Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG6

PDRG1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDRG1Q9NUG6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PDRG1Q9NUG6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PDRG1Q9NUG6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
PDRG1Q9NUG6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PDRG1Q9NUG6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PDRG1Q9NUG6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
PDRG1Q9NUG6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PDRG1Q9NUG6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PDRG1Q9NUG6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PDRG1Q9NUG6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PDRG1Q9NUG6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PDRG1Q9NUG6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PDRG1Q9NUG6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PDRG1Q9NUG6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PDRG1Q9NUG6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PDRG1Q9NUG6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PDRG1Q9NUG6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PDRG1Q9NUG6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PDRG1Q9NUG6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PDRG1Q9NUG6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PDRG1Q9NUG6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PDRG1Q9NUG6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDRG1Q9NUG6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PDRG1Q9NUG6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PDRG1Q9NUG6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
PDRG1Q9NUG6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PDRG1Q9NUG6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PDRG1Q9NUG6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PDRG1Q9NUG6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PDRG1Q9NUG6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PDRG1Q9NUG6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PDRG1Q9NUG6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDRG1Q9NUG6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PDRG1Q9NUG6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PDRG1Q9NUG6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PDRG1Q9NUG6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDRG1Q9NUG6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDRG1Q9NUG6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PDRG1Q9NUG6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PDRG1Q9NUG6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PDRG1Q9NUG6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PDRG1Q9NUG6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PDRG1Q9NUG6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PDRG1Q9NUG6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PDRG1Q9NUG6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PDRG1Q9NUG6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDRG1Q9NUG6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PDRG1Q9NUG6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDRG1Q9NUG6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDRG1Q9NUG6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PDRG1Q9NUG6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PDRG1Q9NUG6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDRG1Q9NUG6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDRG1Q9NUG6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PDRG1Q9NUG6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDRG1Q9NUG6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PDRG1Q9NUG6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PDRG1Q9NUG6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PDRG1Q9NUG6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PDRG1Q9NUG6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PDRG1Q9NUG6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDRG1Q9NUG6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDRG1Q9NUG6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PDRG1Q9NUG6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDRG1Q9NUG6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDRG1Q9NUG6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PDRG1Q9NUG6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PDRG1Q9NUG6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDRG1Q9NUG6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PDRG1Q9NUG6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PDRG1Q9NUG6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PDRG1Q9NUG6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PDRG1Q9NUG6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PDRG1Q9NUG6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDRG1Q9NUG6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDRG1Q9NUG6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PDRG1Q9NUG6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDRG1Q9NUG6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDRG1Q9NUG6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDRG1Q9NUG6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDRG1Q9NUG6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PDRG1Q9NUG6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDRG1Q9NUG6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDRG1Q9NUG6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDRG1Q9NUG6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PDRG1Q9NUG6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PDRG1Q9NUG6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDRG1Q9NUG6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDRG1Q9NUG6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDRG1Q9NUG6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDRG1Q9NUG6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDRG1Q9NUG6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDRG1Q9NUG6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDRG1Q9NUG6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDRG1Q9NUG6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PDRG1Q9NUG6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDRG1Q9NUG6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PDRG1Q9NUG6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PDRG1Q9NUG6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PDRG1Q9NUG6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms