Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZY4

COA1, Cytochrome c oxidase assembly factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA1Q9GZY4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.33■■■■■ 4.37
COA1Q9GZY4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
COA1Q9GZY4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
COA1Q9GZY4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
COA1Q9GZY4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
COA1Q9GZY4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
COA1Q9GZY4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
COA1Q9GZY4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
COA1Q9GZY4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
COA1Q9GZY4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
COA1Q9GZY4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
COA1Q9GZY4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
COA1Q9GZY4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
COA1Q9GZY4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
COA1Q9GZY4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
COA1Q9GZY4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
COA1Q9GZY4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
COA1Q9GZY4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
COA1Q9GZY4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
COA1Q9GZY4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
COA1Q9GZY4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
COA1Q9GZY4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
COA1Q9GZY4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
COA1Q9GZY4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
COA1Q9GZY4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
COA1Q9GZY4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
COA1Q9GZY4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
COA1Q9GZY4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
COA1Q9GZY4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
COA1Q9GZY4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
COA1Q9GZY4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
COA1Q9GZY4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
COA1Q9GZY4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
COA1Q9GZY4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
COA1Q9GZY4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
COA1Q9GZY4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
COA1Q9GZY4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
COA1Q9GZY4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
COA1Q9GZY4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
COA1Q9GZY4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
COA1Q9GZY4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
COA1Q9GZY4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
COA1Q9GZY4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
COA1Q9GZY4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
COA1Q9GZY4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
COA1Q9GZY4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
COA1Q9GZY4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
COA1Q9GZY4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
COA1Q9GZY4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
COA1Q9GZY4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
COA1Q9GZY4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
COA1Q9GZY4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
COA1Q9GZY4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
COA1Q9GZY4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
COA1Q9GZY4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
COA1Q9GZY4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
COA1Q9GZY4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
COA1Q9GZY4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
COA1Q9GZY4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
COA1Q9GZY4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
COA1Q9GZY4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
COA1Q9GZY4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
COA1Q9GZY4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
COA1Q9GZY4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
COA1Q9GZY4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
COA1Q9GZY4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
COA1Q9GZY4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
COA1Q9GZY4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
COA1Q9GZY4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
COA1Q9GZY4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
COA1Q9GZY4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
COA1Q9GZY4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
COA1Q9GZY4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
COA1Q9GZY4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
COA1Q9GZY4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
COA1Q9GZY4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
COA1Q9GZY4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
COA1Q9GZY4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
COA1Q9GZY4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
COA1Q9GZY4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
COA1Q9GZY4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
COA1Q9GZY4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
COA1Q9GZY4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
COA1Q9GZY4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
COA1Q9GZY4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
COA1Q9GZY4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
COA1Q9GZY4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
COA1Q9GZY4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
COA1Q9GZY4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
COA1Q9GZY4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
COA1Q9GZY4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
COA1Q9GZY4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
COA1Q9GZY4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
COA1Q9GZY4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
COA1Q9GZY4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
COA1Q9GZY4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
COA1Q9GZY4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
COA1Q9GZY4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
COA1Q9GZY4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
COA1Q9GZY4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms