RNA–Protein interactions for RNA: YML068W

ITT1, Transcript of Protein that modulates the efficiency of translation termination, yeast

Gene ITT1, Length 1,395 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ITT1	YML068W	DUS4	Q06063	367 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ITT1	YML068W	RSB1	Q08417	382 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ITT1	YML068W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	PPX1	P38698	397 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	PNS1	Q12412	539 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	WHI5	Q12416	295 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	SRM1	P21827	482 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	YFL054C	P43549	646 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	GAL10	P04397	699 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
ITT1	YML068W	DOM34	P33309	386 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	CMP2	P14747	604 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	ROD1	Q02805	837 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	YPL260W	Q08977	551 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	CDC20	P26309	610 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	RSM24	Q03976	319 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	PUS9	Q12069	462 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	CDC6	P09119	513 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	TRM2	P33753	639 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	THI12	P42883	340 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	THI5	P43534	340 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	THI11	P47183	340 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	THI13	Q07748	340 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ITT1	YML068W	LST4	P34239	828 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	RFC5	P38251	354 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	SLI1	P53304	468 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	IOC4	Q04213	475 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	TAF13	P11747	167 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	MKK2	P32491	506 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	TMA10	Q06177	86 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	RXT3	Q07458	294 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	GPB1	Q08886	897 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	HCM1	P25364	564 aa		5	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
ITT1	YML068W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
ITT1	YML068W	YER152C	P10356	443 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	SLD2	P34252	453 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	HXT13	P39924	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	MSE1	P48525	536 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	HXT17	P53631	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	SIW14	P53965	281 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	HXT15	P54854	567 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	SUN4	P53616	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	SVS1	Q12254	260 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	STE11	P23561	717 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	RGD1	P38339	666 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	MRPS18	P42847	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	GNP1	P48813	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	YGR122W	P53272	402 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	VPS62	P53285	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	MCD1	Q12158	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	NTO1	Q12311	748 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITT1	YML068W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	APL1	P27351	700 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	MLS1	P30952	554 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	PHO23	P50947	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	YAP6	Q03935	383 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	SEC8	P32855	1065 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	GCV2	P49095	1034 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	RAD2	P07276	1031 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	IPL1	P38991	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	ENT3	P47160	408 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	EMC1	P25574	760 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	CNN1	P43618	361 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	ATG13	Q06628	738 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	HMI1	Q12039	706 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	MET10	P39692	1035 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	MRL1	Q06815	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	GCR1	P07261	785 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	CYC8	P14922	966 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	BAS1	P22035	811 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	SEC20	P28791	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ITT1	YML068W	MPH1	P40562	993 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.3 ms