Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
WDR41Q9HAD4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
WDR41Q9HAD4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
WDR41Q9HAD4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
WDR41Q9HAD4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
WDR41Q9HAD4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
WDR41Q9HAD4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
WDR41Q9HAD4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
WDR41Q9HAD4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
WDR41Q9HAD4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
WDR41Q9HAD4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
WDR41Q9HAD4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
WDR41Q9HAD4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
WDR41Q9HAD4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
WDR41Q9HAD4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
WDR41Q9HAD4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
WDR41Q9HAD4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
WDR41Q9HAD4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
WDR41Q9HAD4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
WDR41Q9HAD4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
WDR41Q9HAD4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
WDR41Q9HAD4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
WDR41Q9HAD4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
WDR41Q9HAD4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
WDR41Q9HAD4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
WDR41Q9HAD4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
WDR41Q9HAD4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
WDR41Q9HAD4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
WDR41Q9HAD4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
WDR41Q9HAD4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
WDR41Q9HAD4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
WDR41Q9HAD4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
WDR41Q9HAD4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
WDR41Q9HAD4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
WDR41Q9HAD4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
WDR41Q9HAD4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
WDR41Q9HAD4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
WDR41Q9HAD4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
WDR41Q9HAD4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
WDR41Q9HAD4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
WDR41Q9HAD4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
WDR41Q9HAD4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
WDR41Q9HAD4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
WDR41Q9HAD4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
WDR41Q9HAD4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
WDR41Q9HAD4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDR41Q9HAD4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDR41Q9HAD4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDR41Q9HAD4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDR41Q9HAD4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR41Q9HAD4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR41Q9HAD4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDR41Q9HAD4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WDR41Q9HAD4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WDR41Q9HAD4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
WDR41Q9HAD4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
WDR41Q9HAD4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WDR41Q9HAD4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WDR41Q9HAD4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
WDR41Q9HAD4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR41Q9HAD4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
WDR41Q9HAD4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
WDR41Q9HAD4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
WDR41Q9HAD4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
WDR41Q9HAD4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
WDR41Q9HAD4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR41Q9HAD4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR41Q9HAD4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR41Q9HAD4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR41Q9HAD4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
WDR41Q9HAD4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WDR41Q9HAD4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WDR41Q9HAD4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR41Q9HAD4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR41Q9HAD4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WDR41Q9HAD4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR41Q9HAD4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR41Q9HAD4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR41Q9HAD4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
WDR41Q9HAD4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR41Q9HAD4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDR41Q9HAD4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDR41Q9HAD4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR41Q9HAD4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR41Q9HAD4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR41Q9HAD4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
WDR41Q9HAD4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR41Q9HAD4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR41Q9HAD4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR41Q9HAD4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR41Q9HAD4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR41Q9HAD4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
WDR41Q9HAD4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
WDR41Q9HAD4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR41Q9HAD4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WDR41Q9HAD4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR41Q9HAD4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR41Q9HAD4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR41Q9HAD4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR41Q9HAD4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms