Protein–RNA interactions for Protein: Q9H853

TUBA4B, Putative tubulin-like protein alpha-4B, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4BQ9H853 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBA4BQ9H853 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBA4BQ9H853 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBA4BQ9H853 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBA4BQ9H853 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBA4BQ9H853 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBA4BQ9H853 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBA4BQ9H853 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA4BQ9H853 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA4BQ9H853 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA4BQ9H853 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA4BQ9H853 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBA4BQ9H853 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBA4BQ9H853 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBA4BQ9H853 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBA4BQ9H853 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBA4BQ9H853 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA4BQ9H853 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA4BQ9H853 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBA4BQ9H853 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA4BQ9H853 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA4BQ9H853 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBA4BQ9H853 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA4BQ9H853 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA4BQ9H853 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA4BQ9H853 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA4BQ9H853 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA4BQ9H853 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA4BQ9H853 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA4BQ9H853 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA4BQ9H853 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBA4BQ9H853 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBA4BQ9H853 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA4BQ9H853 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA4BQ9H853 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA4BQ9H853 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA4BQ9H853 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA4BQ9H853 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA4BQ9H853 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA4BQ9H853 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA4BQ9H853 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA4BQ9H853 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA4BQ9H853 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA4BQ9H853 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA4BQ9H853 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA4BQ9H853 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA4BQ9H853 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBA4BQ9H853 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA4BQ9H853 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA4BQ9H853 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA4BQ9H853 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA4BQ9H853 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA4BQ9H853 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA4BQ9H853 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA4BQ9H853 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA4BQ9H853 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA4BQ9H853 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA4BQ9H853 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA4BQ9H853 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA4BQ9H853 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA4BQ9H853 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA4BQ9H853 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA4BQ9H853 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA4BQ9H853 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA4BQ9H853 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBA4BQ9H853 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA4BQ9H853 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA4BQ9H853 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBA4BQ9H853 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA4BQ9H853 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA4BQ9H853 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA4BQ9H853 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA4BQ9H853 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA4BQ9H853 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA4BQ9H853 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA4BQ9H853 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA4BQ9H853 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA4BQ9H853 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA4BQ9H853 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA4BQ9H853 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA4BQ9H853 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA4BQ9H853 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA4BQ9H853 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA4BQ9H853 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA4BQ9H853 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA4BQ9H853 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TUBA4BQ9H853 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA4BQ9H853 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA4BQ9H853 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA4BQ9H853 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA4BQ9H853 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA4BQ9H853 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA4BQ9H853 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA4BQ9H853 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA4BQ9H853 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA4BQ9H853 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA4BQ9H853 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA4BQ9H853 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA4BQ9H853 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA4BQ9H853 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.5 ms