Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.46■■■■■ 4.71
FANCIQ9NVI1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
FANCIQ9NVI1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.35■■■■■ 4.53
FANCIQ9NVI1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
FANCIQ9NVI1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
FANCIQ9NVI1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
FANCIQ9NVI1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
FANCIQ9NVI1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
FANCIQ9NVI1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.58■■■■■ 4.41
FANCIQ9NVI1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
FANCIQ9NVI1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.18■■■■■ 4.34
FANCIQ9NVI1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
FANCIQ9NVI1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
FANCIQ9NVI1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
FANCIQ9NVI1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
FANCIQ9NVI1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
FANCIQ9NVI1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
FANCIQ9NVI1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
FANCIQ9NVI1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
FANCIQ9NVI1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
FANCIQ9NVI1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
FANCIQ9NVI1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
FANCIQ9NVI1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
FANCIQ9NVI1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.15
FANCIQ9NVI1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
FANCIQ9NVI1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
FANCIQ9NVI1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
FANCIQ9NVI1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
FANCIQ9NVI1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
FANCIQ9NVI1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
FANCIQ9NVI1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
FANCIQ9NVI1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
FANCIQ9NVI1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
FANCIQ9NVI1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
FANCIQ9NVI1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
FANCIQ9NVI1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
FANCIQ9NVI1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
FANCIQ9NVI1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
FANCIQ9NVI1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
FANCIQ9NVI1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
FANCIQ9NVI1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
FANCIQ9NVI1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
FANCIQ9NVI1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
FANCIQ9NVI1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
FANCIQ9NVI1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
FANCIQ9NVI1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
FANCIQ9NVI1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
FANCIQ9NVI1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
FANCIQ9NVI1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
FANCIQ9NVI1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
FANCIQ9NVI1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
FANCIQ9NVI1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
FANCIQ9NVI1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
FANCIQ9NVI1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
FANCIQ9NVI1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
FANCIQ9NVI1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FANCIQ9NVI1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FANCIQ9NVI1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FANCIQ9NVI1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
FANCIQ9NVI1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
FANCIQ9NVI1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
FANCIQ9NVI1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
FANCIQ9NVI1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
FANCIQ9NVI1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
FANCIQ9NVI1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
FANCIQ9NVI1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
FANCIQ9NVI1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
FANCIQ9NVI1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
FANCIQ9NVI1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
FANCIQ9NVI1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
FANCIQ9NVI1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
FANCIQ9NVI1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
FANCIQ9NVI1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
FANCIQ9NVI1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCIQ9NVI1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
FANCIQ9NVI1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
FANCIQ9NVI1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
FANCIQ9NVI1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
FANCIQ9NVI1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
FANCIQ9NVI1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FANCIQ9NVI1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
FANCIQ9NVI1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
FANCIQ9NVI1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
FANCIQ9NVI1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
FANCIQ9NVI1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
FANCIQ9NVI1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
FANCIQ9NVI1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
FANCIQ9NVI1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
FANCIQ9NVI1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
FANCIQ9NVI1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
FANCIQ9NVI1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
FANCIQ9NVI1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
FANCIQ9NVI1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
FANCIQ9NVI1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
FANCIQ9NVI1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCIQ9NVI1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCIQ9NVI1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
FANCIQ9NVI1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCIQ9NVI1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCIQ9NVI1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms