Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD3

KXD1, KxDL motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KXD1Q9BQD3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KXD1Q9BQD3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KXD1Q9BQD3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KXD1Q9BQD3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KXD1Q9BQD3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KXD1Q9BQD3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
KXD1Q9BQD3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KXD1Q9BQD3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
KXD1Q9BQD3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KXD1Q9BQD3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KXD1Q9BQD3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KXD1Q9BQD3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KXD1Q9BQD3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KXD1Q9BQD3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KXD1Q9BQD3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KXD1Q9BQD3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
KXD1Q9BQD3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KXD1Q9BQD3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KXD1Q9BQD3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KXD1Q9BQD3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KXD1Q9BQD3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KXD1Q9BQD3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KXD1Q9BQD3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KXD1Q9BQD3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KXD1Q9BQD3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KXD1Q9BQD3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KXD1Q9BQD3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KXD1Q9BQD3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
KXD1Q9BQD3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KXD1Q9BQD3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KXD1Q9BQD3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KXD1Q9BQD3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KXD1Q9BQD3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KXD1Q9BQD3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KXD1Q9BQD3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
KXD1Q9BQD3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
KXD1Q9BQD3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
KXD1Q9BQD3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KXD1Q9BQD3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KXD1Q9BQD3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KXD1Q9BQD3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KXD1Q9BQD3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KXD1Q9BQD3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KXD1Q9BQD3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KXD1Q9BQD3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KXD1Q9BQD3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KXD1Q9BQD3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KXD1Q9BQD3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KXD1Q9BQD3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KXD1Q9BQD3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
KXD1Q9BQD3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
KXD1Q9BQD3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
KXD1Q9BQD3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KXD1Q9BQD3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KXD1Q9BQD3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
KXD1Q9BQD3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KXD1Q9BQD3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KXD1Q9BQD3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KXD1Q9BQD3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KXD1Q9BQD3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KXD1Q9BQD3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KXD1Q9BQD3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KXD1Q9BQD3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KXD1Q9BQD3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KXD1Q9BQD3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
KXD1Q9BQD3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
KXD1Q9BQD3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KXD1Q9BQD3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
KXD1Q9BQD3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KXD1Q9BQD3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KXD1Q9BQD3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KXD1Q9BQD3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KXD1Q9BQD3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KXD1Q9BQD3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KXD1Q9BQD3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KXD1Q9BQD3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KXD1Q9BQD3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KXD1Q9BQD3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KXD1Q9BQD3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KXD1Q9BQD3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KXD1Q9BQD3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
KXD1Q9BQD3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KXD1Q9BQD3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KXD1Q9BQD3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KXD1Q9BQD3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KXD1Q9BQD3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
KXD1Q9BQD3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KXD1Q9BQD3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KXD1Q9BQD3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KXD1Q9BQD3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
KXD1Q9BQD3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KXD1Q9BQD3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KXD1Q9BQD3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KXD1Q9BQD3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KXD1Q9BQD3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
KXD1Q9BQD3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KXD1Q9BQD3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KXD1Q9BQD3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KXD1Q9BQD3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KXD1Q9BQD3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms