Protein–RNA interactions for Protein: Q08886

GPB1, Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 1, yeastyeast

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Length 897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GPB1Q08886 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.87■□□□□ 0.77
GPB1Q08886 NSR1YGR159C 1245 nt19.86■□□□□ 0.77
GPB1Q08886 NOP1YDL014W 984 nt19.17■□□□□ 0.66
GPB1Q08886 MDJ1YFL016C 1536 nt17.91■□□□□ 0.46
GPB1Q08886 YKL036CYKL036C 393 nt17.53■□□□□ 0.4
GPB1Q08886 SRX1YKL086W 384 nt16.77■□□□□ 0.28
GPB1Q08886 Q0297Q0297 156 nt16.73■□□□□ 0.27
GPB1Q08886 YJL027CYJL027C 417 nt16.46■□□□□ 0.23
GPB1Q08886 YCR051WYCR051W 669 nt15.94■□□□□ 0.14
GPB1Q08886 SCS3YGL126W 1143 nt15.89■□□□□ 0.13
GPB1Q08886 DBP2YNL112W 1641 nt15.76■□□□□ 0.11
GPB1Q08886 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.29■□□□□ 0.04
GPB1Q08886 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.29■□□□□ 0.04
GPB1Q08886 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.29■□□□□ 0.04
GPB1Q08886 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.29■□□□□ 0.04
GPB1Q08886 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.29■□□□□ 0.04
GPB1Q08886 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.29■□□□□ 0.04
GPB1Q08886 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.29■□□□□ 0.04
GPB1Q08886 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.29■□□□□ 0.04
GPB1Q08886 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.29■□□□□ 0.04
GPB1Q08886 YBR190WYBR190W 312 nt15.25■□□□□ 0.03
GPB1Q08886 YOL085CYOL085C 342 nt15.22■□□□□ 0.03
GPB1Q08886 CCC1YLR220W 969 nt15.2■□□□□ 0.02
GPB1Q08886 PKP1YIL042C 1185 nt15.07■□□□□ 0
GPB1Q08886 RPP1BYDL130W 321 nt15.02■□□□□ -0
GPB1Q08886 RTC3YHR087W 336 nt14.95□□□□□ -0.02
GPB1Q08886 RVS167YDR388W 1449 nt14.7□□□□□ -0.06
GPB1Q08886 SCJ1YMR214W 1134 nt14.66□□□□□ -0.06
GPB1Q08886 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.42□□□□□ -0.1
GPB1Q08886 PET122YER153C 765 nt14.41□□□□□ -0.1
GPB1Q08886 SCR1SCR1 522 nt14.15□□□□□ -0.14
GPB1Q08886 SHR5YOL110W 714 nt14.15□□□□□ -0.14
GPB1Q08886 ATS1YAL020C 1002 nt14.14□□□□□ -0.15
GPB1Q08886 PUT4YOR348C 1884 nt14.04□□□□□ -0.16
GPB1Q08886 RRN5YLR141W 1092 nt13.99□□□□□ -0.17
GPB1Q08886 URN1YPR152C 1398 nt13.92□□□□□ -0.18
GPB1Q08886 YDJ1YNL064C 1230 nt13.91□□□□□ -0.18
GPB1Q08886 DEP1YAL013W 1218 nt13.9□□□□□ -0.18
GPB1Q08886 SAH1YER043C 1350 nt13.74□□□□□ -0.21
GPB1Q08886 ARE1YCR048W 1833 nt13.74□□□□□ -0.21
GPB1Q08886 OPI9YLR338W 858 nt13.73□□□□□ -0.21
GPB1Q08886 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.7□□□□□ -0.22
GPB1Q08886 GAR1YHR089C 618 nt13.7□□□□□ -0.22
GPB1Q08886 RSB1YOR049C 1065 nt13.63□□□□□ -0.23
GPB1Q08886 POA1YBR022W 534 nt13.61□□□□□ -0.23
GPB1Q08886 RPN10YHR200W 807 nt13.59□□□□□ -0.23
GPB1Q08886 YNL208WYNL208W 600 nt13.58□□□□□ -0.24
GPB1Q08886 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.56□□□□□ -0.24
GPB1Q08886 SSA3YBL075C 1950 nt13.55□□□□□ -0.24
GPB1Q08886 BSC6YOL137W 1494 nt13.33□□□□□ -0.28
GPB1Q08886 PUN1YLR414C 792 nt13.31□□□□□ -0.28
GPB1Q08886 YJR018WYJR018W 363 nt13.25□□□□□ -0.29
GPB1Q08886 BUD23YCR047C 828 nt13.24□□□□□ -0.29
GPB1Q08886 PTC2YER089C 1395 nt13.23□□□□□ -0.29
GPB1Q08886 TIR1YER011W 765 nt13.22□□□□□ -0.29
GPB1Q08886 SSA1YAL005C 1929 nt13.14□□□□□ -0.31
GPB1Q08886 PST2YDR032C 597 nt13.14□□□□□ -0.31
GPB1Q08886 YJR120WYJR120W 351 nt13.05□□□□□ -0.32
GPB1Q08886 NAB2YGL122C 1578 nt13.05□□□□□ -0.32
GPB1Q08886 SRB2YHR041C 633 nt12.93□□□□□ -0.34
GPB1Q08886 RPP2BYDR382W 333 nt12.89□□□□□ -0.35
GPB1Q08886 FIS1YIL065C 468 nt12.87□□□□□ -0.35
GPB1Q08886 FPR4YLR449W 1179 nt12.86□□□□□ -0.35
GPB1Q08886 DAL1YIR027C 1383 nt12.84□□□□□ -0.35
GPB1Q08886 SPT5YML010W 3192 nt12.84□□□□□ -0.35
GPB1Q08886 INM2YDR287W 879 nt12.77□□□□□ -0.37
GPB1Q08886 PHO4YFR034C 939 nt12.74□□□□□ -0.37
GPB1Q08886 SHU1YHL006C 453 nt12.68□□□□□ -0.38
GPB1Q08886 YBL100CYBL100C 315 nt12.65□□□□□ -0.38
GPB1Q08886 WWM1YFL010C 636 nt12.64□□□□□ -0.39
GPB1Q08886 BDH2YAL061W 1254 nt12.62□□□□□ -0.39
GPB1Q08886 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.59□□□□□ -0.39
GPB1Q08886 YPS1YLR120C 1710 nt12.56□□□□□ -0.4
GPB1Q08886 Q0182Q0182 405 nt12.55□□□□□ -0.4
GPB1Q08886 MEP2YNL142W 1500 nt12.52□□□□□ -0.41
GPB1Q08886 FUN26YAL022C 1554 nt12.5□□□□□ -0.41
GPB1Q08886 YKL097CYKL097C 411 nt12.49□□□□□ -0.41
GPB1Q08886 SSA4YER103W 1929 nt12.46□□□□□ -0.42
GPB1Q08886 YDR095CYDR095C 411 nt12.44□□□□□ -0.42
GPB1Q08886 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.44□□□□□ -0.42
GPB1Q08886 TRM9YML014W 840 nt12.43□□□□□ -0.42
GPB1Q08886 YGR021WYGR021W 873 nt12.42□□□□□ -0.42
GPB1Q08886 HOM6YJR139C 1080 nt12.41□□□□□ -0.42
GPB1Q08886 LSM3YLR438C-A 270 nt12.4□□□□□ -0.42
GPB1Q08886 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.37□□□□□ -0.43
GPB1Q08886 MNP1YGL068W 585 nt12.37□□□□□ -0.43
GPB1Q08886 DCW1YKL046C 1350 nt12.37□□□□□ -0.43
GPB1Q08886 ALF1YNL148C 765 nt12.34□□□□□ -0.43
GPB1Q08886 CCT6YDR188W 1641 nt12.29□□□□□ -0.44
GPB1Q08886 RKM5YLR137W 1104 nt12.23□□□□□ -0.45
GPB1Q08886 PTP1YDL230W 1008 nt12.22□□□□□ -0.45
GPB1Q08886 RPP2AYOL039W 321 nt12.21□□□□□ -0.45
GPB1Q08886 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.18□□□□□ -0.46
GPB1Q08886 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.18□□□□□ -0.46
GPB1Q08886 CAC2YML102W 1407 nt12.18□□□□□ -0.46
GPB1Q08886 EMI2YDR516C 1503 nt12.17□□□□□ -0.46
GPB1Q08886 SIS1YNL007C 1059 nt12.17□□□□□ -0.46
GPB1Q08886 YOR139CYOR139C 393 nt12.08□□□□□ -0.48
GPB1Q08886 YDL221WYDL221W 552 nt12.05□□□□□ -0.48
GPB1Q08886 YMR090WYMR090W 684 nt12.04□□□□□ -0.48
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