 nt13.81□□□□□ -0.2
RNT1Q02555 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.79□□□□□ -0.2
RNT1Q02555 FPR4YLR449W 1179 nt13.78□□□□□ -0.2
RNT1Q02555 ATS1YAL020C 1002 nt13.74□□□□□ -0.21
RNT1Q02555 RPP2BYDR382W 333 nt13.69□□□□□ -0.22
RNT1Q02555 INM2YDR287W 879 nt13.68□□□□□ -0.22
RNT1Q02555 PHO4YFR034C 939 nt13.67□□□□□ -0.22
RNT1Q02555 DCW1YKL046C 1350 nt13.66□□□□□ -0.22
RNT1Q02555 RSB1YOR049C 1065 nt13.65□□□□□ -0.22
RNT1Q02555 TIR1YER011W 765 nt13.64□□□□□ -0.23
RNT1Q02555 YJR120WYJR120W 351 nt13.62□□□□□ -0.23
RNT1Q02555 NVJ2YPR091C 2313 nt13.61□□□□□ -0.23
RNT1Q02555 YPS1YLR120C 1710 nt13.61□□□□□ -0.23
RNT1Q02555 SSA1YAL005C 1929 nt13.55□□□□□ -0.24
RNT1Q02555 YBR220CYBR220C 1683 nt13.55□□□□□ -0.24
RNT1Q02555 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.54□□□□□ -0.24
RNT1Q02555 YMR090WYMR090W 684 nt13.48□□□□□ -0.25
RNT1Q02555 EMI2YDR516C 1503 nt13.47□□□□□ -0.25
RNT1Q02555 YDR095CYDR095C 411 nt13.43□□□□□ -0.26
RNT1Q02555 YBL100CYBL100C 315 nt13.43□□□□□ -0.26
RNT1Q02555 PCH2YBR186W 1695 nt13.31□□□□□ -0.28
RNT1Q02555 SDH1YKL148C 1923 nt13.31□□□□□ -0.28
RNT1Q02555 YDL221WYDL221W 552 nt13.3□□□□□ -0.28
RNT1Q02555 GUT2YIL155C 1950 nt13.27□□□□□ -0.29
RNT1Q02555 BDH2YAL061W 1254 nt13.25□□□□□ -0.29
RNT1Q02555 SEC11YIR022W 504 nt13.24□□□□□ -0.29
RNT1Q02555 ALF1YNL148C 765 nt13.24□□□□□ -0.29
RNT1Q02555 FUN26YAL022C 1554 nt13.24□□□□□ -0.29
RNT1Q02555 RPP2AYOL039W 321 nt13.19□□□□□ -0.3
RNT1Q02555 PTP1YDL230W 1008 nt13.13□□□□□ -0.31
RNT1Q02555 TRM9YML014W 840 nt13.13□□□□□ -0.31
RNT1Q02555 CAC2YML102W 1407 nt13.13□□□□□ -0.31
RNT1Q02555 SRB2YHR041C 633 nt13.12□□□□□ -0.31
RNT1Q02555 SCC4YER147C 1875 nt13.08□□□□□ -0.32
RNT1Q02555 PIB2YGL023C 1908 nt13.01□□□□□ -0.33
RNT1Q02555 CCT6YDR188W 1641 nt13□□□□□ -0.33
RNT1Q02555 SUF2tP(AGG)C 72 nt13□□□□□ -0.33
RNT1Q02555 SUF10tP(AGG)N 72 nt13□□□□□ -0.33
RNT1Q02555 LSM3YLR438C-A 270 nt12.97□□□□□ -0.33
RNT1Q02555 SIS1YNL007C 1059 nt12.97□□□□□ -0.33
RNT1Q02555 IRC15YPL017C 1500 nt12.94□□□□□ -0.34
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