Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAB1BQ9H0U4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB1BQ9H0U4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB1BQ9H0U4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB1BQ9H0U4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB1BQ9H0U4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB1BQ9H0U4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB1BQ9H0U4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB1BQ9H0U4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAB1BQ9H0U4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB1BQ9H0U4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB1BQ9H0U4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB1BQ9H0U4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB1BQ9H0U4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB1BQ9H0U4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB1BQ9H0U4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB1BQ9H0U4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB1BQ9H0U4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB1BQ9H0U4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB1BQ9H0U4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB1BQ9H0U4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB1BQ9H0U4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB1BQ9H0U4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB1BQ9H0U4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB1BQ9H0U4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB1BQ9H0U4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB1BQ9H0U4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB1BQ9H0U4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB1BQ9H0U4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB1BQ9H0U4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB1BQ9H0U4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB1BQ9H0U4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB1BQ9H0U4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB1BQ9H0U4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB1BQ9H0U4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB1BQ9H0U4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB1BQ9H0U4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB1BQ9H0U4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB1BQ9H0U4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB1BQ9H0U4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB1BQ9H0U4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB1BQ9H0U4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB1BQ9H0U4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB1BQ9H0U4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB1BQ9H0U4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB1BQ9H0U4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB1BQ9H0U4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB1BQ9H0U4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB1BQ9H0U4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB1BQ9H0U4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB1BQ9H0U4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB1BQ9H0U4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB1BQ9H0U4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB1BQ9H0U4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB1BQ9H0U4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB1BQ9H0U4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB1BQ9H0U4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB1BQ9H0U4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB1BQ9H0U4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB1BQ9H0U4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB1BQ9H0U4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB1BQ9H0U4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB1BQ9H0U4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB1BQ9H0U4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB1BQ9H0U4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB1BQ9H0U4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB1BQ9H0U4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB1BQ9H0U4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB1BQ9H0U4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB1BQ9H0U4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB1BQ9H0U4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB1BQ9H0U4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB1BQ9H0U4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB1BQ9H0U4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB1BQ9H0U4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB1BQ9H0U4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB1BQ9H0U4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB1BQ9H0U4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB1BQ9H0U4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB1BQ9H0U4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB1BQ9H0U4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB1BQ9H0U4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB1BQ9H0U4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB1BQ9H0U4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB1BQ9H0U4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB1BQ9H0U4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB1BQ9H0U4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB1BQ9H0U4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB1BQ9H0U4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB1BQ9H0U4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB1BQ9H0U4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB1BQ9H0U4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB1BQ9H0U4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB1BQ9H0U4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB1BQ9H0U4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB1BQ9H0U4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB1BQ9H0U4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB1BQ9H0U4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB1BQ9H0U4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB1BQ9H0U4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms