Protein–RNA interactions for Protein: P43618

CNN1, Inner kinetochore subunit CNN1, yeastyeast

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CNN1P43618 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.06■□□□□ 0.96
CNN1P43618 NSR1YGR159C 1245 nt20.95■□□□□ 0.94
CNN1P43618 NOP1YDL014W 984 nt20.52■□□□□ 0.88
CNN1P43618 YKL036CYKL036C 393 nt19.02■□□□□ 0.64
CNN1P43618 MDJ1YFL016C 1536 nt18.49■□□□□ 0.55
CNN1P43618 Q0297Q0297 156 nt18.05■□□□□ 0.48
CNN1P43618 SRX1YKL086W 384 nt17.98■□□□□ 0.47
CNN1P43618 YJL027CYJL027C 417 nt17.72■□□□□ 0.43
CNN1P43618 SCS3YGL126W 1143 nt17.35■□□□□ 0.37
CNN1P43618 YCR051WYCR051W 669 nt16.97■□□□□ 0.31
CNN1P43618 YOL085CYOL085C 342 nt16.49■□□□□ 0.23
CNN1P43618 DBP2YNL112W 1641 nt16.47■□□□□ 0.23
CNN1P43618 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.24■□□□□ 0.19
CNN1P43618 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.24■□□□□ 0.19
CNN1P43618 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.24■□□□□ 0.19
CNN1P43618 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.24■□□□□ 0.19
CNN1P43618 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.24■□□□□ 0.19
CNN1P43618 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.24■□□□□ 0.19
CNN1P43618 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.24■□□□□ 0.19
CNN1P43618 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.24■□□□□ 0.19
CNN1P43618 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.24■□□□□ 0.19
CNN1P43618 RPP1BYDL130W 321 nt16.17■□□□□ 0.18
CNN1P43618 PKP1YIL042C 1185 nt16.16■□□□□ 0.18
CNN1P43618 CCC1YLR220W 969 nt15.95■□□□□ 0.14
CNN1P43618 YBR190WYBR190W 312 nt15.79■□□□□ 0.12
CNN1P43618 ATS1YAL020C 1002 nt15.54■□□□□ 0.08
CNN1P43618 SCJ1YMR214W 1134 nt15.5■□□□□ 0.07
CNN1P43618 PET122YER153C 765 nt15.43■□□□□ 0.06
CNN1P43618 RVS167YDR388W 1449 nt15.41■□□□□ 0.06
CNN1P43618 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.35■□□□□ 0.05
CNN1P43618 RTC3YHR087W 336 nt15.34■□□□□ 0.05
CNN1P43618 SCR1SCR1 522 nt15.25■□□□□ 0.03
CNN1P43618 RRN5YLR141W 1092 nt14.98□□□□□ -0.01
CNN1P43618 SHR5YOL110W 714 nt14.94□□□□□ -0.02
CNN1P43618 YDJ1YNL064C 1230 nt14.88□□□□□ -0.03
CNN1P43618 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.71□□□□□ -0.05
CNN1P43618 RSB1YOR049C 1065 nt14.65□□□□□ -0.06
CNN1P43618 GAR1YHR089C 618 nt14.46□□□□□ -0.09
CNN1P43618 URN1YPR152C 1398 nt14.45□□□□□ -0.1
CNN1P43618 PST2YDR032C 597 nt14.41□□□□□ -0.1
CNN1P43618 DEP1YAL013W 1218 nt14.41□□□□□ -0.1
CNN1P43618 PUT4YOR348C 1884 nt14.32□□□□□ -0.12
CNN1P43618 OPI9YLR338W 858 nt14.26□□□□□ -0.13
CNN1P43618 YNL208WYNL208W 600 nt14.25□□□□□ -0.13
CNN1P43618 RPN10YHR200W 807 nt14.23□□□□□ -0.13
CNN1P43618 SAH1YER043C 1350 nt14.11□□□□□ -0.15
CNN1P43618 ARE1YCR048W 1833 nt14.07□□□□□ -0.16
CNN1P43618 TIR1YER011W 765 nt14.01□□□□□ -0.17
CNN1P43618 SSA3YBL075C 1950 nt13.99□□□□□ -0.17
CNN1P43618 SSA1YAL005C 1929 nt13.84□□□□□ -0.19
CNN1P43618 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.84□□□□□ -0.19
CNN1P43618 PUN1YLR414C 792 nt13.83□□□□□ -0.2
CNN1P43618 YKL097CYKL097C 411 nt13.81□□□□□ -0.2
CNN1P43618 POA1YBR022W 534 nt13.8□□□□□ -0.2
CNN1P43618 Q0182Q0182 405 nt13.79□□□□□ -0.2
CNN1P43618 SHU1YHL006C 453 nt13.78□□□□□ -0.2
CNN1P43618 YJR018WYJR018W 363 nt13.78□□□□□ -0.2
CNN1P43618 YJR120WYJR120W 351 nt13.68□□□□□ -0.22
CNN1P43618 SRB2YHR041C 633 nt13.66□□□□□ -0.22
CNN1P43618 PTC2YER089C 1395 nt13.62□□□□□ -0.23
CNN1P43618 BSC6YOL137W 1494 nt13.52□□□□□ -0.25
CNN1P43618 RPP2BYDR382W 333 nt13.5□□□□□ -0.25
CNN1P43618 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.49□□□□□ -0.25
CNN1P43618 NAB2YGL122C 1578 nt13.46□□□□□ -0.25
CNN1P43618 BUD23YCR047C 828 nt13.46□□□□□ -0.25
CNN1P43618 MOT3YMR070W 1473 nt13.44□□□□□ -0.26
CNN1P43618 WWM1YFL010C 636 nt13.39□□□□□ -0.27
CNN1P43618 YGR021WYGR021W 873 nt13.36□□□□□ -0.27
CNN1P43618 HOM6YJR139C 1080 nt13.34□□□□□ -0.27
CNN1P43618 FIS1YIL065C 468 nt13.33□□□□□ -0.28
CNN1P43618 YOR139CYOR139C 393 nt13.31□□□□□ -0.28
CNN1P43618 BDH2YAL061W 1254 nt13.3□□□□□ -0.28
CNN1P43618 DAL1YIR027C 1383 nt13.3□□□□□ -0.28
CNN1P43618 INM2YDR287W 879 nt13.29□□□□□ -0.28
CNN1P43618 MNP1YGL068W 585 nt13.24□□□□□ -0.29
CNN1P43618 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.2□□□□□ -0.3
CNN1P43618 PHO4YFR034C 939 nt13.18□□□□□ -0.3
CNN1P43618 YBL100CYBL100C 315 nt13.17□□□□□ -0.3
CNN1P43618 FPR4YLR449W 1179 nt13.16□□□□□ -0.3
CNN1P43618 LSM3YLR438C-A 270 nt13.15□□□□□ -0.3
CNN1P43618 RKM5YLR137W 1104 nt13.13□□□□□ -0.31
CNN1P43618 NPL3YDR432W 1245 nt13.1□□□□□ -0.31
CNN1P43618 YOL037CYOL037C 354 nt13.09□□□□□ -0.31
CNN1P43618 FUN26YAL022C 1554 nt13.03□□□□□ -0.32
CNN1P43618 TRM9YML014W 840 nt12.98□□□□□ -0.33
CNN1P43618 SPT5YML010W 3192 nt12.97□□□□□ -0.33
CNN1P43618 CCT6YDR188W 1641 nt12.92□□□□□ -0.34
CNN1P43618 YPS1YLR120C 1710 nt12.92□□□□□ -0.34
CNN1P43618 YDR095CYDR095C 411 nt12.86□□□□□ -0.35
CNN1P43618 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.78□□□□□ -0.36
CNN1P43618 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.78□□□□□ -0.36
CNN1P43618 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.78□□□□□ -0.36
CNN1P43618 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.78□□□□□ -0.36
CNN1P43618 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.78□□□□□ -0.36
CNN1P43618 YLR281CYLR281C 468 nt12.78□□□□□ -0.36
CNN1P43618 ALF1YNL148C 765 nt12.77□□□□□ -0.37
CNN1P43618 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.76□□□□□ -0.37
CNN1P43618 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.76□□□□□ -0.37
CNN1P43618 WHI5YOR083W 888 nt12.7□□□□□ -0.38
CNN1P43618 MEP2YNL142W 1500 nt12.7□□□□□ -0.38
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