Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC48.94■■■■■ 5.43
TRAK1Q9UPV9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC47.91■■■■■ 5.26
TRAK1Q9UPV9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
TRAK1Q9UPV9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
TRAK1Q9UPV9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
TRAK1Q9UPV9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.22■■■■■ 5.15
TRAK1Q9UPV9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.19■■■■■ 5.14
TRAK1Q9UPV9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.98■■■■■ 5.11
TRAK1Q9UPV9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46■■■■■ 4.95
TRAK1Q9UPV9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
TRAK1Q9UPV9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
TRAK1Q9UPV9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC45.7■■■■■ 4.91
TRAK1Q9UPV9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC45.69■■■■■ 4.9
TRAK1Q9UPV9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
TRAK1Q9UPV9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
TRAK1Q9UPV9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
TRAK1Q9UPV9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
TRAK1Q9UPV9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
TRAK1Q9UPV9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
TRAK1Q9UPV9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
TRAK1Q9UPV9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
TRAK1Q9UPV9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
TRAK1Q9UPV9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
TRAK1Q9UPV9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
TRAK1Q9UPV9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
TRAK1Q9UPV9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
TRAK1Q9UPV9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
TRAK1Q9UPV9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
TRAK1Q9UPV9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
TRAK1Q9UPV9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
TRAK1Q9UPV9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TRAK1Q9UPV9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
TRAK1Q9UPV9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
TRAK1Q9UPV9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
TRAK1Q9UPV9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
TRAK1Q9UPV9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
TRAK1Q9UPV9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
TRAK1Q9UPV9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TRAK1Q9UPV9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
TRAK1Q9UPV9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
TRAK1Q9UPV9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
TRAK1Q9UPV9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
TRAK1Q9UPV9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
TRAK1Q9UPV9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
TRAK1Q9UPV9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
TRAK1Q9UPV9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
TRAK1Q9UPV9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
TRAK1Q9UPV9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TRAK1Q9UPV9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
TRAK1Q9UPV9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
TRAK1Q9UPV9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
TRAK1Q9UPV9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
TRAK1Q9UPV9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
TRAK1Q9UPV9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
TRAK1Q9UPV9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
TRAK1Q9UPV9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
TRAK1Q9UPV9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
TRAK1Q9UPV9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.37
TRAK1Q9UPV9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
TRAK1Q9UPV9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
TRAK1Q9UPV9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
TRAK1Q9UPV9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TRAK1Q9UPV9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
TRAK1Q9UPV9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
TRAK1Q9UPV9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
TRAK1Q9UPV9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
TRAK1Q9UPV9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
TRAK1Q9UPV9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
TRAK1Q9UPV9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
TRAK1Q9UPV9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.1■■■■■ 4.33
TRAK1Q9UPV9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TRAK1Q9UPV9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
TRAK1Q9UPV9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
TRAK1Q9UPV9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TRAK1Q9UPV9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
TRAK1Q9UPV9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
TRAK1Q9UPV9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
TRAK1Q9UPV9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TRAK1Q9UPV9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
TRAK1Q9UPV9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
TRAK1Q9UPV9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
TRAK1Q9UPV9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TRAK1Q9UPV9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TRAK1Q9UPV9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
TRAK1Q9UPV9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
TRAK1Q9UPV9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
TRAK1Q9UPV9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
TRAK1Q9UPV9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
TRAK1Q9UPV9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
TRAK1Q9UPV9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
TRAK1Q9UPV9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
TRAK1Q9UPV9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
TRAK1Q9UPV9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
TRAK1Q9UPV9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
TRAK1Q9UPV9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
TRAK1Q9UPV9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TRAK1Q9UPV9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
TRAK1Q9UPV9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
TRAK1Q9UPV9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
TRAK1Q9UPV9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms