Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5C1

ANGPTL3, Angiopoietin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANGPTL3Q9Y5C1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ANGPTL3Q9Y5C1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ANGPTL3Q9Y5C1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ANGPTL3Q9Y5C1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
ANGPTL3Q9Y5C1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ANGPTL3Q9Y5C1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ANGPTL3Q9Y5C1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ANGPTL3Q9Y5C1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ANGPTL3Q9Y5C1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ANGPTL3Q9Y5C1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ANGPTL3Q9Y5C1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ANGPTL3Q9Y5C1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ANGPTL3Q9Y5C1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ANGPTL3Q9Y5C1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ANGPTL3Q9Y5C1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ANGPTL3Q9Y5C1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ANGPTL3Q9Y5C1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ANGPTL3Q9Y5C1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ANGPTL3Q9Y5C1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ANGPTL3Q9Y5C1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ANGPTL3Q9Y5C1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ANGPTL3Q9Y5C1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ANGPTL3Q9Y5C1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ANGPTL3Q9Y5C1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ANGPTL3Q9Y5C1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ANGPTL3Q9Y5C1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ANGPTL3Q9Y5C1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ANGPTL3Q9Y5C1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ANGPTL3Q9Y5C1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ANGPTL3Q9Y5C1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ANGPTL3Q9Y5C1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ANGPTL3Q9Y5C1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ANGPTL3Q9Y5C1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ANGPTL3Q9Y5C1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ANGPTL3Q9Y5C1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ANGPTL3Q9Y5C1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ANGPTL3Q9Y5C1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ANGPTL3Q9Y5C1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ANGPTL3Q9Y5C1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ANGPTL3Q9Y5C1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ANGPTL3Q9Y5C1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ANGPTL3Q9Y5C1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ANGPTL3Q9Y5C1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ANGPTL3Q9Y5C1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ANGPTL3Q9Y5C1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ANGPTL3Q9Y5C1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ANGPTL3Q9Y5C1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ANGPTL3Q9Y5C1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ANGPTL3Q9Y5C1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ANGPTL3Q9Y5C1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ANGPTL3Q9Y5C1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ANGPTL3Q9Y5C1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ANGPTL3Q9Y5C1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ANGPTL3Q9Y5C1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ANGPTL3Q9Y5C1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ANGPTL3Q9Y5C1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ANGPTL3Q9Y5C1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ANGPTL3Q9Y5C1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ANGPTL3Q9Y5C1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ANGPTL3Q9Y5C1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ANGPTL3Q9Y5C1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ANGPTL3Q9Y5C1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ANGPTL3Q9Y5C1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ANGPTL3Q9Y5C1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANGPTL3Q9Y5C1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANGPTL3Q9Y5C1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANGPTL3Q9Y5C1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANGPTL3Q9Y5C1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ANGPTL3Q9Y5C1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANGPTL3Q9Y5C1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ANGPTL3Q9Y5C1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANGPTL3Q9Y5C1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ANGPTL3Q9Y5C1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ANGPTL3Q9Y5C1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ANGPTL3Q9Y5C1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ANGPTL3Q9Y5C1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANGPTL3Q9Y5C1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANGPTL3Q9Y5C1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ANGPTL3Q9Y5C1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANGPTL3Q9Y5C1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANGPTL3Q9Y5C1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANGPTL3Q9Y5C1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ANGPTL3Q9Y5C1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANGPTL3Q9Y5C1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANGPTL3Q9Y5C1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ANGPTL3Q9Y5C1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ANGPTL3Q9Y5C1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ANGPTL3Q9Y5C1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANGPTL3Q9Y5C1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANGPTL3Q9Y5C1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANGPTL3Q9Y5C1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANGPTL3Q9Y5C1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ANGPTL3Q9Y5C1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ANGPTL3Q9Y5C1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANGPTL3Q9Y5C1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ANGPTL3Q9Y5C1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ANGPTL3Q9Y5C1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms