RNA–Protein interactions for RNA: YKL093W

MBR1, Transcript of Protein involved in mitochondrial functions and stress response, yeast

Gene MBR1, Length 1,020 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MBR1	YKL093W	ADP1	P25371	1049 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	SLS1	P42900	643 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	MON1	P53129	644 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	YCS4	Q06156	1176 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	SSY1	Q03770	852 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	HAT1	Q12341	374 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	YKL077W	P36081	392 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	SHU2	P38957	223 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	AVO1	Q08236	1176 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	THI80	P35202	319 aa		5.85	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	YCR015C	P25616	317 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
MBR1	YKL093W	IML1	P47170	1584 aa		5.84	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	HAP1	P0CE41	1502 aa		5.84	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	PRO1	P32264	428 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	SAM35	P14693	329 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	VPS35	P34110	944 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	YAR028W	P39548	234 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	MSH3	P25336	1018 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	YHL050C	P38721	697 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	YHR219W	P38900	624 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	YBT1	P32386	1661 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	CAT8	P39113	1433 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	RDH54	P38086	958 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	PTC7	P38797	343 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	TPP1	Q03796	238 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	ESC8	Q08119	714 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	YDL177C	Q12257	170 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	UGA4	P32837	571 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	PPX1	P38698	397 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	MET4	P32389	672 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	IPL1	P38991	367 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	XKS1	P42826	600 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	TAF1	P46677	1066 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	ULP1	Q02724	621 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	TOS4	Q06266	489 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MBR1	YKL093W	VMR1	P38735	1592 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	GTS1	P40956	396 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	MDL2	P33311	773 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	RKM2	Q03942	479 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	YHL012W	P38709	493 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	HSE1	P38753	452 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	PEX28	P38848	579 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	DAK2	P43550	591 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	YPL109C	Q02981	657 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.74	□□□□□ -1.49	not detected
MBR1	YKL093W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	FLR1	P38124	548 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	YGL140C	P53120	1219 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	MRPL22	P53881	309 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	PEX13	P80667	386 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	DAL4	Q04895	635 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	LAP2	Q10740	671 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	ADI1	Q03677	179 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	WHI5	Q12416	295 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	YKL222C	P35995	705 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	ADD66	P36040	267 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	YJL045W	P47052	634 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	RSM26	P47141	266 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	RIM8	P53179	542 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MBR1	YKL093W	SOD2	P00447	233 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MBR1	YKL093W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MBR1	YKL093W	GIP4	P39732	760 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MBR1	YKL093W	VPS53	P47061	822 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MBR1	YKL093W	HDA2	Q06629	674 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MBR1	YKL093W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MBR1	YKL093W	AFG2	P32794	780 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MBR1	YKL093W	SQT1	P35184	431 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MBR1	YKL093W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
MBR1	YKL093W	FAA3	P39002	694 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MBR1	YKL093W	BCK1	Q01389	1478 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MBR1	YKL093W	YSC84	P32793	468 aa		5.69	□□□□□ -1.5
MBR1	YKL093W	PIC2	P40035	300 aa		5.69	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.3 ms