RNA–Protein interactions for RNA: YEL003W

GIM4, Transcript of Subunit of the heterohexameric cochaperone prefoldin complex, yeast

Gene GIM4, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GIM4	YEL003W	CTF8	P38877	133 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GIM4	YEL003W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	AFR1	P33304	620 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	IMO32	P53219	342 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	VPS30	Q02948	557 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	COQ11	Q05892	277 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	RPD3	P32561	433 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	TDP1	P38319	544 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	SWM1	Q12379	170 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	PPH3	P32345	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	PPZ2	P33329	710 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	VPS16	Q03308	798 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	AFT2	Q08957	416 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	TAH11	P47112	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	HOF1	Q05080	669 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	MDM10	P18409	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	FKH2	P41813	862 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	MUP1	P50276	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	ADE8	P04161	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	VBA5	P36172	582 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	YBR053C	P38235	358 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	RPP1	P38786	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	SIT1	P39980	628 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	MRPS35	P53292	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	SHE9	Q04172	456 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	FLO10	P36170	1169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	YJL163C	P46996	555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GIM4	YEL003W	CDC43	P18898	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	PCL5	P38794	229 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	YHR078W	P38799	552 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	RIA1	P53893	1110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	HDA1	P53973	706 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	YRO2	P38079	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	AMA1	P50082	593 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	ICT1	Q12385	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	ASI2	P53895	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	YML020W	Q03722	664 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	CRR1	Q05790	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	ARO10	Q06408	635 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	KIN3	P22209	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	YIL166C	P40445	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	CEP3	P40969	608 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	YAP7	Q08182	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	CLN2	P20438	545 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	ERT1	P38140	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	VHR1	P40522	640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	ADY2	P25613	283 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	TMT1	P32643	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	YKL069W	P36088	180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	TPO2	P53283	614 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	OPI10	Q08202	246 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIM4	YEL003W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	TOK1	P40310	691 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	YIR042C	P40586	236 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	PKH1	Q03407	766 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	THI7	Q05998	598 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	SGO1	Q08490	590 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	IRC13	Q08630	104 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	MRP8	P35719	219 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	PBY1	P38254	753 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	LCD1	Q04377	747 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected
GIM4	YEL003W	PIN2	Q12057	282 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	DMC1	P25453	334 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	NGG1	P32494	702 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	REC104	P33323	182 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	PUS2	P53167	370 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	CWC24	P53769	259 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	NRG1	Q03125	231 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.48	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	FMP52	P40008	231 aa		4.48	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	SSL2	Q00578	843 aa		4.48	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
GIM4	YEL003W	YLR415C	O13578	112 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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