RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	NSG2	P53898	299 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	GIS4	Q04233	774 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	GAS5	Q08193	484 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	TIP41	Q12199	356 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	PMD1	P32634	1753 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	ACE2	P21192	770 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	CDC15	P27636	974 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	WAR1	Q03631	944 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	MMR1	Q06324	491 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	YOR296W	Q08748	1289 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.3	□□□□□ -1.24	not detected
MIA40	YKL195W	MNR2	P35724	969 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	TPM2	P40414	161 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	STU2	P46675	888 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	RIM21	P48565	533 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	UBP2	Q01476	1272 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	FIG2	P25653	1609 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	TOP1	P04786	769 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	AFG2	P32794	780 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	YGL138C	P53122	345 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	FOL1	P53848	824 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	VPS30	Q02948	557 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	PSR2	Q07949	397 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	PCL8	Q08966	492 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	PTC5	Q12511	572 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	STE6	P12866	1290 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	PRE8	P23639	250 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	SPC110	P32380	944 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	SAP190	P36123	1033 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	PES4	P39684	611 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	MDM1	Q01846	1127 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	TRS120	Q04183	1289 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	DSE3	Q08729	430 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	AFT2	Q08957	416 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MIA40	YKL195W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	NUC1	P08466	329 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	ALG1	P16661	449 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	SRM1	P21827	482 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	MSH3	P25336	1018 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	SAS3	P34218	831 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	PSY4	P38193	441 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	TCB2	P48231	1178 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	KIN4	Q01919	800 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	CSM3	Q04659	317 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	CRF1	Q04930	467 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	BDS1	Q08347	646 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	MSM1	P22438	575 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	YBL028C	P38202	106 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	VPS45	P38932	577 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	SHC1	P39000	512 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	OSW7	P43611	510 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	VPS75	P53853	264 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	MRX10	Q05648	414 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	YCG1	Q06680	1035 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	TLG2	Q08144	397 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	TMA16	Q08687	178 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	SEC20	P28791	383 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	CHS3	P29465	1165 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	HIR1	P32479	840 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	SPT8	P38915	602 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	LYS14	P40971	790 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.25	□□□□□ -1.25	not detected
MIA40	YKL195W	YGR035C	P53222	116 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	RET3	P53600	189 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	DSE4	P53753	1117 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	ATG20	Q07528	640 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	FLO1	P32768	1537 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	ADP1	P25371	1049 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MIA40	YKL195W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.8 ms