Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SNX5Q9Y5X3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SNX5Q9Y5X3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SNX5Q9Y5X3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX5Q9Y5X3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX5Q9Y5X3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SNX5Q9Y5X3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNX5Q9Y5X3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SNX5Q9Y5X3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNX5Q9Y5X3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX5Q9Y5X3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX5Q9Y5X3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX5Q9Y5X3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNX5Q9Y5X3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SNX5Q9Y5X3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SNX5Q9Y5X3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNX5Q9Y5X3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SNX5Q9Y5X3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNX5Q9Y5X3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX5Q9Y5X3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX5Q9Y5X3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX5Q9Y5X3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX5Q9Y5X3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX5Q9Y5X3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX5Q9Y5X3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX5Q9Y5X3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX5Q9Y5X3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX5Q9Y5X3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX5Q9Y5X3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX5Q9Y5X3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX5Q9Y5X3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX5Q9Y5X3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX5Q9Y5X3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX5Q9Y5X3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX5Q9Y5X3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX5Q9Y5X3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX5Q9Y5X3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX5Q9Y5X3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX5Q9Y5X3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX5Q9Y5X3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX5Q9Y5X3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX5Q9Y5X3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX5Q9Y5X3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX5Q9Y5X3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SNX5Q9Y5X3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SNX5Q9Y5X3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX5Q9Y5X3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX5Q9Y5X3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX5Q9Y5X3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX5Q9Y5X3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX5Q9Y5X3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX5Q9Y5X3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX5Q9Y5X3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX5Q9Y5X3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX5Q9Y5X3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX5Q9Y5X3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX5Q9Y5X3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX5Q9Y5X3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX5Q9Y5X3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX5Q9Y5X3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX5Q9Y5X3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX5Q9Y5X3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX5Q9Y5X3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX5Q9Y5X3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX5Q9Y5X3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX5Q9Y5X3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX5Q9Y5X3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX5Q9Y5X3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX5Q9Y5X3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX5Q9Y5X3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX5Q9Y5X3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX5Q9Y5X3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX5Q9Y5X3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX5Q9Y5X3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX5Q9Y5X3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX5Q9Y5X3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX5Q9Y5X3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX5Q9Y5X3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX5Q9Y5X3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX5Q9Y5X3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX5Q9Y5X3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX5Q9Y5X3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX5Q9Y5X3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX5Q9Y5X3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX5Q9Y5X3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX5Q9Y5X3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX5Q9Y5X3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX5Q9Y5X3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX5Q9Y5X3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX5Q9Y5X3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX5Q9Y5X3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX5Q9Y5X3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX5Q9Y5X3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX5Q9Y5X3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX5Q9Y5X3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX5Q9Y5X3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX5Q9Y5X3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX5Q9Y5X3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX5Q9Y5X3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX5Q9Y5X3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms