Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM82

SPATA2, Spermatogenesis-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA2Q9UM82 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SPATA2Q9UM82 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPATA2Q9UM82 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPATA2Q9UM82 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPATA2Q9UM82 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA2Q9UM82 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPATA2Q9UM82 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPATA2Q9UM82 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPATA2Q9UM82 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPATA2Q9UM82 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPATA2Q9UM82 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA2Q9UM82 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPATA2Q9UM82 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPATA2Q9UM82 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPATA2Q9UM82 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPATA2Q9UM82 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPATA2Q9UM82 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPATA2Q9UM82 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPATA2Q9UM82 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPATA2Q9UM82 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPATA2Q9UM82 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA2Q9UM82 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPATA2Q9UM82 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPATA2Q9UM82 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPATA2Q9UM82 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPATA2Q9UM82 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPATA2Q9UM82 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA2Q9UM82 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPATA2Q9UM82 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPATA2Q9UM82 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPATA2Q9UM82 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPATA2Q9UM82 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPATA2Q9UM82 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPATA2Q9UM82 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPATA2Q9UM82 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPATA2Q9UM82 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA2Q9UM82 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA2Q9UM82 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA2Q9UM82 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPATA2Q9UM82 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPATA2Q9UM82 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA2Q9UM82 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA2Q9UM82 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA2Q9UM82 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPATA2Q9UM82 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPATA2Q9UM82 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPATA2Q9UM82 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA2Q9UM82 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPATA2Q9UM82 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPATA2Q9UM82 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPATA2Q9UM82 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPATA2Q9UM82 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPATA2Q9UM82 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPATA2Q9UM82 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPATA2Q9UM82 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPATA2Q9UM82 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPATA2Q9UM82 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPATA2Q9UM82 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA2Q9UM82 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA2Q9UM82 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA2Q9UM82 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA2Q9UM82 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA2Q9UM82 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA2Q9UM82 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA2Q9UM82 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA2Q9UM82 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA2Q9UM82 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA2Q9UM82 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPATA2Q9UM82 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPATA2Q9UM82 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPATA2Q9UM82 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPATA2Q9UM82 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPATA2Q9UM82 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPATA2Q9UM82 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPATA2Q9UM82 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPATA2Q9UM82 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPATA2Q9UM82 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPATA2Q9UM82 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPATA2Q9UM82 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPATA2Q9UM82 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPATA2Q9UM82 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPATA2Q9UM82 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPATA2Q9UM82 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPATA2Q9UM82 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPATA2Q9UM82 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPATA2Q9UM82 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA2Q9UM82 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA2Q9UM82 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA2Q9UM82 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA2Q9UM82 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA2Q9UM82 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA2Q9UM82 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA2Q9UM82 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA2Q9UM82 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA2Q9UM82 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA2Q9UM82 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA2Q9UM82 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA2Q9UM82 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA2Q9UM82 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA2Q9UM82 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms