RNA–Protein interactions for RNA: YDL069C

CBS1, Mitochondrial translational activator of the COB mRNA, yeast

Gene CBS1, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBS1	YDL069C	SDP1	P40479	209 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	FBP1	P09201	348 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	RPD3	P32561	433 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	TMT1	P32643	299 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	STE13	P33894	931 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	PCL5	P38794	229 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	FKH2	P41813	862 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	SWM1	Q12379	170 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	MUP1	P50276	574 aa		5	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	THI7	Q05998	598 aa		5	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	CDC43	P18898	376 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	MRPS35	P53292	345 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	KIN3	P22209	435 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	NPP1	P25353	742 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	YKE2	P52553	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	CRR1	Q05790	422 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	ARO10	Q06408	635 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	RPP1	P38786	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	VPS30	Q02948	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBS1	YDL069C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	CTF8	P38877	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	YJL163C	P46996	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	YGR053C	P53234	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	ADY2	P25613	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	PPH3	P32345	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	YBR053C	P38235	358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	YIL166C	P40445	542 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
CBS1	YDL069C	GLO1	P50107	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	AFR1	P33304	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	RIA1	P53893	1110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	SEC5	P89102	971 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	MNR2	P35724	969 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	CEP3	P40969	608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBS1	YDL069C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	YHR078W	P38799	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	IRC13	Q08630	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	AGP1	P25376	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	VHR1	P40522	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	AMA1	P50082	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	HDA1	P53973	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	ADE8	P04161	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	YRO2	P38079	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	ERT1	P38140	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	VBA5	P36172	582 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	VPS16	Q03308	798 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	DMC1	P25453	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	ASI2	P53895	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	PKH1	Q03407	766 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	SGO1	Q08490	590 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	SPO11	P23179	398 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	DAM1	P53267	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	SSL2	Q00578	843 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBS1	YDL069C	YJL206C	P39529	758 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	YIR042C	P40586	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	EMP70	P32802	667 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	PUS2	P53167	370 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	ORC2	P32833	620 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	FMP52	P40008	231 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	SCS3	P53012	380 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	TEL2	P53038	688 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	CLN2	P20438	545 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	SIT1	P39980	628 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	NRG1	Q03125	231 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	ASM4	Q05166	528 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	HEM3	P28789	327 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	BCD1	P38772	366 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	GAT1	P43574	510 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	SHE9	Q04172	456 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CBS1	YDL069C	TAF3	Q12297	353 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.6 ms