Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PKP2Q99959 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PKP2Q99959 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PKP2Q99959 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKP2Q99959 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKP2Q99959 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKP2Q99959 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKP2Q99959 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PKP2Q99959 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PKP2Q99959 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKP2Q99959 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKP2Q99959 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKP2Q99959 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKP2Q99959 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PKP2Q99959 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PKP2Q99959 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKP2Q99959 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKP2Q99959 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKP2Q99959 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKP2Q99959 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKP2Q99959 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PKP2Q99959 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKP2Q99959 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKP2Q99959 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKP2Q99959 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKP2Q99959 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PKP2Q99959 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKP2Q99959 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKP2Q99959 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKP2Q99959 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKP2Q99959 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKP2Q99959 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PKP2Q99959 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKP2Q99959 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKP2Q99959 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKP2Q99959 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKP2Q99959 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKP2Q99959 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKP2Q99959 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKP2Q99959 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKP2Q99959 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKP2Q99959 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKP2Q99959 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKP2Q99959 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKP2Q99959 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKP2Q99959 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKP2Q99959 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKP2Q99959 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKP2Q99959 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKP2Q99959 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKP2Q99959 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKP2Q99959 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKP2Q99959 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PKP2Q99959 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKP2Q99959 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP2Q99959 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKP2Q99959 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKP2Q99959 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKP2Q99959 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKP2Q99959 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKP2Q99959 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKP2Q99959 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKP2Q99959 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKP2Q99959 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKP2Q99959 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKP2Q99959 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PKP2Q99959 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKP2Q99959 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKP2Q99959 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKP2Q99959 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKP2Q99959 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKP2Q99959 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKP2Q99959 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKP2Q99959 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKP2Q99959 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKP2Q99959 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKP2Q99959 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKP2Q99959 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKP2Q99959 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKP2Q99959 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKP2Q99959 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKP2Q99959 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKP2Q99959 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKP2Q99959 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKP2Q99959 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKP2Q99959 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PKP2Q99959 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKP2Q99959 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKP2Q99959 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKP2Q99959 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP2Q99959 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKP2Q99959 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP2Q99959 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PKP2Q99959 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PKP2Q99959 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKP2Q99959 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKP2Q99959 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKP2Q99959 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKP2Q99959 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKP2Q99959 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms