Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.11■□□□□ 0.81
MCD1Q12158 NSR1YGR159C 1245 nt20.02■□□□□ 0.8
MCD1Q12158 NOP1YDL014W 984 nt19.61■□□□□ 0.73
MCD1Q12158 YKL036CYKL036C 393 nt17.95■□□□□ 0.46
MCD1Q12158 MDJ1YFL016C 1536 nt17.77■□□□□ 0.43
MCD1Q12158 SRX1YKL086W 384 nt17.03■□□□□ 0.32
MCD1Q12158 Q0297Q0297 156 nt17.02■□□□□ 0.32
MCD1Q12158 YJL027CYJL027C 417 nt16.76■□□□□ 0.27
MCD1Q12158 SCS3YGL126W 1143 nt16.22■□□□□ 0.19
MCD1Q12158 YCR051WYCR051W 669 nt16.2■□□□□ 0.18
MCD1Q12158 DBP2YNL112W 1641 nt15.6■□□□□ 0.09
MCD1Q12158 YOL085CYOL085C 342 nt15.48■□□□□ 0.07
MCD1Q12158 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.4■□□□□ 0.06
MCD1Q12158 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.4■□□□□ 0.06
MCD1Q12158 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.4■□□□□ 0.06
MCD1Q12158 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.4■□□□□ 0.06
MCD1Q12158 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.4■□□□□ 0.06
MCD1Q12158 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.4■□□□□ 0.06
MCD1Q12158 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.4■□□□□ 0.06
MCD1Q12158 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.4■□□□□ 0.06
MCD1Q12158 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.4■□□□□ 0.06
MCD1Q12158 RPP1BYDL130W 321 nt15.29■□□□□ 0.04
MCD1Q12158 CCC1YLR220W 969 nt15.29■□□□□ 0.04
MCD1Q12158 PKP1YIL042C 1185 nt15.24■□□□□ 0.03
MCD1Q12158 YBR190WYBR190W 312 nt15.23■□□□□ 0.03
MCD1Q12158 RTC3YHR087W 336 nt14.96□□□□□ -0.01
MCD1Q12158 RVS167YDR388W 1449 nt14.93□□□□□ -0.02
MCD1Q12158 SCJ1YMR214W 1134 nt14.71□□□□□ -0.05
MCD1Q12158 Q0182Q0182 405 nt14.69□□□□□ -0.06
MCD1Q12158 ATS1YAL020C 1002 nt14.58□□□□□ -0.08
MCD1Q12158 PET122YER153C 765 nt14.56□□□□□ -0.08
MCD1Q12158 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.56□□□□□ -0.08
MCD1Q12158 SCR1SCR1 522 nt14.56□□□□□ -0.08
MCD1Q12158 SHR5YOL110W 714 nt14.29□□□□□ -0.12
MCD1Q12158 MOT3YMR070W 1473 nt14.29□□□□□ -0.12
MCD1Q12158 SSA3YBL075C 1950 nt14.2□□□□□ -0.14
MCD1Q12158 RRN5YLR141W 1092 nt14.15□□□□□ -0.14
MCD1Q12158 YDJ1YNL064C 1230 nt14.11□□□□□ -0.15
MCD1Q12158 RSB1YOR049C 1065 nt13.92□□□□□ -0.18
MCD1Q12158 URN1YPR152C 1398 nt13.92□□□□□ -0.18
MCD1Q12158 DEP1YAL013W 1218 nt13.86□□□□□ -0.19
MCD1Q12158 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.85□□□□□ -0.19
MCD1Q12158 RPN10YHR200W 807 nt13.83□□□□□ -0.2
MCD1Q12158 GAR1YHR089C 618 nt13.81□□□□□ -0.2
MCD1Q12158 PUT4YOR348C 1884 nt13.77□□□□□ -0.21
MCD1Q12158 OPI9YLR338W 858 nt13.71□□□□□ -0.21
MCD1Q12158 YNL208WYNL208W 600 nt13.71□□□□□ -0.21
MCD1Q12158 SAH1YER043C 1350 nt13.6□□□□□ -0.23
MCD1Q12158 ARE1YCR048W 1833 nt13.5□□□□□ -0.25
MCD1Q12158 PST2YDR032C 597 nt13.47□□□□□ -0.25
MCD1Q12158 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.41□□□□□ -0.26
MCD1Q12158 PUN1YLR414C 792 nt13.39□□□□□ -0.27
MCD1Q12158 POA1YBR022W 534 nt13.39□□□□□ -0.27
MCD1Q12158 TIR1YER011W 765 nt13.34□□□□□ -0.27
MCD1Q12158 YJR018WYJR018W 363 nt13.29□□□□□ -0.28
MCD1Q12158 PTC2YER089C 1395 nt13.17□□□□□ -0.3
MCD1Q12158 BUD23YCR047C 828 nt13.16□□□□□ -0.3
MCD1Q12158 RPP2BYDR382W 333 nt13.12□□□□□ -0.31
MCD1Q12158 SSA1YAL005C 1929 nt13.11□□□□□ -0.31
MCD1Q12158 BSC6YOL137W 1494 nt13.1□□□□□ -0.31
MCD1Q12158 YKL097CYKL097C 411 nt13.05□□□□□ -0.32
MCD1Q12158 NAB2YGL122C 1578 nt13.04□□□□□ -0.32
MCD1Q12158 YJR120WYJR120W 351 nt12.87□□□□□ -0.35
MCD1Q12158 INM2YDR287W 879 nt12.86□□□□□ -0.35
MCD1Q12158 SHU1YHL006C 453 nt12.86□□□□□ -0.35
MCD1Q12158 FPR4YLR449W 1179 nt12.86□□□□□ -0.35
MCD1Q12158 DAL1YIR027C 1383 nt12.85□□□□□ -0.35
MCD1Q12158 FIS1YIL065C 468 nt12.75□□□□□ -0.37
MCD1Q12158 SRB2YHR041C 633 nt12.74□□□□□ -0.37
MCD1Q12158 YGR021WYGR021W 873 nt12.73□□□□□ -0.37
MCD1Q12158 BDH2YAL061W 1254 nt12.73□□□□□ -0.37
MCD1Q12158 PHO4YFR034C 939 nt12.7□□□□□ -0.38
MCD1Q12158 YBL100CYBL100C 315 nt12.7□□□□□ -0.38
MCD1Q12158 WWM1YFL010C 636 nt12.69□□□□□ -0.38
MCD1Q12158 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.68□□□□□ -0.38
MCD1Q12158 SPT5YML010W 3192 nt12.65□□□□□ -0.39
MCD1Q12158 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.57□□□□□ -0.4
MCD1Q12158 LSM3YLR438C-A 270 nt12.57□□□□□ -0.4
MCD1Q12158 HOM6YJR139C 1080 nt12.56□□□□□ -0.4
MCD1Q12158 TRM9YML014W 840 nt12.56□□□□□ -0.4
MCD1Q12158 FUN26YAL022C 1554 nt12.52□□□□□ -0.41
MCD1Q12158 MNP1YGL068W 585 nt12.47□□□□□ -0.41
MCD1Q12158 ALF1YNL148C 765 nt12.47□□□□□ -0.41
MCD1Q12158 YOR139CYOR139C 393 nt12.45□□□□□ -0.42
MCD1Q12158 YPS1YLR120C 1710 nt12.45□□□□□ -0.42
MCD1Q12158 SSA4YER103W 1929 nt12.43□□□□□ -0.42
MCD1Q12158 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.4□□□□□ -0.42
MCD1Q12158 RKM5YLR137W 1104 nt12.4□□□□□ -0.42
MCD1Q12158 NPL3YDR432W 1245 nt12.39□□□□□ -0.43
MCD1Q12158 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.39□□□□□ -0.43
MCD1Q12158 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.39□□□□□ -0.43
MCD1Q12158 YDR095CYDR095C 411 nt12.37□□□□□ -0.43
MCD1Q12158 YOL037CYOL037C 354 nt12.36□□□□□ -0.43
MCD1Q12158 CCT6YDR188W 1641 nt12.36□□□□□ -0.43
MCD1Q12158 MEP2YNL142W 1500 nt12.31□□□□□ -0.44
MCD1Q12158 RPP2AYOL039W 321 nt12.18□□□□□ -0.46
MCD1Q12158 SIS1YNL007C 1059 nt12.13□□□□□ -0.47
MCD1Q12158 NME1NME1 340 nt12.09□□□□□ -0.47
MCD1Q12158 FPS1YLL043W 2010 nt12.08□□□□□ -0.48
MCD1Q12158 YMR090WYMR090W 684 nt12.06□□□□□ -0.48
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