Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PCDHA4Q9UN74 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PCDHA4Q9UN74 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
PCDHA4Q9UN74 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PCDHA4Q9UN74 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PCDHA4Q9UN74 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PCDHA4Q9UN74 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PCDHA4Q9UN74 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PCDHA4Q9UN74 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PCDHA4Q9UN74 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PCDHA4Q9UN74 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PCDHA4Q9UN74 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PCDHA4Q9UN74 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PCDHA4Q9UN74 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PCDHA4Q9UN74 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PCDHA4Q9UN74 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PCDHA4Q9UN74 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCDHA4Q9UN74 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCDHA4Q9UN74 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCDHA4Q9UN74 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PCDHA4Q9UN74 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PCDHA4Q9UN74 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PCDHA4Q9UN74 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PCDHA4Q9UN74 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PCDHA4Q9UN74 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PCDHA4Q9UN74 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PCDHA4Q9UN74 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PCDHA4Q9UN74 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PCDHA4Q9UN74 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PCDHA4Q9UN74 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PCDHA4Q9UN74 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PCDHA4Q9UN74 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PCDHA4Q9UN74 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCDHA4Q9UN74 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PCDHA4Q9UN74 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PCDHA4Q9UN74 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PCDHA4Q9UN74 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PCDHA4Q9UN74 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PCDHA4Q9UN74 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PCDHA4Q9UN74 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PCDHA4Q9UN74 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PCDHA4Q9UN74 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PCDHA4Q9UN74 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PCDHA4Q9UN74 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PCDHA4Q9UN74 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PCDHA4Q9UN74 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PCDHA4Q9UN74 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PCDHA4Q9UN74 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PCDHA4Q9UN74 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PCDHA4Q9UN74 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PCDHA4Q9UN74 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PCDHA4Q9UN74 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PCDHA4Q9UN74 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PCDHA4Q9UN74 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PCDHA4Q9UN74 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PCDHA4Q9UN74 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCDHA4Q9UN74 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCDHA4Q9UN74 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PCDHA4Q9UN74 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PCDHA4Q9UN74 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PCDHA4Q9UN74 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PCDHA4Q9UN74 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PCDHA4Q9UN74 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PCDHA4Q9UN74 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PCDHA4Q9UN74 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PCDHA4Q9UN74 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCDHA4Q9UN74 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCDHA4Q9UN74 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCDHA4Q9UN74 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCDHA4Q9UN74 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCDHA4Q9UN74 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCDHA4Q9UN74 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCDHA4Q9UN74 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCDHA4Q9UN74 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCDHA4Q9UN74 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PCDHA4Q9UN74 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PCDHA4Q9UN74 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PCDHA4Q9UN74 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PCDHA4Q9UN74 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PCDHA4Q9UN74 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PCDHA4Q9UN74 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCDHA4Q9UN74 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCDHA4Q9UN74 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PCDHA4Q9UN74 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCDHA4Q9UN74 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PCDHA4Q9UN74 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PCDHA4Q9UN74 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PCDHA4Q9UN74 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PCDHA4Q9UN74 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PCDHA4Q9UN74 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCDHA4Q9UN74 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCDHA4Q9UN74 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCDHA4Q9UN74 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCDHA4Q9UN74 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCDHA4Q9UN74 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PCDHA4Q9UN74 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PCDHA4Q9UN74 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PCDHA4Q9UN74 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PCDHA4Q9UN74 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PCDHA4Q9UN74 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms