Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G1

PCDHGB3, Protocadherin gamma-B3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB3Q9Y5G1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCDHGB3Q9Y5G1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PCDHGB3Q9Y5G1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PCDHGB3Q9Y5G1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PCDHGB3Q9Y5G1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PCDHGB3Q9Y5G1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PCDHGB3Q9Y5G1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PCDHGB3Q9Y5G1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PCDHGB3Q9Y5G1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PCDHGB3Q9Y5G1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PCDHGB3Q9Y5G1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PCDHGB3Q9Y5G1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCDHGB3Q9Y5G1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PCDHGB3Q9Y5G1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDHGB3Q9Y5G1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCDHGB3Q9Y5G1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCDHGB3Q9Y5G1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCDHGB3Q9Y5G1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCDHGB3Q9Y5G1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCDHGB3Q9Y5G1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PCDHGB3Q9Y5G1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCDHGB3Q9Y5G1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDHGB3Q9Y5G1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCDHGB3Q9Y5G1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDHGB3Q9Y5G1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDHGB3Q9Y5G1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHGB3Q9Y5G1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHGB3Q9Y5G1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHGB3Q9Y5G1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHGB3Q9Y5G1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHGB3Q9Y5G1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHGB3Q9Y5G1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHGB3Q9Y5G1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDHGB3Q9Y5G1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDHGB3Q9Y5G1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHGB3Q9Y5G1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHGB3Q9Y5G1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHGB3Q9Y5G1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHGB3Q9Y5G1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHGB3Q9Y5G1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHGB3Q9Y5G1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHGB3Q9Y5G1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHGB3Q9Y5G1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHGB3Q9Y5G1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHGB3Q9Y5G1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHGB3Q9Y5G1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHGB3Q9Y5G1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHGB3Q9Y5G1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHGB3Q9Y5G1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHGB3Q9Y5G1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHGB3Q9Y5G1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHGB3Q9Y5G1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHGB3Q9Y5G1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHGB3Q9Y5G1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHGB3Q9Y5G1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHGB3Q9Y5G1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHGB3Q9Y5G1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHGB3Q9Y5G1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHGB3Q9Y5G1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHGB3Q9Y5G1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHGB3Q9Y5G1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHGB3Q9Y5G1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHGB3Q9Y5G1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHGB3Q9Y5G1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHGB3Q9Y5G1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHGB3Q9Y5G1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHGB3Q9Y5G1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHGB3Q9Y5G1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHGB3Q9Y5G1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHGB3Q9Y5G1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHGB3Q9Y5G1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHGB3Q9Y5G1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHGB3Q9Y5G1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHGB3Q9Y5G1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHGB3Q9Y5G1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCDHGB3Q9Y5G1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHGB3Q9Y5G1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHGB3Q9Y5G1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHGB3Q9Y5G1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHGB3Q9Y5G1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHGB3Q9Y5G1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHGB3Q9Y5G1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHGB3Q9Y5G1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHGB3Q9Y5G1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHGB3Q9Y5G1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHGB3Q9Y5G1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHGB3Q9Y5G1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHGB3Q9Y5G1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHGB3Q9Y5G1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHGB3Q9Y5G1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHGB3Q9Y5G1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHGB3Q9Y5G1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHGB3Q9Y5G1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHGB3Q9Y5G1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHGB3Q9Y5G1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHGB3Q9Y5G1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHGB3Q9Y5G1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHGB3Q9Y5G1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms