Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U3KQK5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U3KQK5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U3KQK5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U3KQK5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U3KQK5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U3KQK5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U3KQK5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U3KQK5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQK5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQK5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U3KQK5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U3KQK5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
U3KQK5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U3KQK5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U3KQK5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U3KQK5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
U3KQK5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U3KQK5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
U3KQK5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U3KQK5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U3KQK5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U3KQK5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KQK5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U3KQK5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
U3KQK5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
U3KQK5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U3KQK5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U3KQK5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U3KQK5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U3KQK5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U3KQK5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U3KQK5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQK5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQK5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQK5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQK5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQK5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U3KQK5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KQK5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U3KQK5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U3KQK5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U3KQK5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U3KQK5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23■■□□□ 1.27
U3KQK5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQK5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U3KQK5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQK5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U3KQK5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U3KQK5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U3KQK5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U3KQK5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQK5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQK5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQK5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQK5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQK5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQK5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KQK5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQK5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQK5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQK5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQK5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQK5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQK5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U3KQK5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U3KQK5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U3KQK5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U3KQK5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQK5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQK5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQK5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQK5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQK5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQK5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U3KQK5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U3KQK5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQK5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQK5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQK5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQK5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQK5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQK5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U3KQK5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQK5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQK5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQK5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQK5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQK5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQK5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQK5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQK5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQK5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQK5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQK5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQK5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQK5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQK5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQK5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQK5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms